More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2150 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2150  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 		 393 aa  772    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2465  dihydroorotate dehydrogenase 2  88.78 
 
 		 393 aa  672    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.282776 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27841  dihydroorotate dehydrogenase 2  78.06 
 
 		 392 aa  589  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02171  dihydroorotate dehydrogenase 2  68.03 
 
 		 392 aa  524  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.894621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1566  dihydroorotate dehydrogenase 2  61.11 
 
 		 385 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02751  dihydroorotate dehydrogenase 2  61.38 
 
 		 385 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02281  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.23 
 
 		 389 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.698801  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02191  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.08 
 
 		 389 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02171  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.45 
 
 		 389 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0201  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.26 
 
 		 389 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.67 
 
 		 376 aa  341  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  49.2 
 
 		 377 aa  336  5e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.24 
 
 		 378 aa  323  4e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.3 
 
 		 377 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1870  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.57 
 
 		 377 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1896  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.26 
 
 		 377 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.47 
 
 		 378 aa  311  9e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  47.55 
 
 		 375 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  52.53 
 
 		 355 aa  299  4e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.69 
 
 		 356 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.69 
 
 		 356 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.69 
 
 		 356 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  47.53 
 
 		 363 aa  290  2e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.78 
 
 		 353 aa  288  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  49.13 
 
 		 360 aa  284  2.0000000000000002e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  51.78 
 
 		 396 aa  279  7e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.98 
 
 		 356 aa  278  8e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.48 
 
 		 377 aa  278  1e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.47 
 
 		 342 aa  275  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  44.1 
 
 		 339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.53 
 
 		 361 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.5 
 
 		 344 aa  273  6e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  46.26 
 
 		 361 aa  271  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  50 
 
 		 357 aa  271  1e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0799  dihydroorotate dehydrogenase  48.95 
 
 		 389 aa  271  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25100  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.16 
 
 		 354 aa  271  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  45.71 
 
 		 349 aa  270  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1958  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.99 
 
 		 356 aa  270  5e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139268 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.63 
 
 		 344 aa  269  5.9999999999999995e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.9 
 
 		 349 aa  268  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3039  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.07 
 
 		 353 aa  268  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3154  dihydroorotate dehydrogenase  51.7 
 
 		 361 aa  267  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351968  hitchhiker  0.000224626 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.33 
 
 		 357 aa  268  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  47.2 
 
 		 357 aa  261  1e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  47.54 
 
 		 340 aa  262  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.07 
 
 		 356 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2143  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.26 
 
 		 351 aa  258  1e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.26 
 
 		 351 aa  258  1e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  47.11 
 
 		 370 aa  258  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2432  dihydroorotate oxidase A  51.44 
 
 		 355 aa  258  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9004  Dihydroorotate oxidase  44.68 
 
 		 355 aa  257  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02009  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.16 
 
 		 331 aa  256  4e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0256343  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3268  Dihydroorotate oxidase  45.95 
 
 		 366 aa  256  5e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  47.51 
 
 		 377 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  46 
 
 		 336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  46.33 
 
 		 336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.5 
 
 		 343 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1857  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.85 
 
 		 338 aa  253  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  46.03 
 
 		 336 aa  253  5.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0847  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.35 
 
 		 352 aa  252  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211753  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.12 
 
 		 367 aa  251  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.09 
 
 		 345 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.57 
 
 		 348 aa  251  1e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00808  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.75 
 
 		 351 aa  251  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.353317  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2435  dihydroorotate dehydrogenase  48.55 
 
 		 375 aa  250  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  47.96 
 
 		 346 aa  250  3e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  44.34 
 
 		 356 aa  250  3e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18900  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.84 
 
 		 347 aa  250  4e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.388059  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.44 
 
 		 364 aa  249  5e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.68 
 
 		 353 aa  249  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.44 
 
 		 364 aa  249  5e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0969  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.62 
 
 		 347 aa  249  6e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1750  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.94 
 
 		 339 aa  249  6e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1077  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.62 
 
 		 347 aa  249  6e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2455  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.08 
 
 		 359 aa  249  6e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1549  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.19 
 
 		 336 aa  249  8e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.25 
 
 		 345 aa  249  8e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.77 
 
 		 364 aa  248  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  41.88 
 
 		 356 aa  247  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2507  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.39 
 
 		 353 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1080  Dihydroorotate oxidase  45.19 
 
 		 344 aa  247  3e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.106041  normal  0.333003 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2858  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.12 
 
 		 350 aa  247  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.82 
 
 		 356 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.82 
 
 		 356 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1850  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.84 
 
 		 338 aa  246  4e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1650  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.32 
 
 		 351 aa  246  4e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.58 
 
 		 339 aa  246  6e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0741  dihydroorotate oxidase  47.85 
 
 		 344 aa  246  6e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1098  dihydroorotate dehydrogenase 2  46 
 
 		 336 aa  246  6.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2132  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.99 
 
 		 351 aa  246  6.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.968408  normal  0.0597535 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.17 
 
 		 363 aa  245  8e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.52 
 
 		 340 aa  245  9e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.06 
 
 		 348 aa  245  9.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.41 
 
 		 361 aa  245  9.999999999999999e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2299  dihydroorotate oxidase  43.44 
 
 		 336 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.189088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  44.31 
 
 		 384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.85 
 
 		 349 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.14 
 
 		 363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.26 
 
 		 339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  46.5 
 
 		 348 aa  243  3e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>