More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3458 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  100 
 
 
356 aa  720    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  87.92 
 
 
356 aa  641    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.54 
 
 
360 aa  340  2e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0662  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.26 
 
 
350 aa  308  8e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.953358 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.03 
 
 
350 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.14 
 
 
348 aa  294  2e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  47.06 
 
 
367 aa  293  3e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  44.54 
 
 
356 aa  292  7e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  45.67 
 
 
339 aa  290  3e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0627  dihydroorotate dehydrogenase  45.14 
 
 
364 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  45.48 
 
 
361 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  42.25 
 
 
363 aa  283  3.0000000000000004e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.86 
 
 
344 aa  282  5.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.38 
 
 
343 aa  281  9e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  41.31 
 
 
355 aa  281  1e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.2 
 
 
344 aa  280  3e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.39 
 
 
376 aa  280  4e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.49 
 
 
361 aa  280  4e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.01 
 
 
378 aa  278  8e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.29 
 
 
340 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  41.55 
 
 
377 aa  274  2.0000000000000002e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  45.16 
 
 
349 aa  273  3e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  42.62 
 
 
360 aa  272  7e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  44.97 
 
 
348 aa  271  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0847  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.02 
 
 
352 aa  271  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211753  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.66 
 
 
367 aa  269  5e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.23 
 
 
361 aa  269  5e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.35 
 
 
352 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  43.49 
 
 
357 aa  267  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.63 
 
 
357 aa  268  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0786  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.91 
 
 
352 aa  266  4e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.42 
 
 
349 aa  266  5.999999999999999e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.77 
 
 
348 aa  265  1e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0118  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.94 
 
 
357 aa  265  1e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.469691  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.41 
 
 
363 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  44.38 
 
 
370 aa  262  6e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1224  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.7 
 
 
352 aa  262  6.999999999999999e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.234745  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.46 
 
 
356 aa  262  8e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.58 
 
 
377 aa  262  8e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.46 
 
 
356 aa  262  8e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.46 
 
 
356 aa  262  8e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  39.67 
 
 
375 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  45.2 
 
 
374 aa  261  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1056  dihydroorotate dehydrogenase  39.38 
 
 
355 aa  261  1e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1239  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.46 
 
 
355 aa  261  2e-68  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1750  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.9 
 
 
339 aa  260  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2299  dihydroorotate oxidase  40.71 
 
 
336 aa  260  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.189088  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0825  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.83 
 
 
352 aa  260  3e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.454847  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0895  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.83 
 
 
352 aa  260  3e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.934158  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.27 
 
 
342 aa  259  4e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.63 
 
 
353 aa  259  4e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  42.55 
 
 
384 aa  258  8e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.9 
 
 
364 aa  258  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.95 
 
 
355 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  44.35 
 
 
361 aa  257  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  43.58 
 
 
346 aa  257  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.02 
 
 
356 aa  256  3e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.25 
 
 
356 aa  256  3e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0934  dihydroorotate dehydrogenase 2  40 
 
 
344 aa  256  4e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  40.76 
 
 
336 aa  256  5e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1206  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.55 
 
 
352 aa  256  5e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.64 
 
 
377 aa  256  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00808  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.02 
 
 
351 aa  256  6e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.353317  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1140  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.29 
 
 
357 aa  255  7e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.336473  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.35 
 
 
337 aa  255  9e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25100  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.86 
 
 
354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0788  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.85 
 
 
364 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  44.01 
 
 
352 aa  255  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0409  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.06 
 
 
336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.845411  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  41.98 
 
 
336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  44.97 
 
 
396 aa  253  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  42 
 
 
363 aa  253  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  42.77 
 
 
340 aa  253  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0793  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.66 
 
 
364 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.01088 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  43.48 
 
 
377 aa  252  6e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.84 
 
 
354 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4622  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.5 
 
 
364 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2644  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.12 
 
 
336 aa  252  9.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2555  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.12 
 
 
336 aa  252  9.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.982288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1984  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.12 
 
 
336 aa  252  9.000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.21 
 
 
364 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1566  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.1 
 
 
385 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.99 
 
 
378 aa  251  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1958  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.48 
 
 
356 aa  250  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139268 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1740  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.48 
 
 
336 aa  249  4e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0560923  normal  0.0257615 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.65 
 
 
339 aa  249  4e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1294  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.96 
 
 
364 aa  249  5e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.94 
 
 
357 aa  249  6e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.82 
 
 
340 aa  249  7e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0628  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.29 
 
 
352 aa  248  8e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0957  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.54 
 
 
354 aa  248  9e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0755  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.79 
 
 
364 aa  248  9e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0179  dihydroorotate dehydrogenase  41.9 
 
 
348 aa  248  1e-64  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.62 
 
 
351 aa  248  1e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0547  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.33 
 
 
358 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0799  dihydroorotate dehydrogenase  43.72 
 
 
389 aa  248  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2144  dihydroorotate dehydrogenase 2  34.37 
 
 
354 aa  248  2e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1784  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.88 
 
 
333 aa  247  2e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.4 
 
 
336 aa  247  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02751  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.1 
 
 
385 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>