More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1784 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1784  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 
333 aa  681    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1785  dihydroorotate dehydrogenase 2  98.2 
 
 
333 aa  672    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1549  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.73 
 
 
336 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1213  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.96 
 
 
358 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  53.43 
 
 
336 aa  368  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1317  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.24 
 
 
344 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1077  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.94 
 
 
347 aa  363  3e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0969  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.94 
 
 
347 aa  363  3e-99  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.84 
 
 
344 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0934  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.57 
 
 
344 aa  362  6e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.13 
 
 
337 aa  360  2e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.54 
 
 
353 aa  360  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1646  dihydroorotate dehydrogenase  52.25 
 
 
335 aa  359  3e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.353277  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  53.13 
 
 
377 aa  359  3e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1098  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.13 
 
 
336 aa  358  5e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.94 
 
 
336 aa  358  5e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2507  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.84 
 
 
353 aa  358  6e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0645  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.33 
 
 
337 aa  358  8e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  51.94 
 
 
336 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.54 
 
 
345 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1600  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.18 
 
 
365 aa  355  7.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.306495 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.33 
 
 
349 aa  355  7.999999999999999e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1284  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.59 
 
 
344 aa  354  1e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.718117  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.84 
 
 
356 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1101  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.29 
 
 
344 aa  353  2e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.84 
 
 
356 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1928  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.18 
 
 
365 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0930584  normal  0.0310876 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1619  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.89 
 
 
344 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0409  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.34 
 
 
336 aa  353  2.9999999999999997e-96  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.845411  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1613  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.48 
 
 
341 aa  352  5e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000426002 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2003  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.43 
 
 
335 aa  352  5e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557118  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1342  dihydroorotate oxidase A  52.08 
 
 
371 aa  352  7e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.24 
 
 
345 aa  352  8e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2061  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.05 
 
 
336 aa  351  8.999999999999999e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1740  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.11 
 
 
336 aa  350  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0560923  normal  0.0257615 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1677  dihydroorotate dehydrogenase  52.55 
 
 
335 aa  350  2e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2555  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.11 
 
 
336 aa  350  3e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.982288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1984  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.11 
 
 
336 aa  350  3e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2644  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.11 
 
 
336 aa  350  3e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178452  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1788  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.75 
 
 
336 aa  348  5e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0427694  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.34 
 
 
339 aa  347  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2174  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.2 
 
 
336 aa  347  1e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000792039  normal  0.661729 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2593  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.82 
 
 
335 aa  347  2e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144879  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18900  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.07 
 
 
347 aa  347  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.388059  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1809  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.13 
 
 
342 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.505366  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0768  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.84 
 
 
345 aa  345  5e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0837713  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1253  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.84 
 
 
345 aa  345  5e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1978  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.84 
 
 
345 aa  345  5e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0394  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.84 
 
 
345 aa  345  5e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350718  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2299  dihydroorotate oxidase  49.25 
 
 
336 aa  345  5e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.189088  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1736  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.84 
 
 
345 aa  345  5e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.575545  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1825  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.84 
 
 
342 aa  345  6e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.833484  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00949  dihydroorotate dehydrogenase  50.9 
 
 
336 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000020271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2698  Dihydroorotate oxidase  50.9 
 
 
336 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157783  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1060  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.9 
 
 
336 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116654  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2651  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.9 
 
 
336 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000533982  hitchhiker  0.00158114 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00956  hypothetical protein  50.9 
 
 
336 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000162497  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1109  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.9 
 
 
336 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000226851  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2372  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.9 
 
 
336 aa  345  8.999999999999999e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000164605  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1054  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.9 
 
 
336 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000778438  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1074  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.13 
 
 
356 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1554  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.13 
 
 
356 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.59 
 
 
343 aa  342  4e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.02785  decreased coverage  0.00223675 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1457  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.3 
 
 
336 aa  342  4e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0360083  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1164  dihydroorotate oxidase A  51.78 
 
 
347 aa  342  5e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  51.04 
 
 
346 aa  342  5e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3011  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.59 
 
 
340 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000990874 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2095  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.59 
 
 
340 aa  342  8e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0895487 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1167  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.9 
 
 
336 aa  340  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0101504  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4696  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.54 
 
 
356 aa  340  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226545  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1120  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.9 
 
 
336 aa  340  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00333644  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1016  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.9 
 
 
336 aa  340  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845277  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1099  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.9 
 
 
336 aa  340  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000085324  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1133  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.9 
 
 
336 aa  340  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000040512  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1606  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.59 
 
 
341 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.806586  normal  0.155671 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24640  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.89 
 
 
342 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1463  dihydroorotate oxidase  50 
 
 
340 aa  340  2.9999999999999998e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0318461 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2309  dihydroorotate dehydrogenase  50.59 
 
 
343 aa  338  5e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3645  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.59 
 
 
369 aa  339  5e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2087  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.59 
 
 
342 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1750  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.06 
 
 
339 aa  335  7e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00808  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.49 
 
 
351 aa  335  7.999999999999999e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.353317  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.74 
 
 
351 aa  332  4e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1530  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.4 
 
 
330 aa  332  4e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.95205 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.16 
 
 
339 aa  332  5e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  48.96 
 
 
340 aa  331  9e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2143  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.45 
 
 
351 aa  331  1e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1724  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.98 
 
 
351 aa  328  8e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.59 
 
 
339 aa  328  8e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.59 
 
 
339 aa  328  8e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.59 
 
 
339 aa  328  8e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.49 
 
 
348 aa  328  1.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2592  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.59 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.89 
 
 
339 aa  326  3e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2141  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.8 
 
 
340 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1593  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.77 
 
 
339 aa  325  9e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000395197  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1810  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.49 
 
 
341 aa  325  9e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000129041  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02009  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.34 
 
 
331 aa  324  1e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0256343  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2220  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.22 
 
 
339 aa  323  3e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2455  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.29 
 
 
359 aa  323  3e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17369  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>