More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0895 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0895  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 
352 aa  705    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.934158  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0825  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 
352 aa  705    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.454847  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1206  dihydroorotate dehydrogenase 2  98.3 
 
 
352 aa  696    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0628  dihydroorotate dehydrogenase 2  69.03 
 
 
352 aa  519  1e-146  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0118  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.39 
 
 
357 aa  424  1e-118  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.469691  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1140  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.26 
 
 
357 aa  414  9.999999999999999e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.336473  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0786  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.95 
 
 
352 aa  413  1e-114  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0581  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.84 
 
 
351 aa  388  1e-106  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1056  dihydroorotate dehydrogenase  52.42 
 
 
355 aa  385  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1224  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.71 
 
 
352 aa  382  1e-105  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.234745  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.33 
 
 
361 aa  281  2e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  45.2 
 
 
356 aa  276  5e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  40.96 
 
 
356 aa  270  2e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.73 
 
 
363 aa  266  5e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  44.02 
 
 
339 aa  265  1e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  39.83 
 
 
356 aa  260  3e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.85 
 
 
360 aa  259  4e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  38.55 
 
 
367 aa  256  5e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.78 
 
 
377 aa  255  7e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  40.23 
 
 
363 aa  254  1.0000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  40 
 
 
367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  38.98 
 
 
361 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  40.17 
 
 
363 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  40.17 
 
 
363 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  39.17 
 
 
357 aa  252  6e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.98 
 
 
361 aa  252  6e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.32 
 
 
344 aa  252  8.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.59 
 
 
356 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.59 
 
 
356 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.59 
 
 
356 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  40.11 
 
 
355 aa  249  6e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  39.04 
 
 
360 aa  249  6e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.89 
 
 
349 aa  249  7e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.15 
 
 
364 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  41.93 
 
 
349 aa  247  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0662  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.28 
 
 
350 aa  247  2e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.953358 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.29 
 
 
364 aa  243  5e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  39.44 
 
 
348 aa  242  6e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.23 
 
 
343 aa  242  7e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.57 
 
 
344 aa  241  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.59 
 
 
350 aa  241  1e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02281  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.75 
 
 
389 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.698801  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  39 
 
 
356 aa  241  2e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.13 
 
 
376 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2644  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.23 
 
 
336 aa  239  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178452  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1984  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.23 
 
 
336 aa  239  4e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2555  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.23 
 
 
336 aa  239  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.982288  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.14 
 
 
353 aa  239  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1457  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.12 
 
 
336 aa  239  5.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0360083  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  42.06 
 
 
336 aa  238  8e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.86 
 
 
357 aa  239  8e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2003  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.35 
 
 
335 aa  238  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557118  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  39.06 
 
 
370 aa  237  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0934  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.76 
 
 
344 aa  237  2e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1239  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.26 
 
 
355 aa  237  3e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0865  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.56 
 
 
364 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207108  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.47 
 
 
340 aa  236  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1157  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.21 
 
 
357 aa  236  4e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  37.9 
 
 
384 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  42.22 
 
 
374 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  38.66 
 
 
361 aa  236  6e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1870  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.18 
 
 
377 aa  235  9e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1284  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.71 
 
 
344 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.718117  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  39.4 
 
 
377 aa  234  1.0000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.16 
 
 
378 aa  234  1.0000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1896  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.18 
 
 
377 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1294  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.52 
 
 
364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1101  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.43 
 
 
344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.94 
 
 
336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1740  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.64 
 
 
336 aa  233  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0560923  normal  0.0257615 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4622  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.13 
 
 
364 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2144  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.49 
 
 
354 aa  233  5e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.64 
 
 
356 aa  233  5e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.04 
 
 
348 aa  232  7.000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1788  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.53 
 
 
336 aa  232  7.000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0427694  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.11 
 
 
352 aa  232  7.000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  39.71 
 
 
377 aa  232  9e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0547  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.28 
 
 
358 aa  232  9e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  39.65 
 
 
336 aa  232  9e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1677  dihydroorotate dehydrogenase  37.98 
 
 
335 aa  231  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2061  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.53 
 
 
336 aa  231  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.22 
 
 
342 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.18 
 
 
378 aa  231  2e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0741  dihydroorotate oxidase  41.11 
 
 
344 aa  231  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0788  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.56 
 
 
364 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.77 
 
 
377 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3039  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.43 
 
 
353 aa  229  4e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02171  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.54 
 
 
389 aa  229  4e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1646  dihydroorotate dehydrogenase  37.98 
 
 
335 aa  229  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.353277  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.64 
 
 
348 aa  229  5e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1016  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.82 
 
 
336 aa  228  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845277  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0645  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.71 
 
 
337 aa  228  9e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1167  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.82 
 
 
336 aa  228  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0101504  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1120  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.82 
 
 
336 aa  228  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00333644  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1099  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.82 
 
 
336 aa  228  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000085324  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1133  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.82 
 
 
336 aa  228  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000040512  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2611  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.34 
 
 
354 aa  228  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.48 
 
 
349 aa  228  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2665  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.34 
 
 
354 aa  228  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.07 
 
 
337 aa  228  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>