More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1678 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 		 350 aa  702    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0662  dihydroorotate dehydrogenase 2  66.29 
 
 		 350 aa  456  1e-127  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.953358 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  64.1 
 
 		 360 aa  450  1e-125  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  51.69 
 
 		 356 aa  343  2e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  48.31 
 
 		 356 aa  332  4e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  47.46 
 
 		 363 aa  324  1e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  44.16 
 
 		 355 aa  309  4e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  45.63 
 
 		 356 aa  304  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.13 
 
 		 377 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  44.44 
 
 		 375 aa  294  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1870  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.54 
 
 		 377 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.84 
 
 		 376 aa  286  4e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.81 
 
 		 348 aa  286  5e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.24 
 
 		 361 aa  285  1.0000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1896  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.64 
 
 		 377 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.18 
 
 		 378 aa  283  2.0000000000000002e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.71 
 
 		 363 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  42.81 
 
 		 339 aa  281  9e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.32 
 
 		 361 aa  280  3e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  43.18 
 
 		 360 aa  280  4e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.54 
 
 		 377 aa  278  8e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.7 
 
 		 356 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.7 
 
 		 356 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.7 
 
 		 356 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.01 
 
 		 340 aa  276  5e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  43.63 
 
 		 361 aa  275  8e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.43 
 
 		 357 aa  275  9e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  40.33 
 
 		 377 aa  274  2.0000000000000002e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  43.58 
 
 		 357 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  43.27 
 
 		 349 aa  274  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  44.51 
 
 		 367 aa  272  5.000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0555  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.42 
 
 		 364 aa  272  7e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.38 
 
 		 364 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.11 
 
 		 342 aa  270  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0464  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.86 
 
 		 364 aa  268  8.999999999999999e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  42.94 
 
 		 352 aa  268  8.999999999999999e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.48 
 
 		 344 aa  268  1e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1294  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.81 
 
 		 364 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.82 
 
 		 364 aa  266  5e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.06 
 
 		 344 aa  266  5e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0865  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.98 
 
 		 364 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207108  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0799  dihydroorotate dehydrogenase  44.72 
 
 		 389 aa  265  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.03 
 
 		 356 aa  264  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0755  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.06 
 
 		 364 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0793  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.02 
 
 		 364 aa  264  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.01088 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0627  dihydroorotate dehydrogenase  42.03 
 
 		 364 aa  263  4e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0581  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.87 
 
 		 351 aa  262  6e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4622  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.06 
 
 		 364 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1056  dihydroorotate dehydrogenase  39.27 
 
 		 355 aa  261  1e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  42.98 
 
 		 361 aa  261  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  44.6 
 
 		 370 aa  261  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.82 
 
 		 367 aa  260  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3039  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.57 
 
 		 353 aa  260  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  41.83 
 
 		 363 aa  259  4e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  41.83 
 
 		 363 aa  259  4e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  44.61 
 
 		 396 aa  259  6e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.71 
 
 		 353 aa  259  6e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.34 
 
 		 378 aa  256  5e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0788  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.93 
 
 		 364 aa  256  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2144  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.59 
 
 		 354 aa  256  6e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  40.91 
 
 		 374 aa  255  9e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1457  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.65 
 
 		 336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0360083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0786  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.89 
 
 		 352 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2665  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.72 
 
 		 354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1850  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.22 
 
 		 338 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2611  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.72 
 
 		 354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0895  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.94 
 
 		 352 aa  253  3e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.934158  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0825  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.94 
 
 		 352 aa  253  3e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.454847  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0118  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.57 
 
 		 357 aa  253  4.0000000000000004e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.469691  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  41.85 
 
 		 384 aa  252  8.000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1646  dihydroorotate dehydrogenase  39.22 
 
 		 335 aa  252  9.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.353277  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1566  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.82 
 
 		 385 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25100  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.88 
 
 		 354 aa  251  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1206  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.94 
 
 		 352 aa  251  1e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1224  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.7 
 
 		 352 aa  251  1e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.234745  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.53 
 
 		 348 aa  251  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2644  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.1 
 
 		 336 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1740  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.4 
 
 		 336 aa  251  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0560923  normal  0.0257615 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2555  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.1 
 
 		 336 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.982288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1984  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.1 
 
 		 336 aa  251  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.61 
 
 		 352 aa  251  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1788  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.92 
 
 		 336 aa  250  3e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0427694  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0518  dihydroorotate dehydrogenase 2  42 
 
 		 343 aa  250  3e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.565795 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.69 
 
 		 343 aa  250  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02751  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.82 
 
 		 385 aa  249  4e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2174  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.02 
 
 		 336 aa  249  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000792039  normal  0.661729 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00949  dihydroorotate dehydrogenase  38.02 
 
 		 336 aa  249  6e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000020271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2698  Dihydroorotate oxidase  38.02 
 
 		 336 aa  249  6e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157783  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2651  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.02 
 
 		 336 aa  249  6e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000533982  hitchhiker  0.00158114 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1054  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.02 
 
 		 336 aa  249  6e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000778438  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1109  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.02 
 
 		 336 aa  249  6e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000226851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2372  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.02 
 
 		 336 aa  249  6e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000164605  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1060  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.02 
 
 		 336 aa  249  6e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116654  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00956  hypothetical protein  38.02 
 
 		 336 aa  249  6e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000162497  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.94 
 
 		 336 aa  248  9e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.43 
 
 		 357 aa  248  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2061  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.62 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1133  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.72 
 
 		 336 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000040512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3268  Dihydroorotate oxidase  45.1 
 
 		 366 aa  247  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  40.52 
 
 		 377 aa  247  2e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>