More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2860 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  100 
 
 		 361 aa  711    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  81.64 
 
 		 367 aa  572  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.18 
 
 		 343 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  51.3 
 
 		 349 aa  331  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.99 
 
 		 361 aa  326  5e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.69 
 
 		 348 aa  325  7e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  49.58 
 
 		 356 aa  317  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  47.76 
 
 		 339 aa  315  8e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.94 
 
 		 340 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.51 
 
 		 344 aa  312  4.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.98 
 
 		 361 aa  307  2.0000000000000002e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  50.28 
 
 		 363 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  50.28 
 
 		 363 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.21 
 
 		 357 aa  305  9.000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.25 
 
 		 367 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0627  dihydroorotate dehydrogenase  49.04 
 
 		 364 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  48.07 
 
 		 348 aa  299  6e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  45.1 
 
 		 363 aa  298  8e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.58 
 
 		 360 aa  298  1e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  45.35 
 
 		 355 aa  297  2e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.12 
 
 		 337 aa  297  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.31 
 
 		 356 aa  296  3e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.8 
 
 		 344 aa  296  5e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.38 
 
 		 339 aa  295  6e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.38 
 
 		 339 aa  295  6e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.51 
 
 		 339 aa  294  2e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.38 
 
 		 339 aa  294  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.9 
 
 		 349 aa  293  3e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0547  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.14 
 
 		 358 aa  293  5e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  43.73 
 
 		 336 aa  290  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.13 
 
 		 356 aa  291  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2592  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.38 
 
 		 339 aa  289  4e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  45.48 
 
 		 356 aa  289  6e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2382  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.04 
 
 		 358 aa  288  7e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  45.81 
 
 		 356 aa  288  8e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.42 
 
 		 364 aa  288  9e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.38 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.77 
 
 		 358 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121785 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.06 
 
 		 363 aa  285  9e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  49.58 
 
 		 370 aa  284  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1294  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.86 
 
 		 364 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1943  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.1 
 
 		 339 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.58 
 
 		 364 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.74 
 
 		 378 aa  283  4.0000000000000003e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2552  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.81 
 
 		 339 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2144  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.72 
 
 		 354 aa  281  1e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1912  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.81 
 
 		 339 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103041  normal  0.350428 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.69 
 
 		 352 aa  281  1e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1810  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.51 
 
 		 341 aa  280  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000129041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2611  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.83 
 
 		 354 aa  280  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2432  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.51 
 
 		 339 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160194  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2665  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.83 
 
 		 354 aa  280  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  44.64 
 
 		 340 aa  279  4e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2439  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.51 
 
 		 339 aa  279  5e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.9 
 
 		 377 aa  279  6e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.77 
 
 		 358 aa  278  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.31 
 
 		 340 aa  277  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  47.43 
 
 		 396 aa  277  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1098  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.4 
 
 		 336 aa  276  3e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2475  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.62 
 
 		 339 aa  275  8e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00234751  hitchhiker  0.00462057 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  47.34 
 
 		 374 aa  275  9e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  43.25 
 
 		 360 aa  275  1.0000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.02 
 
 		 378 aa  275  1.0000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.58 
 
 		 348 aa  274  1.0000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  44.69 
 
 		 357 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.97 
 
 		 356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  42.82 
 
 		 377 aa  274  2.0000000000000002e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2220  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.43 
 
 		 339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.97 
 
 		 356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.82 
 
 		 336 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2141  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.94 
 
 		 340 aa  273  3e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.95 
 
 		 377 aa  273  3e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.69 
 
 		 354 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1213  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.69 
 
 		 358 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1593  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.62 
 
 		 339 aa  273  3e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000395197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  42.52 
 
 		 336 aa  273  3e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2205  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.69 
 
 		 357 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.4 
 
 		 345 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2920  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.73 
 
 		 356 aa  272  6e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.818371 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1317  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.95 
 
 		 344 aa  272  7e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1935  dihydroorotate dehydrogenase 2  48 
 
 		 360 aa  272  7e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.540943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.83 
 
 		 348 aa  272  8.000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2095  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.64 
 
 		 340 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0895487 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.48 
 
 		 344 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.53 
 
 		 355 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2455  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.92 
 
 		 359 aa  271  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  46.15 
 
 		 352 aa  271  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1463  dihydroorotate oxidase  45.76 
 
 		 340 aa  270  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318461 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0957  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.4 
 
 		 354 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.59 
 
 		 363 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.66 
 
 		 345 aa  269  5e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0788  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.46 
 
 		 364 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4535  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.58 
 
 		 359 aa  269  5e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764504  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.64 
 
 		 353 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0934  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.11 
 
 		 344 aa  269  5.9999999999999995e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4622  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.46 
 
 		 364 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1606  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.64 
 
 		 341 aa  268  8e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.806586  normal  0.155671 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1600  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.26 
 
 		 365 aa  268  8e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.306495 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0375  Dihydroorotate oxidase  44.74 
 
 		 348 aa  268  1e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  42.32 
 
 		 375 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>