More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1876 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  100 
 
 
363 aa  722    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  69.17 
 
 
355 aa  494  9.999999999999999e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.68 
 
 
376 aa  356  2.9999999999999997e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  56.42 
 
 
352 aa  353  4e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.71 
 
 
356 aa  347  1e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  49.07 
 
 
377 aa  346  4e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  52.72 
 
 
349 aa  341  1e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.94 
 
 
342 aa  339  4e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.7 
 
 
361 aa  334  1e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.44 
 
 
377 aa  332  8e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.8 
 
 
378 aa  330  3e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.13 
 
 
344 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.86 
 
 
378 aa  328  1.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  54.26 
 
 
375 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.26 
 
 
340 aa  325  6e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  50.14 
 
 
360 aa  323  2e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  47.67 
 
 
339 aa  321  9.999999999999999e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.44 
 
 
360 aa  318  1e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1870  dihydroorotate dehydrogenase 2  50 
 
 
377 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.53 
 
 
348 aa  316  5e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1896  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.7 
 
 
377 aa  315  9e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  50.87 
 
 
396 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25100  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.71 
 
 
354 aa  311  1e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.8 
 
 
344 aa  310  2e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.51 
 
 
343 aa  311  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3154  dihydroorotate dehydrogenase  49.72 
 
 
361 aa  310  2.9999999999999997e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351968  hitchhiker  0.000224626 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1850  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.76 
 
 
338 aa  308  8e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.89 
 
 
356 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.89 
 
 
356 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.89 
 
 
356 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.65 
 
 
353 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1857  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.76 
 
 
338 aa  305  6e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4274  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.11 
 
 
355 aa  305  8.000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.637191  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.33 
 
 
357 aa  300  3e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.75 
 
 
361 aa  299  4e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.81 
 
 
377 aa  298  8e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2205  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.26 
 
 
357 aa  298  9e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  50.97 
 
 
370 aa  298  1e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12260  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.29 
 
 
375 aa  298  1e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.66 
 
 
348 aa  296  4e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.13 
 
 
363 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2432  dihydroorotate oxidase A  51.59 
 
 
355 aa  295  8e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3039  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.81 
 
 
353 aa  295  9e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2435  dihydroorotate dehydrogenase  49.28 
 
 
375 aa  295  1e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  48.39 
 
 
340 aa  293  5e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.33 
 
 
350 aa  292  6e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  44.54 
 
 
361 aa  292  6e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  49.14 
 
 
361 aa  292  7e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1958  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.16 
 
 
356 aa  289  4e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139268 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.08 
 
 
340 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  45.48 
 
 
367 aa  288  8e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0799  dihydroorotate dehydrogenase  49.01 
 
 
389 aa  288  9e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1650  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.76 
 
 
351 aa  288  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2455  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.61 
 
 
359 aa  288  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17369  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3268  Dihydroorotate oxidase  50.6 
 
 
366 aa  287  2e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2132  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.76 
 
 
351 aa  287  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.968408  normal  0.0597535 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2150  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.53 
 
 
393 aa  286  2.9999999999999996e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2465  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.7 
 
 
393 aa  286  4e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.282776 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2858  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.43 
 
 
350 aa  286  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547026  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0627  dihydroorotate dehydrogenase  47.8 
 
 
364 aa  286  5e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  50.14 
 
 
363 aa  285  7e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  50.14 
 
 
363 aa  285  7e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1750  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.13 
 
 
339 aa  285  8e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2155  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.16 
 
 
358 aa  285  8e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  45.82 
 
 
336 aa  285  9e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.99 
 
 
339 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.99 
 
 
339 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2299  dihydroorotate oxidase  43.57 
 
 
336 aa  284  1.0000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.189088  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02281  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.53 
 
 
389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.698801  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.99 
 
 
339 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  42.25 
 
 
356 aa  283  3.0000000000000004e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.4 
 
 
339 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.37 
 
 
357 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2592  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.4 
 
 
339 aa  281  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1566  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.53 
 
 
385 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02751  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.8 
 
 
385 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  42.82 
 
 
356 aa  280  2e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27841  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.98 
 
 
392 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  45.11 
 
 
346 aa  280  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02171  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.85 
 
 
389 aa  279  5e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.55 
 
 
337 aa  279  5e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1943  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.99 
 
 
339 aa  279  6e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2552  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.94 
 
 
339 aa  278  7e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9004  Dihydroorotate oxidase  47.98 
 
 
355 aa  278  8e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687517  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.68 
 
 
364 aa  278  9e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1912  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.82 
 
 
339 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103041  normal  0.350428 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2432  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.82 
 
 
339 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160194  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02191  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.76 
 
 
389 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2439  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.52 
 
 
339 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.59 
 
 
356 aa  277  2e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1810  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.99 
 
 
341 aa  277  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000129041  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.54 
 
 
350 aa  277  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2087  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.49 
 
 
342 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24640  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.2 
 
 
342 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2555  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.61 
 
 
336 aa  275  7e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.982288  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2644  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.61 
 
 
336 aa  275  7e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178452  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1984  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.61 
 
 
336 aa  275  7e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1224  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.57 
 
 
352 aa  275  8e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.234745  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  48.62 
 
 
357 aa  275  8e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.43 
 
 
349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>