More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2465 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2150  dihydroorotate dehydrogenase 2  88.78 
 
 		 393 aa  672    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2465  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 		 393 aa  774    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.282776 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27841  dihydroorotate dehydrogenase 2  77.55 
 
 		 392 aa  587  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02171  dihydroorotate dehydrogenase 2  68.29 
 
 		 392 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.894621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1566  dihydroorotate dehydrogenase 2  61.11 
 
 		 385 aa  484  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02751  dihydroorotate dehydrogenase 2  61.38 
 
 		 385 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02281  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.23 
 
 		 389 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.698801  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02191  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.08 
 
 		 389 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02171  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.76 
 
 		 389 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0201  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.29 
 
 		 389 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.39 
 
 		 376 aa  341  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  49.73 
 
 		 377 aa  337  1.9999999999999998e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.58 
 
 		 378 aa  335  1e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.03 
 
 		 377 aa  327  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  54.17 
 
 		 375 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.53 
 
 		 378 aa  320  1.9999999999999998e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1870  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.89 
 
 		 377 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1896  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.89 
 
 		 377 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  51.25 
 
 		 355 aa  295  8e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  50 
 
 		 363 aa  291  1e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  50 
 
 		 356 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  50 
 
 		 356 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  50 
 
 		 356 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.78 
 
 		 353 aa  286  4e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  50.58 
 
 		 360 aa  284  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  43.8 
 
 		 339 aa  278  1e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3039  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.93 
 
 		 353 aa  278  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.3 
 
 		 356 aa  277  2e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.67 
 
 		 344 aa  275  8e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.62 
 
 		 377 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.78 
 
 		 361 aa  273  5.000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  45.36 
 
 		 349 aa  272  9e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.99 
 
 		 342 aa  271  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.63 
 
 		 357 aa  271  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0799  dihydroorotate dehydrogenase  48.69 
 
 		 389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  45.38 
 
 		 396 aa  270  4e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.48 
 
 		 344 aa  267  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25100  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.16 
 
 		 354 aa  267  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1958  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.66 
 
 		 356 aa  266  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139268 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  47.92 
 
 		 361 aa  266  5e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.32 
 
 		 349 aa  266  7e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  50 
 
 		 357 aa  264  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.64 
 
 		 351 aa  263  3e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2143  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.64 
 
 		 351 aa  263  3e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3154  dihydroorotate dehydrogenase  50.68 
 
 		 361 aa  263  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351968  hitchhiker  0.000224626 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0847  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.98 
 
 		 352 aa  258  1e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211753  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  48.17 
 
 		 340 aa  258  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.27 
 
 		 343 aa  258  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  46.51 
 
 		 336 aa  256  3e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  48.45 
 
 		 357 aa  257  3e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  46.84 
 
 		 377 aa  256  3e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2432  dihydroorotate oxidase A  46.09 
 
 		 355 aa  257  3e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3268  Dihydroorotate oxidase  50.33 
 
 		 366 aa  256  4e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  46.33 
 
 		 336 aa  256  6e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.33 
 
 		 336 aa  255  7e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  47.37 
 
 		 370 aa  253  5.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.91 
 
 		 348 aa  252  6e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.31 
 
 		 367 aa  252  7e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.85 
 
 		 340 aa  252  7e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1857  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.28 
 
 		 338 aa  252  7e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  45.92 
 
 		 352 aa  252  8.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.94 
 
 		 339 aa  251  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18900  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.84 
 
 		 347 aa  252  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.388059  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00808  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.35 
 
 		 351 aa  251  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.353317  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.71 
 
 		 364 aa  251  2e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0969  dihydroorotate dehydrogenase 2  47 
 
 		 347 aa  250  2e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.71 
 
 		 364 aa  251  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1077  dihydroorotate dehydrogenase 2  47 
 
 		 347 aa  250  2e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.52 
 
 		 356 aa  251  2e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1080  Dihydroorotate oxidase  45.19 
 
 		 344 aa  251  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.106041  normal  0.333003 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1549  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.19 
 
 		 336 aa  250  3e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0741  dihydroorotate oxidase  48.18 
 
 		 344 aa  250  3e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02009  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.82 
 
 		 331 aa  249  4e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0256343  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1750  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.94 
 
 		 339 aa  249  4e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.49 
 
 		 361 aa  249  8e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.68 
 
 		 345 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  47.28 
 
 		 346 aa  248  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.5 
 
 		 349 aa  248  1e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2858  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.98 
 
 		 350 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0211  dihydroorotate oxidase  47.96 
 
 		 342 aa  248  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.203581  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2455  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.43 
 
 		 359 aa  248  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2435  dihydroorotate dehydrogenase  48.27 
 
 		 375 aa  247  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  47.12 
 
 		 348 aa  247  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3011  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.94 
 
 		 340 aa  247  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000990874 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.91 
 
 		 364 aa  246  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1613  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.47 
 
 		 341 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000426002 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.82 
 
 		 343 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.02785  decreased coverage  0.00223675 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.6 
 
 		 339 aa  245  8e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1850  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.84 
 
 		 338 aa  245  9e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9004  Dihydroorotate oxidase  44.68 
 
 		 355 aa  245  9e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687517  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2309  dihydroorotate dehydrogenase  45.82 
 
 		 343 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2095  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.45 
 
 		 340 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0895487 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.42 
 
 		 355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0375  Dihydroorotate oxidase  46.2 
 
 		 348 aa  244  1.9999999999999999e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  44.26 
 
 		 374 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1463  dihydroorotate oxidase  47.84 
 
 		 340 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318461 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1724  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.51 
 
 		 351 aa  244  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.68 
 
 		 345 aa  243  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1961  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.34 
 
 		 354 aa  243  3e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.779789  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.75 
 
 		 348 aa  243  3.9999999999999997e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>