More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3268 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3268  Dihydroorotate oxidase  100 
 
 		 366 aa  720    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1958  dihydroorotate dehydrogenase 2  61.8 
 
 		 356 aa  401  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139268 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  63.05 
 
 		 377 aa  397  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  62.12 
 
 		 357 aa  397  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  63.36 
 
 		 361 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2432  dihydroorotate oxidase A  60.73 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0799  dihydroorotate dehydrogenase  61.29 
 
 		 389 aa  363  3e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12260  dihydroorotate dehydrogenase 2  58.15 
 
 		 375 aa  361  1e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  58.09 
 
 		 360 aa  359  4e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2406  dihydroorotate dehydrogenase  63.61 
 
 		 376 aa  357  9.999999999999999e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  58.36 
 
 		 396 aa  352  8.999999999999999e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16390  dihydroorotate oxidase A  56.9 
 
 		 367 aa  340  2e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.655147  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9004  Dihydroorotate oxidase  60.12 
 
 		 355 aa  339  5e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.02 
 
 		 353 aa  338  7e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.25 
 
 		 356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.25 
 
 		 356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.25 
 
 		 356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  58.52 
 
 		 370 aa  328  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1463  dihydroorotate dehydrogenase  52.23 
 
 		 348 aa  320  1.9999999999999998e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.85 
 
 		 357 aa  318  9e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3039  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.1 
 
 		 353 aa  318  9e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2435  dihydroorotate dehydrogenase  58.26 
 
 		 375 aa  318  1e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  45.22 
 
 		 339 aa  304  2.0000000000000002e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  47.8 
 
 		 349 aa  301  9e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  50.15 
 
 		 363 aa  300  2e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.33 
 
 		 348 aa  299  6e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  47.89 
 
 		 355 aa  297  2e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.97 
 
 		 361 aa  297  2e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2095  dihydroorotate dehydrogenase  55.9 
 
 		 354 aa  296  3e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.19 
 
 		 344 aa  293  3e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  48.18 
 
 		 352 aa  290  4e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.81 
 
 		 340 aa  288  8e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.06 
 
 		 343 aa  287  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0375  Dihydroorotate oxidase  45.51 
 
 		 348 aa  284  2.0000000000000002e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.87 
 
 		 344 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  46.29 
 
 		 356 aa  283  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  43.5 
 
 		 375 aa  282  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.87 
 
 		 363 aa  282  8.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.76 
 
 		 377 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15520  dihydroorotate oxidase A  54.55 
 
 		 342 aa  279  4e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1877  dihydroorotate dehydrogenase  53.08 
 
 		 344 aa  277  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0253382 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.54 
 
 		 378 aa  276  6e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2026  dihydroorotate dehydrogenase  50.7 
 
 		 354 aa  275  9e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.1091  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  44.13 
 
 		 377 aa  274  2.0000000000000002e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1750  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.62 
 
 		 339 aa  273  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02009  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.4 
 
 		 331 aa  273  4.0000000000000004e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0256343  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  45.65 
 
 		 340 aa  272  8.000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1566  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.82 
 
 		 385 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.55 
 
 		 349 aa  271  1e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02751  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.1 
 
 		 385 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.99 
 
 		 361 aa  270  4e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18900  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.76 
 
 		 347 aa  269  5.9999999999999995e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.388059  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0211  dihydroorotate oxidase  45.99 
 
 		 342 aa  266  4e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.203581  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  45.51 
 
 		 346 aa  266  4e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.42 
 
 		 339 aa  265  7e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.1 
 
 		 376 aa  265  7e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  41.11 
 
 		 336 aa  264  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  46.55 
 
 		 363 aa  264  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  46.55 
 
 		 363 aa  264  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.67 
 
 		 378 aa  263  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2150  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.54 
 
 		 393 aa  263  3e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2465  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.34 
 
 		 393 aa  263  3e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.282776 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.88 
 
 		 355 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  50 
 
 		 364 aa  262  6e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1224  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.21 
 
 		 352 aa  262  6.999999999999999e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.234745  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.01 
 
 		 356 aa  261  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1943  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.84 
 
 		 339 aa  261  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  47.97 
 
 		 357 aa  261  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2555  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.58 
 
 		 336 aa  259  6e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.982288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1984  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.58 
 
 		 336 aa  259  6e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2644  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.58 
 
 		 336 aa  259  6e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178452  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02281  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.5 
 
 		 389 aa  259  7e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.698801  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2174  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.23 
 
 		 336 aa  258  8e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000792039  normal  0.661729 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00949  dihydroorotate dehydrogenase  40.23 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000020271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2698  Dihydroorotate oxidase  40.23 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157783  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1054  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.23 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000778438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2651  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.23 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000533982  hitchhiker  0.00158114 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02191  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.83 
 
 		 389 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1109  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.23 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000226851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2372  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.23 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000164605  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.84 
 
 		 339 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.84 
 
 		 339 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  41.87 
 
 		 377 aa  258  1e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00956  hypothetical protein  40.23 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000162497  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.84 
 
 		 339 aa  258  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1060  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.23 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116654  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.48 
 
 		 364 aa  257  2e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2141  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.87 
 
 		 340 aa  257  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.48 
 
 		 364 aa  257  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.94 
 
 		 364 aa  257  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.28 
 
 		 362 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0786  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.62 
 
 		 352 aa  257  2e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.25 
 
 		 362 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.71 
 
 		 367 aa  256  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.85 
 
 		 364 aa  257  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2095  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.82 
 
 		 340 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0895487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.93 
 
 		 342 aa  256  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02171  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.98 
 
 		 389 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27841  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.92 
 
 		 392 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1157  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.63 
 
 		 357 aa  256  4e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>