More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1157 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1157  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 		 357 aa  694    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.9 
 
 		 357 aa  312  5.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.14 
 
 		 367 aa  310  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1961  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.77 
 
 		 354 aa  295  6e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.779789  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.86 
 
 		 349 aa  292  6e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0388  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.85 
 
 		 354 aa  291  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  46.26 
 
 		 384 aa  281  2e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  47.16 
 
 		 374 aa  278  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0793  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.45 
 
 		 364 aa  276  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.01088 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.5 
 
 		 348 aa  276  6e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.13 
 
 		 355 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0179  dihydroorotate dehydrogenase  42.45 
 
 		 348 aa  273  4.0000000000000004e-72  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  45.71 
 
 		 355 aa  273  5.000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0464  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.3 
 
 		 364 aa  272  6e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0555  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.3 
 
 		 364 aa  271  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  42.93 
 
 		 363 aa  269  4e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2920  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.44 
 
 		 356 aa  268  8e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.818371 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  46.53 
 
 		 348 aa  268  8.999999999999999e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0847  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.43 
 
 		 352 aa  267  2e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211753  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0865  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.75 
 
 		 364 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207108  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0755  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.18 
 
 		 364 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0788  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.3 
 
 		 364 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.65 
 
 		 363 aa  262  6e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.94 
 
 		 356 aa  262  8e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4622  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.03 
 
 		 364 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  43.98 
 
 		 356 aa  260  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0957  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.69 
 
 		 354 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.69 
 
 		 354 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  39.6 
 
 		 339 aa  258  9e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0786  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.81 
 
 		 352 aa  256  4e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.29 
 
 		 361 aa  256  5e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  44.13 
 
 		 349 aa  255  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  49.38 
 
 		 361 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0211  dihydroorotate oxidase  43.8 
 
 		 342 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.203581  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.2 
 
 		 348 aa  253  4.0000000000000004e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.24 
 
 		 344 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2382  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.29 
 
 		 358 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  45.4 
 
 		 396 aa  251  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.22 
 
 		 363 aa  251  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2884  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.4 
 
 		 352 aa  251  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.604119  normal  0.126993 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.92 
 
 		 364 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.35 
 
 		 360 aa  250  2e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.35 
 
 		 340 aa  250  3e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1317  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.64 
 
 		 344 aa  250  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1068  dihydroorotate oxidase  44.44 
 
 		 361 aa  250  3e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.108109 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0581  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.01 
 
 		 351 aa  249  3e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0547  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.02 
 
 		 358 aa  250  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2432  dihydroorotate oxidase A  47.69 
 
 		 355 aa  250  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1606  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.73 
 
 		 341 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.806586  normal  0.155671 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.92 
 
 		 364 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0118  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.71 
 
 		 357 aa  249  4e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.469691  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  45 
 
 		 357 aa  249  5e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.68 
 
 		 358 aa  249  5e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48900  predicted protein  39.36 
 
 		 456 aa  249  7e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3645  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.44 
 
 		 369 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.73 
 
 		 348 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.62 
 
 		 352 aa  248  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2309  dihydroorotate dehydrogenase  42.52 
 
 		 343 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.4 
 
 		 343 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.02785  decreased coverage  0.00223675 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.73 
 
 		 358 aa  247  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121785 
 
 
-
 
NC_002978  WD1239  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.31 
 
 		 355 aa  247  3e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.23 
 
 		 361 aa  246  3e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  44.03 
 
 		 375 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2095  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.15 
 
 		 340 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0895487 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0518  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.66 
 
 		 343 aa  245  6.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.565795 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1213  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.09 
 
 		 358 aa  245  8e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3268  Dihydroorotate oxidase  46.38 
 
 		 366 aa  245  9e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  42.23 
 
 		 340 aa  245  9e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  42.32 
 
 		 346 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  43.9 
 
 		 367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1140  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.99 
 
 		 357 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.336473  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18900  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.99 
 
 		 347 aa  244  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.388059  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.56 
 
 		 364 aa  243  3e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.56 
 
 		 364 aa  243  3e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  41.01 
 
 		 356 aa  243  3.9999999999999997e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0293  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.35 
 
 		 362 aa  243  5e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.35 
 
 		 339 aa  242  6e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1613  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.98 
 
 		 341 aa  242  9e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000426002 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2087  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.27 
 
 		 342 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.26 
 
 		 377 aa  241  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1224  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.8 
 
 		 352 aa  241  1e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.234745  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1294  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.22 
 
 		 364 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  43.4 
 
 		 352 aa  241  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24640  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.27 
 
 		 342 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4535  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.47 
 
 		 359 aa  241  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764504  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  45.06 
 
 		 360 aa  241  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1958  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.93 
 
 		 356 aa  241  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139268 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0825  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.05 
 
 		 352 aa  241  2e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.454847  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0895  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.05 
 
 		 352 aa  241  2e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.934158  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3011  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.35 
 
 		 340 aa  241  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000990874 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.82 
 
 		 362 aa  241  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.23 
 
 		 364 aa  240  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.07 
 
 		 357 aa  240  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1206  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.33 
 
 		 352 aa  240  2.9999999999999997e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1101  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.11 
 
 		 344 aa  239  5.999999999999999e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1463  dihydroorotate oxidase  43.19 
 
 		 340 aa  239  5.999999999999999e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318461 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  40.73 
 
 		 356 aa  239  5.999999999999999e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0799  dihydroorotate dehydrogenase  45.31 
 
 		 389 aa  239  8e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0940  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.24 
 
 		 350 aa  238  1e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.365408  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2593  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.06 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>