More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2432 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2432  dihydroorotate oxidase A  100 
 
 		 355 aa  691    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1958  dihydroorotate dehydrogenase 2  59.38 
 
 		 356 aa  375  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139268 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  58.81 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  59.32 
 
 		 377 aa  369  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12260  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.18 
 
 		 375 aa  357  1.9999999999999998e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3268  Dihydroorotate oxidase  60.73 
 
 		 366 aa  351  8.999999999999999e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0799  dihydroorotate dehydrogenase  61.19 
 
 		 389 aa  349  4e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  62.1 
 
 		 361 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2406  dihydroorotate dehydrogenase  61.62 
 
 		 376 aa  335  9e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.49 
 
 		 356 aa  328  7e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.49 
 
 		 356 aa  328  7e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.49 
 
 		 356 aa  328  7e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  55.49 
 
 		 396 aa  323  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  54.29 
 
 		 360 aa  322  6e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.16 
 
 		 353 aa  316  5e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9004  Dihydroorotate oxidase  57.18 
 
 		 355 aa  310  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3039  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.71 
 
 		 353 aa  305  7e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  56.46 
 
 		 370 aa  304  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16390  dihydroorotate oxidase A  53.55 
 
 		 367 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.655147  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2435  dihydroorotate dehydrogenase  55.49 
 
 		 375 aa  299  4e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  51.59 
 
 		 363 aa  295  7e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.35 
 
 		 357 aa  295  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2095  dihydroorotate dehydrogenase  53.61 
 
 		 354 aa  293  2e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.98 
 
 		 361 aa  288  9e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  49.71 
 
 		 355 aa  288  1e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.7 
 
 		 340 aa  281  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1463  dihydroorotate dehydrogenase  50.14 
 
 		 348 aa  280  3e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  45.43 
 
 		 339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.8 
 
 		 344 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.1 
 
 		 343 aa  272  5.000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15520  dihydroorotate oxidase A  53.09 
 
 		 342 aa  268  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  43.85 
 
 		 377 aa  268  1e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.97 
 
 		 364 aa  267  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.92 
 
 		 362 aa  267  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  46.25 
 
 		 340 aa  267  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  47.08 
 
 		 375 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  46.09 
 
 		 349 aa  265  8.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  47.71 
 
 		 352 aa  264  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.83 
 
 		 348 aa  265  1e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.53 
 
 		 377 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1785  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.87 
 
 		 333 aa  262  8e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02009  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.35 
 
 		 331 aa  261  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0256343  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.37 
 
 		 364 aa  261  1e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1877  dihydroorotate dehydrogenase  51.84 
 
 		 344 aa  261  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0253382 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.37 
 
 		 364 aa  261  1e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1784  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.99 
 
 		 333 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.75 
 
 		 376 aa  261  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.6 
 
 		 378 aa  261  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.29 
 
 		 356 aa  259  6e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  46.85 
 
 		 346 aa  259  7e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.57 
 
 		 363 aa  258  9e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.14 
 
 		 367 aa  258  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1167  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.66 
 
 		 336 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0101504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1120  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.66 
 
 		 336 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00333644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1016  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.66 
 
 		 336 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845277  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.18 
 
 		 362 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.51 
 
 		 342 aa  257  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1133  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.66 
 
 		 336 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000040512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  44.51 
 
 		 377 aa  257  2e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1099  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.66 
 
 		 336 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000085324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2174  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.66 
 
 		 336 aa  256  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000792039  normal  0.661729 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.1 
 
 		 349 aa  256  5e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1750  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.44 
 
 		 339 aa  255  7e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00949  dihydroorotate dehydrogenase  42.66 
 
 		 336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000020271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2698  Dihydroorotate oxidase  42.66 
 
 		 336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157783  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2372  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.66 
 
 		 336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000164605  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1109  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.66 
 
 		 336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000226851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2651  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.66 
 
 		 336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000533982  hitchhiker  0.00158114 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1060  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.66 
 
 		 336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116654  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1054  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.66 
 
 		 336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000778438  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00956  hypothetical protein  42.66 
 
 		 336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000162497  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2026  dihydroorotate dehydrogenase  49.04 
 
 		 354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.1091  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.42 
 
 		 363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.52 
 
 		 378 aa  252  5.000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.69 
 
 		 363 aa  252  6e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2299  dihydroorotate oxidase  40.64 
 
 		 336 aa  252  6e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.189088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25100  dihydroorotate dehydrogenase 2  50 
 
 		 354 aa  252  7e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0293  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.17 
 
 		 362 aa  251  9.000000000000001e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.29 
 
 		 362 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  41.57 
 
 		 336 aa  250  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  41.98 
 
 		 336 aa  251  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.65 
 
 		 361 aa  250  2e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1463  dihydroorotate oxidase  45.35 
 
 		 340 aa  251  2e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318461 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.67 
 
 		 344 aa  250  3e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2143  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.44 
 
 		 351 aa  249  4e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1566  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.95 
 
 		 385 aa  249  4e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02751  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.23 
 
 		 385 aa  249  4e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1457  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.74 
 
 		 336 aa  249  4e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0360083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.44 
 
 		 351 aa  249  4e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1157  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.69 
 
 		 357 aa  249  5e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1646  dihydroorotate dehydrogenase  41.81 
 
 		 335 aa  249  6e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.353277  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2555  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.74 
 
 		 336 aa  249  8e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.982288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1984  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.74 
 
 		 336 aa  249  8e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2644  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.74 
 
 		 336 aa  249  8e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178452  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  45.95 
 
 		 357 aa  248  9e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1870  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.08 
 
 		 377 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.96 
 
 		 356 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2061  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.81 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.24 
 
 		 345 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0375  Dihydroorotate oxidase  44.1 
 
 		 348 aa  248  1e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>