More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2095 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2095  dihydroorotate dehydrogenase  100 
 
 		 354 aa  681    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1463  dihydroorotate dehydrogenase  63.01 
 
 		 348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2026  dihydroorotate dehydrogenase  67.64 
 
 		 354 aa  384  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.1091  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15520  dihydroorotate oxidase A  68.53 
 
 		 342 aa  374  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.67 
 
 		 377 aa  348  1e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0799  dihydroorotate dehydrogenase  54.87 
 
 		 389 aa  329  4e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1877  dihydroorotate dehydrogenase  62.5 
 
 		 344 aa  329  5.0000000000000004e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0253382 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3268  Dihydroorotate oxidase  54.44 
 
 		 366 aa  323  3e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2432  dihydroorotate oxidase A  53.61 
 
 		 355 aa  322  9.000000000000001e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  55.17 
 
 		 396 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.09 
 
 		 357 aa  318  7e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1958  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.5 
 
 		 356 aa  308  9e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.99 
 
 		 356 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.99 
 
 		 356 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.99 
 
 		 356 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9004  Dihydroorotate oxidase  54.2 
 
 		 355 aa  301  8.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687517  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  51.55 
 
 		 360 aa  300  2e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12260  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.97 
 
 		 375 aa  293  2e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  55.11 
 
 		 370 aa  292  7e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  55.26 
 
 		 361 aa  292  8e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2406  dihydroorotate dehydrogenase  52.76 
 
 		 376 aa  288  8e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16390  dihydroorotate oxidase A  51.4 
 
 		 367 aa  282  5.000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.655147  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  49.29 
 
 		 363 aa  283  5.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.46 
 
 		 353 aa  277  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.64 
 
 		 361 aa  272  6e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3039  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.31 
 
 		 353 aa  268  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.74 
 
 		 357 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.92 
 
 		 348 aa  266  5e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.48 
 
 		 344 aa  264  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  45.04 
 
 		 340 aa  263  4e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  46.7 
 
 		 355 aa  261  1e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25100  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.35 
 
 		 354 aa  260  3e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2435  dihydroorotate dehydrogenase  51.16 
 
 		 375 aa  259  4e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  43.66 
 
 		 349 aa  259  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.21 
 
 		 348 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  41.79 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.03 
 
 		 340 aa  253  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.46 
 
 		 343 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  42.41 
 
 		 377 aa  251  2e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  45.59 
 
 		 352 aa  250  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0375  Dihydroorotate oxidase  41.93 
 
 		 348 aa  249  6e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2132  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.84 
 
 		 351 aa  249  6e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.968408  normal  0.0597535 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1650  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.74 
 
 		 351 aa  248  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.92 
 
 		 356 aa  248  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.43 
 
 		 344 aa  247  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1740  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.25 
 
 		 336 aa  247  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0560923  normal  0.0257615 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.41 
 
 		 336 aa  247  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1750  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.18 
 
 		 339 aa  247  3e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1984  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.44 
 
 		 336 aa  246  4e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2555  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.44 
 
 		 336 aa  246  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.982288  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2644  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.44 
 
 		 336 aa  246  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  45 
 
 		 346 aa  245  6.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2150  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.57 
 
 		 393 aa  245  8e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1788  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.95 
 
 		 336 aa  245  9e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0427694  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0741  dihydroorotate oxidase  41.79 
 
 		 344 aa  245  9e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2061  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.64 
 
 		 336 aa  244  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.32 
 
 		 362 aa  245  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  40.41 
 
 		 336 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1646  dihydroorotate dehydrogenase  41.47 
 
 		 335 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.353277  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2299  dihydroorotate oxidase  38.62 
 
 		 336 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.189088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1055  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.9 
 
 		 345 aa  244  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  40.97 
 
 		 336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02009  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.24 
 
 		 331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0256343  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2455  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.02 
 
 		 359 aa  243  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  40.38 
 
 		 375 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1677  dihydroorotate dehydrogenase  42.06 
 
 		 335 aa  243  5e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2220  dihydroorotate dehydrogenase 2  40 
 
 		 339 aa  243  5e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2087  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.41 
 
 		 342 aa  242  7e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2174  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.44 
 
 		 336 aa  241  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000792039  normal  0.661729 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.18 
 
 		 344 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.74 
 
 		 367 aa  241  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00949  dihydroorotate dehydrogenase  41.44 
 
 		 336 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000020271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2698  Dihydroorotate oxidase  41.44 
 
 		 336 aa  241  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157783  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1457  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.95 
 
 		 336 aa  241  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0360083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00956  hypothetical protein  41.44 
 
 		 336 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000162497  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1054  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.44 
 
 		 336 aa  241  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000778438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2651  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.44 
 
 		 336 aa  241  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000533982  hitchhiker  0.00158114 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2141  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.35 
 
 		 340 aa  241  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.84 
 
 		 363 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1109  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.44 
 
 		 336 aa  241  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000226851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.88 
 
 		 353 aa  240  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.37 
 
 		 345 aa  240  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1549  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.82 
 
 		 336 aa  240  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1060  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.44 
 
 		 336 aa  241  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116654  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2372  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.44 
 
 		 336 aa  241  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000164605  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.31 
 
 		 339 aa  240  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.31 
 
 		 339 aa  240  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1133  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.74 
 
 		 336 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000040512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1016  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.74 
 
 		 336 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845277  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1120  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.74 
 
 		 336 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00333644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.8 
 
 		 339 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1099  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.74 
 
 		 336 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000085324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1463  dihydroorotate oxidase  43.75 
 
 		 340 aa  240  2.9999999999999997e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318461 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.34 
 
 		 356 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.31 
 
 		 339 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.34 
 
 		 356 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1167  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.74 
 
 		 336 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0101504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24640  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.84 
 
 		 342 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1098  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.76 
 
 		 336 aa  239  5e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2205  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.61 
 
 		 357 aa  239  5e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>