More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3837 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 
356 aa  704    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  60.46 
 
 
342 aa  392  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25100  dihydroorotate dehydrogenase 2  59.2 
 
 
354 aa  383  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3154  dihydroorotate dehydrogenase  56.16 
 
 
361 aa  371  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351968  hitchhiker  0.000224626 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1850  dihydroorotate dehydrogenase 2  60.35 
 
 
338 aa  361  9e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1857  dihydroorotate dehydrogenase 2  60.06 
 
 
338 aa  358  7e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4274  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.59 
 
 
355 aa  350  2e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.637191  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  52.82 
 
 
355 aa  349  5e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  51.71 
 
 
363 aa  347  1e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.29 
 
 
361 aa  333  3e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.53 
 
 
376 aa  330  3e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.85 
 
 
344 aa  327  2.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  47.85 
 
 
339 aa  323  2e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.58 
 
 
378 aa  318  7.999999999999999e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.58 
 
 
344 aa  317  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  46.45 
 
 
377 aa  317  3e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  49.16 
 
 
349 aa  315  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  51.02 
 
 
352 aa  313  2.9999999999999996e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.43 
 
 
348 aa  309  5e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  46.94 
 
 
375 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.3 
 
 
361 aa  306  3e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  46 
 
 
336 aa  299  6e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.7 
 
 
378 aa  296  2e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.41 
 
 
340 aa  295  6e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.85 
 
 
377 aa  295  8e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  50.86 
 
 
396 aa  292  6e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.87 
 
 
343 aa  291  8e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1896  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.91 
 
 
377 aa  289  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1870  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.91 
 
 
377 aa  288  7e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.29 
 
 
339 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.29 
 
 
339 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.29 
 
 
339 aa  287  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.11 
 
 
353 aa  285  8e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  49.13 
 
 
361 aa  284  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  51.87 
 
 
363 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  51.87 
 
 
363 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.41 
 
 
339 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.17 
 
 
340 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.97 
 
 
356 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.97 
 
 
356 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.97 
 
 
356 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2439  dihydroorotate dehydrogenase 2  44 
 
 
339 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2552  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.71 
 
 
339 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02281  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.74 
 
 
389 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.698801  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1912  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.71 
 
 
339 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103041  normal  0.350428 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2432  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.71 
 
 
339 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160194  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.22 
 
 
349 aa  281  2e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1213  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.27 
 
 
358 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  50.14 
 
 
370 aa  280  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1463  dihydroorotate oxidase  49.7 
 
 
340 aa  281  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0318461 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.39 
 
 
339 aa  278  7e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.08 
 
 
345 aa  278  8e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07890  dihydroorotate oxidase A  49.57 
 
 
385 aa  278  1e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3011  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.18 
 
 
340 aa  278  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000990874 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  48.26 
 
 
367 aa  278  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18900  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.44 
 
 
347 aa  277  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.388059  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.26 
 
 
337 aa  277  2e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1984  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.64 
 
 
336 aa  276  4e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2592  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.63 
 
 
339 aa  276  4e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0934  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.79 
 
 
344 aa  276  4e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2555  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.64 
 
 
336 aa  276  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.982288  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  45.66 
 
 
360 aa  276  4e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.79 
 
 
345 aa  276  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2644  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.64 
 
 
336 aa  276  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178452  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.56 
 
 
377 aa  276  5e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1317  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.99 
 
 
344 aa  276  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.26 
 
 
344 aa  276  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2061  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.19 
 
 
336 aa  275  9e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.22 
 
 
353 aa  275  9e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.2 
 
 
356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02009  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.44 
 
 
331 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0256343  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.2 
 
 
356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0969  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.76 
 
 
347 aa  273  3e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1077  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.76 
 
 
347 aa  273  3e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.32 
 
 
339 aa  272  6e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2220  dihydroorotate dehydrogenase 2  42 
 
 
339 aa  272  7e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0645  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.25 
 
 
337 aa  271  9e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  48.38 
 
 
361 aa  271  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1740  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.38 
 
 
336 aa  271  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0560923  normal  0.0257615 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1253  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.92 
 
 
345 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0768  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.92 
 
 
345 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0837713  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1825  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.92 
 
 
342 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.833484  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1978  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.92 
 
 
345 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0394  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.92 
 
 
345 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350718  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.14 
 
 
360 aa  270  2e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1809  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.21 
 
 
342 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.505366  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  45.87 
 
 
377 aa  271  2e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1736  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.92 
 
 
345 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.575545  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2003  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.95 
 
 
335 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557118  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2150  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.88 
 
 
393 aa  270  4e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1958  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.17 
 
 
356 aa  270  4e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139268 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2507  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.93 
 
 
353 aa  270  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02191  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.42 
 
 
389 aa  269  5e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1788  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.6 
 
 
336 aa  269  5e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0427694  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2174  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.8 
 
 
336 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000792039  normal  0.661729 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2141  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.02 
 
 
340 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1074  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.01 
 
 
356 aa  269  7e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1554  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.01 
 
 
356 aa  269  7e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1593  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.98 
 
 
339 aa  269  7e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000395197  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1928  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.24 
 
 
365 aa  268  7e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0930584  normal  0.0310876 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>