More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2026 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2026  dihydroorotate dehydrogenase  100 
 
 		 354 aa  696    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.1091  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1463  dihydroorotate dehydrogenase  63.95 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15520  dihydroorotate oxidase A  71.8 
 
 		 342 aa  399  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2095  dihydroorotate dehydrogenase  67.05 
 
 		 354 aa  386  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.24 
 
 		 377 aa  316  3e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.68 
 
 		 357 aa  310  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1958  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.55 
 
 		 356 aa  308  8e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139268 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3268  Dihydroorotate oxidase  50.14 
 
 		 366 aa  306  2.0000000000000002e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12260  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.08 
 
 		 375 aa  306  4.0000000000000004e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  51.59 
 
 		 396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1877  dihydroorotate dehydrogenase  58.12 
 
 		 344 aa  302  5.000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0253382 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0799  dihydroorotate dehydrogenase  49.04 
 
 		 389 aa  299  5e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16390  dihydroorotate oxidase A  52.37 
 
 		 367 aa  296  3e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.655147  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2432  dihydroorotate oxidase A  49.04 
 
 		 355 aa  290  3e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  58.05 
 
 		 361 aa  290  4e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.56 
 
 		 353 aa  286  4e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  47.66 
 
 		 360 aa  282  7.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.92 
 
 		 356 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.92 
 
 		 356 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.92 
 
 		 356 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9004  Dihydroorotate oxidase  52.59 
 
 		 355 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2406  dihydroorotate dehydrogenase  50 
 
 		 376 aa  273  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.98 
 
 		 348 aa  270  4e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  44.57 
 
 		 349 aa  266  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.42 
 
 		 357 aa  266  4e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.54 
 
 		 343 aa  261  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3039  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.42 
 
 		 353 aa  256  5e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2435  dihydroorotate dehydrogenase  49.29 
 
 		 375 aa  255  9e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.04 
 
 		 353 aa  253  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.39 
 
 		 361 aa  251  2e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2507  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.75 
 
 		 353 aa  248  8e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  40.11 
 
 		 339 aa  248  1e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.05 
 
 		 344 aa  248  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.19 
 
 		 345 aa  247  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.14 
 
 		 356 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.14 
 
 		 356 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.06 
 
 		 344 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0375  Dihydroorotate oxidase  42.49 
 
 		 348 aa  242  7e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  44.57 
 
 		 363 aa  242  7.999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  49.03 
 
 		 370 aa  241  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.9 
 
 		 336 aa  239  4e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.02 
 
 		 345 aa  239  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.18 
 
 		 339 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2132  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.82 
 
 		 351 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.968408  normal  0.0597535 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02009  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.65 
 
 		 331 aa  238  9e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0256343  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1650  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.82 
 
 		 351 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  41.49 
 
 		 336 aa  238  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.22 
 
 		 350 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2439  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.88 
 
 		 339 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.81 
 
 		 344 aa  237  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.82 
 
 		 363 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2141  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.06 
 
 		 340 aa  236  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.46 
 
 		 340 aa  236  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.3 
 
 		 339 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.3 
 
 		 339 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  43.6 
 
 		 346 aa  235  7e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2220  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.53 
 
 		 339 aa  235  7e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1098  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.11 
 
 		 336 aa  235  8e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2644  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.76 
 
 		 336 aa  235  9e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2555  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.76 
 
 		 336 aa  235  9e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.982288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1984  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.76 
 
 		 336 aa  235  9e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.3 
 
 		 339 aa  235  9e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1935  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.85 
 
 		 360 aa  235  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.540943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  42.52 
 
 		 340 aa  235  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2552  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.59 
 
 		 339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2432  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.59 
 
 		 339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160194  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.58 
 
 		 361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1593  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.94 
 
 		 339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000395197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1549  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.82 
 
 		 336 aa  233  3e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1912  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.59 
 
 		 339 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103041  normal  0.350428 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1224  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.06 
 
 		 352 aa  232  8.000000000000001e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.234745  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2174  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.88 
 
 		 336 aa  231  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000792039  normal  0.661729 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1120  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.76 
 
 		 336 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00333644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2475  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.81 
 
 		 339 aa  231  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00234751  hitchhiker  0.00462057 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1099  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.76 
 
 		 336 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000085324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1016  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.76 
 
 		 336 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845277  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1133  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.76 
 
 		 336 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000040512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1167  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.76 
 
 		 336 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0101504  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00949  dihydroorotate dehydrogenase  39.88 
 
 		 336 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000020271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2698  Dihydroorotate oxidase  39.88 
 
 		 336 aa  231  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157783  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.91 
 
 		 348 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  40.36 
 
 		 336 aa  231  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1060  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.88 
 
 		 336 aa  231  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116654  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1109  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.88 
 
 		 336 aa  231  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000226851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2372  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.88 
 
 		 336 aa  231  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000164605  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00956  hypothetical protein  39.88 
 
 		 336 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000162497  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1074  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.86 
 
 		 356 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1554  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.86 
 
 		 356 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2651  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.88 
 
 		 336 aa  231  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000533982  hitchhiker  0.00158114 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1054  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.88 
 
 		 336 aa  231  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000778438  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  42.18 
 
 		 355 aa  230  3e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1530  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.64 
 
 		 330 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.95205 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2061  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.89 
 
 		 336 aa  229  6e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1740  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.47 
 
 		 336 aa  229  6e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0560923  normal  0.0257615 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1463  dihydroorotate oxidase  42.07 
 
 		 340 aa  229  6e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318461 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2299  dihydroorotate oxidase  40.41 
 
 		 336 aa  229  7e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.189088  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2592  dihydroorotate dehydrogenase 2  39 
 
 		 339 aa  228  9e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  41.48 
 
 		 384 aa  228  1e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.36 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1810  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.06 
 
 		 341 aa  227  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000129041  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>