More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_27841 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_27841  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 		 392 aa  775    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2150  dihydroorotate dehydrogenase 2  78.06 
 
 		 393 aa  590  1e-167  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2465  dihydroorotate dehydrogenase 2  77.55 
 
 		 393 aa  587  1e-166  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.282776 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02171  dihydroorotate dehydrogenase 2  69.82 
 
 		 392 aa  541  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.894621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1566  dihydroorotate dehydrogenase 2  62.17 
 
 		 385 aa  497  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02751  dihydroorotate dehydrogenase 2  62.43 
 
 		 385 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02281  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.09 
 
 		 389 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.698801  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02191  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.41 
 
 		 389 aa  411  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0201  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.03 
 
 		 389 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02171  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.56 
 
 		 389 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  52 
 
 		 376 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  51.06 
 
 		 377 aa  351  1e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.79 
 
 		 378 aa  340  2.9999999999999998e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  50 
 
 		 377 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1870  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.14 
 
 		 377 aa  327  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1896  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.83 
 
 		 377 aa  325  7e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  47.67 
 
 		 375 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.73 
 
 		 378 aa  311  1e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.1 
 
 		 353 aa  290  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  47.74 
 
 		 355 aa  290  4e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  47.25 
 
 		 363 aa  285  1.0000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.69 
 
 		 356 aa  282  9e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.69 
 
 		 356 aa  282  9e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.69 
 
 		 356 aa  282  9e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  50.62 
 
 		 360 aa  280  3e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3039  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.31 
 
 		 353 aa  276  6e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.5 
 
 		 356 aa  276  7e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  44.11 
 
 		 339 aa  275  1.0000000000000001e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.66 
 
 		 344 aa  270  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  48.6 
 
 		 396 aa  268  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.94 
 
 		 377 aa  268  2e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.84 
 
 		 357 aa  266  5e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  47.51 
 
 		 370 aa  263  4.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.83 
 
 		 342 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25100  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.52 
 
 		 354 aa  261  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.37 
 
 		 361 aa  260  2e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  47.94 
 
 		 361 aa  260  4e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.36 
 
 		 344 aa  260  4e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0799  dihydroorotate dehydrogenase  49.05 
 
 		 389 aa  259  6e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  44.11 
 
 		 349 aa  258  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3154  dihydroorotate dehydrogenase  47.06 
 
 		 361 aa  255  8e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351968  hitchhiker  0.000224626 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  47.84 
 
 		 377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2435  dihydroorotate dehydrogenase  47.62 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2143  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.26 
 
 		 351 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.26 
 
 		 351 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.67 
 
 		 336 aa  253  4.0000000000000004e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.46 
 
 		 348 aa  253  4.0000000000000004e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.11 
 
 		 349 aa  253  5.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  46.77 
 
 		 357 aa  253  5.000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  43.32 
 
 		 356 aa  253  6e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.38 
 
 		 343 aa  252  9.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.59 
 
 		 367 aa  251  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1958  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.5 
 
 		 356 aa  250  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139268 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1857  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.48 
 
 		 338 aa  250  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3268  Dihydroorotate oxidase  48.87 
 
 		 366 aa  249  4e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1549  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.19 
 
 		 336 aa  249  6e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.58 
 
 		 356 aa  249  6e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.49 
 
 		 357 aa  249  7e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2003  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.18 
 
 		 335 aa  248  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557118  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  45.67 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.31 
 
 		 360 aa  248  1e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  45.97 
 
 		 356 aa  248  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1056  dihydroorotate dehydrogenase  41.21 
 
 		 355 aa  247  2e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.52 
 
 		 340 aa  248  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.31 
 
 		 361 aa  247  2e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.8 
 
 		 345 aa  247  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1224  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.22 
 
 		 352 aa  247  3e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.234745  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.68 
 
 		 363 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2432  dihydroorotate oxidase A  49.83 
 
 		 355 aa  246  6e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1850  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.26 
 
 		 338 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02009  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.82 
 
 		 331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0256343  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  44.85 
 
 		 340 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.53 
 
 		 345 aa  243  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  43.71 
 
 		 336 aa  243  3.9999999999999997e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18900  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.85 
 
 		 347 aa  243  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.388059  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  46.03 
 
 		 348 aa  242  7e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  46.11 
 
 		 363 aa  242  7.999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  46.11 
 
 		 363 aa  242  7.999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.52 
 
 		 356 aa  242  9e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.52 
 
 		 356 aa  242  9e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2644  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.11 
 
 		 336 aa  242  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178452  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4274  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.23 
 
 		 355 aa  241  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.637191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1600  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.96 
 
 		 365 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.306495 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.47 
 
 		 349 aa  241  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1984  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.11 
 
 		 336 aa  242  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1098  dihydroorotate dehydrogenase 2  43 
 
 		 336 aa  241  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.21 
 
 		 353 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1928  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.3 
 
 		 365 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0930584  normal  0.0310876 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2555  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.11 
 
 		 336 aa  242  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.982288  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  42.25 
 
 		 356 aa  241  2e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9004  Dihydroorotate oxidase  43.88 
 
 		 355 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1750  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.22 
 
 		 339 aa  241  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0847  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.72 
 
 		 352 aa  241  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211753  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  44.79 
 
 		 352 aa  240  2.9999999999999997e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1213  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.96 
 
 		 358 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1740  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.62 
 
 		 336 aa  240  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0560923  normal  0.0257615 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1619  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.97 
 
 		 344 aa  240  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.2 
 
 		 344 aa  240  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  43.98 
 
 		 384 aa  239  5e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.19 
 
 		 339 aa  239  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>