More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0436 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0436  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 1709 aa  3489    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2392  OmpA/MotB  40.46 
 
 		 1402 aa  954    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3079  OmpA/MotB domain-containing protein  78.45 
 
 		 1700 aa  2821    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0046  hypothetical protein  36.14 
 
 		 1260 aa  637    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.744748  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2415  hypothetical protein  36.14 
 
 		 1260 aa  637    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.633946  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3404  hypothetical protein  33.36 
 
 		 1175 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.24888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3669  hypothetical protein  33.36 
 
 		 1175 aa  537  1e-151  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3574  hypothetical protein  32.61 
 
 		 1140 aa  511  1e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05163  hypothetical protein  28.86 
 
 		 1171 aa  427  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1061  hypothetical protein  27.64 
 
 		 1222 aa  404  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0660  hypothetical protein  28.11 
 
 		 1171 aa  401  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  24.97 
 
 		 2000 aa  173  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  25.16 
 
 		 1984 aa  165  9e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3254  hypothetical protein  31.55 
 
 		 2118 aa  139  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55976  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0023  hypothetical protein  30.06 
 
 		 2233 aa  119  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1328  hypothetical protein  28.1 
 
 		 1702 aa  99.8  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.191711 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1046  hypothetical protein  22.87 
 
 		 1757 aa  94.7  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.273403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1861  hypothetical protein  29.3 
 
 		 1143 aa  93.2  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.701379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0406  hypothetical protein  29.05 
 
 		 2418 aa  75.9  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205563 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  30.34 
 
 		 289 aa  75.5  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  36.22 
 
 		 292 aa  74.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5943  conserved repeat domain protein  28.45 
 
 		 2434 aa  72  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  32.28 
 
 		 287 aa  69.3  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1973  chemotaxis protein MotB  32.46 
 
 		 299 aa  66.6  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  38.14 
 
 		 267 aa  67  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  32.54 
 
 		 331 aa  63.2  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3355  OmpA/MotB domain-containing protein  33.07 
 
 		 266 aa  62.4  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  29.06 
 
 		 275 aa  61.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 		 280 aa  62  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0835  OmpA/MotB domain protein  36.94 
 
 		 264 aa  61.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.376588  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1515  hypothetical protein  26.25 
 
 		 1580 aa  62  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  38.32 
 
 		 271 aa  62  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5262  OmpA/MotB  33.03 
 
 		 575 aa  60.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  37.23 
 
 		 240 aa  60.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1372  OmpA domain-containing protein  31.53 
 
 		 458 aa  60.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4948  hypothetical protein  25.91 
 
 		 1278 aa  60.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1484  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  31.53 
 
 		 458 aa  60.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3257  OmpA/MotB domain-containing protein  29.93 
 
 		 576 aa  60.1  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1938  SciP protein  31.53 
 
 		 278 aa  60.1  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0552232  normal  0.859509 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  33.03 
 
 		 587 aa  59.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  35.34 
 
 		 266 aa  59.7  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2084  OmpA/MotB domain-containing protein  33.94 
 
 		 337 aa  59.3  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000772765  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  31.9 
 
 		 257 aa  58.9  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01177  flagellar motor protein MotB  29.6 
 
 		 314 aa  58.9  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2089  OmpA/MotB domain-containing protein  30.22 
 
 		 456 aa  58.9  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.975848  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  36.11 
 
 		 266 aa  58.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2583  OmpA/MotB domain protein  33.04 
 
 		 502 aa  58.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000863952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  36.84 
 
 		 464 aa  58.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0620  OmpA/MotB  33.04 
 
 		 572 aa  58.2  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  32.79 
 
 		 169 aa  58.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1992  OmpA family protein  31.94 
 
 		 452 aa  57.4  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  32.43 
 
 		 316 aa  57.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1040  hypothetical protein  39.47 
 
 		 799 aa  57.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  31.9 
 
 		 224 aa  58.2  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 		 222 aa  57.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  30.88 
 
 		 222 aa  58.2  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004254  Flagellar motor rotation protein MotB  28.8 
 
 		 315 aa  57  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.145815  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  34.19 
 
 		 271 aa  57  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  30.51 
 
 		 221 aa  57  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  35.19 
 
 		 258 aa  57  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  29.1 
 
 		 179 aa  56.6  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  33.61 
 
 		 222 aa  56.6  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  31.25 
 
 		 217 aa  56.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  33.04 
 
 		 224 aa  56.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 218 aa  56.2  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  29.93 
 
 		 215 aa  56.6  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  33.63 
 
 		 269 aa  56.2  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  29.59 
 
 		 525 aa  55.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  32.76 
 
 		 210 aa  55.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  31.53 
 
 		 316 aa  56.2  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  32.76 
 
 		 210 aa  55.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  34.38 
 
 		 277 aa  55.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  33.62 
 
 		 241 aa  55.8  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 316 aa  55.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  30.47 
 
 		 217 aa  55.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  54.55 
 
 		 207 aa  55.8  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001456  protein F-related protein  31.93 
 
 		 224 aa  55.5  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  33.64 
 
 		 367 aa  55.5  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1325  OmpA/MotB domain protein  31.29 
 
 		 241 aa  55.5  0.000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  31.58 
 
 		 478 aa  55.5  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  35.14 
 
 		 459 aa  55.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  32.43 
 
 		 264 aa  55.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3023  hypothetical protein  46.05 
 
 		 434 aa  55.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2882  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  39.24 
 
 		 493 aa  55.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132662 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  32.46 
 
 		 247 aa  54.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  34.23 
 
 		 244 aa  55.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  22.26 
 
 		 454 aa  55.5  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  31.45 
 
 		 290 aa  55.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  34.21 
 
 		 464 aa  54.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1609  hypothetical protein  35.45 
 
 		 433 aa  54.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  33.64 
 
 		 452 aa  54.7  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0126  hypothetical protein  35.45 
 
 		 433 aa  54.7  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0281  OmpA/MotB  36.04 
 
 		 315 aa  54.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.195682 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0139  hypothetical protein  35.45 
 
 		 433 aa  54.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  30.08 
 
 		 209 aa  54.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0162  hypothetical protein  35.45 
 
 		 433 aa  54.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  33.86 
 
 		 333 aa  54.3  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  31.9 
 
 		 225 aa  54.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0050  OmpA/MotB domain-containing protein  27.97 
 
 		 277 aa  54.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  32.46 
 
 		 316 aa  54.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>