23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2415 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3669  hypothetical protein  39.39 
 
 		 1175 aa  729    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0436  OmpA/MotB domain protein  36.06 
 
 		 1709 aa  650    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3079  OmpA/MotB domain-containing protein  36.79 
 
 		 1700 aa  679    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3404  hypothetical protein  39.55 
 
 		 1175 aa  734    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.24888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2415  hypothetical protein  100 
 
 		 1260 aa  2541    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.633946  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0046  hypothetical protein  100 
 
 		 1260 aa  2541    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.744748  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3574  hypothetical protein  39.3 
 
 		 1140 aa  715    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2392  OmpA/MotB  37.77 
 
 		 1402 aa  717    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1061  hypothetical protein  27.89 
 
 		 1222 aa  399  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05163  hypothetical protein  28.75 
 
 		 1171 aa  395  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0660  hypothetical protein  27.93 
 
 		 1171 aa  349  2e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  26.14 
 
 		 2000 aa  184  7e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  26.13 
 
 		 1984 aa  173  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3254  hypothetical protein  24.48 
 
 		 2118 aa  158  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55976  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1046  hypothetical protein  30.61 
 
 		 1757 aa  122  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.273403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4948  hypothetical protein  24.81 
 
 		 1278 aa  120  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1328  hypothetical protein  31.4 
 
 		 1702 aa  115  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.191711 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0023  hypothetical protein  29.12 
 
 		 2233 aa  111  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1861  hypothetical protein  30.05 
 
 		 1143 aa  108  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.701379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0406  hypothetical protein  26.94 
 
 		 2418 aa  102  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205563 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5943  conserved repeat domain protein  27.32 
 
 		 2434 aa  91.3  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1515  hypothetical protein  26.38 
 
 		 1580 aa  87  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0311  hypothetical protein  28.65 
 
 		 1063 aa  48.5  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.427486  decreased coverage  0.00324581 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>