28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4948 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4948  hypothetical protein  100 
 
 		 1278 aa  2598    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  27.3 
 
 		 2000 aa  225  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  27.02 
 
 		 1984 aa  223  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1046  hypothetical protein  23.28 
 
 		 1757 aa  190  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.273403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5943  conserved repeat domain protein  24.54 
 
 		 2434 aa  167  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3254  hypothetical protein  24.03 
 
 		 2118 aa  166  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55976  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0406  hypothetical protein  24.3 
 
 		 2418 aa  151  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205563 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1328  hypothetical protein  23.95 
 
 		 1702 aa  127  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.191711 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0046  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1260 aa  115  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.744748  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2415  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1260 aa  115  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.633946  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1061  hypothetical protein  23.09 
 
 		 1222 aa  84.7  0.000000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1515  hypothetical protein  24.84 
 
 		 1580 aa  83.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3574  hypothetical protein  23.19 
 
 		 1140 aa  82.4  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05163  hypothetical protein  27.82 
 
 		 1171 aa  68.9  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2392  OmpA/MotB  27.41 
 
 		 1402 aa  68.6  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0660  hypothetical protein  25.28 
 
 		 1171 aa  66.2  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0750  hypothetical protein  24.39 
 
 		 1861 aa  62.8  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2800  protein of unknown function DUF11  24.64 
 
 		 1861 aa  61.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.515437  normal  0.451772 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3404  hypothetical protein  25.94 
 
 		 1175 aa  60.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.24888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3669  hypothetical protein  25.94 
 
 		 1175 aa  60.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0436  OmpA/MotB domain protein  25.91 
 
 		 1709 aa  59.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3079  OmpA/MotB domain-containing protein  24.09 
 
 		 1700 aa  57  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1861  hypothetical protein  28.92 
 
 		 1143 aa  56.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.701379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2435  hypothetical protein  27.3 
 
 		 689 aa  55.5  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0311  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1063 aa  52  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.427486  decreased coverage  0.00324581 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  48.48 
 
 		 606 aa  49.3  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0023  hypothetical protein  25.82 
 
 		 2233 aa  46.6  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1537  hypothetical protein  25.33 
 
 		 1156 aa  46.6  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>