More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3079 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3079  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 1700 aa  3494    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2392  OmpA/MotB  39.65 
 
 		 1402 aa  945    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0436  OmpA/MotB domain protein  79.62 
 
 		 1709 aa  2788    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0046  hypothetical protein  36.79 
 
 		 1260 aa  659    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.744748  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2415  hypothetical protein  36.79 
 
 		 1260 aa  659    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.633946  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3404  hypothetical protein  32.82 
 
 		 1175 aa  532  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.24888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3669  hypothetical protein  32.82 
 
 		 1175 aa  529  1e-148  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3574  hypothetical protein  33.48 
 
 		 1140 aa  528  1e-148  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05163  hypothetical protein  28.99 
 
 		 1171 aa  430  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1061  hypothetical protein  27.51 
 
 		 1222 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0660  hypothetical protein  28.03 
 
 		 1171 aa  397  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3254  hypothetical protein  26.25 
 
 		 2118 aa  156  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  25.99 
 
 		 1984 aa  154  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  30.84 
 
 		 2000 aa  131  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0023  hypothetical protein  28.17 
 
 		 2233 aa  117  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1328  hypothetical protein  29 
 
 		 1702 aa  101  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.191711 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1861  hypothetical protein  27.16 
 
 		 1143 aa  85.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.701379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0406  hypothetical protein  27.88 
 
 		 2418 aa  78.2  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205563 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5943  conserved repeat domain protein  27.72 
 
 		 2434 aa  73.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1515  hypothetical protein  27.64 
 
 		 1580 aa  69.3  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1973  chemotaxis protein MotB  35.09 
 
 		 299 aa  68.6  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  32.28 
 
 		 287 aa  67.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  37.29 
 
 		 267 aa  63.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1484  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  33.33 
 
 		 458 aa  63.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1372  OmpA domain-containing protein  33.33 
 
 		 458 aa  63.9  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1938  SciP protein  33.33 
 
 		 278 aa  63.9  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0552232  normal  0.859509 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  37.39 
 
 		 533 aa  62.8  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  33.83 
 
 		 240 aa  62.4  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  37.39 
 
 		 533 aa  61.6  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  29.41 
 
 		 275 aa  61.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 292 aa  60.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3355  OmpA/MotB domain-containing protein  35.78 
 
 		 266 aa  61.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  31.71 
 
 		 209 aa  60.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  37.59 
 
 		 205 aa  60.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  30.71 
 
 		 289 aa  60.1  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2084  OmpA/MotB domain-containing protein  35.78 
 
 		 337 aa  59.3  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000772765  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  32.56 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  33.61 
 
 		 280 aa  58.9  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2043  OmpA/MotB domain protein  34.86 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0433092  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0139  hypothetical protein  38.18 
 
 		 433 aa  58.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  38.74 
 
 		 216 aa  58.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2452  OmpA/MotB domain-containing protein  38.98 
 
 		 463 aa  58.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  38.74 
 
 		 216 aa  58.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1609  hypothetical protein  38.18 
 
 		 433 aa  58.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  33.03 
 
 		 587 aa  58.2  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  31.36 
 
 		 525 aa  58.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  35.14 
 
 		 464 aa  58.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0162  hypothetical protein  38.18 
 
 		 433 aa  58.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  30.56 
 
 		 248 aa  57.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1040  hypothetical protein  31.67 
 
 		 799 aa  57.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  30.66 
 
 		 215 aa  57.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  34.26 
 
 		 320 aa  57.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0844  OmpA/MotB domain-containing protein  35.14 
 
 		 244 aa  57.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.73971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  38.76 
 
 		 244 aa  57.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  36.94 
 
 		 464 aa  57.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4948  hypothetical protein  24.09 
 
 		 1278 aa  57  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3023  hypothetical protein  46.67 
 
 		 434 aa  57  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  35.43 
 
 		 367 aa  57  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0126  hypothetical protein  37.27 
 
 		 433 aa  56.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  35.14 
 
 		 222 aa  56.6  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2583  OmpA/MotB domain protein  35.14 
 
 		 502 aa  56.6  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000863952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  43.96 
 
 		 229 aa  56.6  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  31.71 
 
 		 648 aa  56.6  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  31.19 
 
 		 179 aa  56.2  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  31.25 
 
 		 231 aa  56.6  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  31.5 
 
 		 222 aa  56.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  33.07 
 
 		 212 aa  55.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  34.65 
 
 		 209 aa  55.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  31.25 
 
 		 217 aa  55.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  34.65 
 
 		 209 aa  55.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  36.04 
 
 		 218 aa  55.8  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  34.65 
 
 		 209 aa  55.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  31.25 
 
 		 217 aa  55.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0843  OmpA/MotB  36.04 
 
 		 1619 aa  55.8  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  31.58 
 
 		 333 aa  55.8  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  34.19 
 
 		 271 aa  55.5  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  33.93 
 
 		 427 aa  55.5  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  36.21 
 
 		 464 aa  55.5  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  31.01 
 
 		 326 aa  55.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  36.45 
 
 		 271 aa  55.5  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2353  type IV / VI secretion system protein, DotU family  30.56 
 
 		 494 aa  54.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  32.41 
 
 		 241 aa  55.5  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  34.43 
 
 		 257 aa  55.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  33.9 
 
 		 266 aa  54.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  30.51 
 
 		 221 aa  54.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  35.66 
 
 		 277 aa  53.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  35.25 
 
 		 222 aa  54.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5154  OmpA/MotB domain protein  32.43 
 
 		 219 aa  54.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  40.62 
 
 		 210 aa  54.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  32.81 
 
 		 217 aa  54.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  32.26 
 
 		 694 aa  53.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3257  OmpA/MotB domain-containing protein  28.38 
 
 		 576 aa  54.7  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  40.62 
 
 		 210 aa  54.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  38.3 
 
 		 264 aa  53.9  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  34.23 
 
 		 398 aa  53.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1579  OmpA family domain-containing protein  31.78 
 
 		 333 aa  53.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659118  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  28.8 
 
 		 640 aa  53.5  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1411  OmpA/MotB domain-containing protein  29.33 
 
 		 326 aa  53.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal  0.902662 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  35.59 
 
 		 537 aa  53.9  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0835  OmpA/MotB domain protein  33.93 
 
 		 264 aa  53.9  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.376588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>