19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0660 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0660  hypothetical protein  100 
 
 
1171 aa  2366    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05163  hypothetical protein  66.24 
 
 
1171 aa  1620    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1061  hypothetical protein  33.36 
 
 
1222 aa  616  1e-175  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0436  OmpA/MotB domain protein  28.11 
 
 
1709 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3079  OmpA/MotB domain-containing protein  28.03 
 
 
1700 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2392  OmpA/MotB  27.09 
 
 
1402 aa  347  8.999999999999999e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.337578  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0046  hypothetical protein  27.63 
 
 
1260 aa  340  8e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.744748  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2415  hypothetical protein  27.63 
 
 
1260 aa  340  8e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.633946  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3574  hypothetical protein  25.2 
 
 
1140 aa  281  4e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3404  hypothetical protein  24.98 
 
 
1175 aa  252  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.24888  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3669  hypothetical protein  25.05 
 
 
1175 aa  251  6e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1861  hypothetical protein  25.7 
 
 
1143 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.701379  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0023  hypothetical protein  28.61 
 
 
2233 aa  111  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3254  hypothetical protein  27.38 
 
 
2118 aa  94  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55976  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  25.98 
 
 
2000 aa  82  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  25.38 
 
 
1984 aa  74.3  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4948  hypothetical protein  25.28 
 
 
1278 aa  66.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1328  hypothetical protein  22.76 
 
 
1702 aa  51.2  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.191711 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1046  hypothetical protein  24.93 
 
 
1757 aa  50.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.273403  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>