More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2553 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2553  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 254 aa  528  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.333677  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1899  peptide chain release factor 2  79.52 
 
 		 367 aa  428  1e-119  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0199155  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09203  putative peptide chain release factor  79.13 
 
 		 316 aa  428  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.165955  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3994  peptide chain release factor 2  63.82 
 
 		 357 aa  339  2.9999999999999998e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0498322  normal  0.718153 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0282  hypothetical protein  64.23 
 
 		 357 aa  337  9.999999999999999e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394775 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5751  hypothetical protein  61.38 
 
 		 358 aa  333  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1048  hypothetical protein  60.57 
 
 		 332 aa  333  1e-90  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2832  peptide chain release factor 2  58.3 
 
 		 358 aa  308  8e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.909356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5492  peptide chain release factor 2  57.72 
 
 		 362 aa  300  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0496262 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1305  LigA  54.55 
 
 		 371 aa  298  6e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  55.51 
 
 		 365 aa  298  8e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4200  peptide chain release factor 2  55.1 
 
 		 323 aa  296  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  52.24 
 
 		 369 aa  295  4e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2784  peptide chain release factor 2  56.63 
 
 		 363 aa  295  4e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.785261  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2575  peptide chain release factor 2  53.88 
 
 		 367 aa  292  3e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  53.88 
 
 		 379 aa  293  3e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  53.88 
 
 		 323 aa  292  4e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2538  peptide chain release factor 2  55.92 
 
 		 363 aa  291  5e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0023  peptide chain release factor 2  55.42 
 
 		 312 aa  291  7e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000581574  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2031  peptide chain release factor 2  55.02 
 
 		 363 aa  291  8e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0138456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0238  peptide chain release factor 2  55.92 
 
 		 363 aa  290  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000385966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3275  peptide chain release factor 2  55.1 
 
 		 322 aa  290  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314712  normal  0.99195 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  53.69 
 
 		 375 aa  289  2e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2844  peptide chain release factor 2  52.65 
 
 		 325 aa  288  4e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0209  peptide chain release factor 2  55.92 
 
 		 381 aa  288  7e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  53.06 
 
 		 349 aa  287  1e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1715  peptide chain release factor 2  55.1 
 
 		 322 aa  287  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.833664  normal  0.278616 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1707  peptide chain release factor 2  53.47 
 
 		 322 aa  287  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  56.57 
 
 		 371 aa  286  2e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  52.65 
 
 		 367 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1825  peptide chain release factor 2  55.1 
 
 		 322 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  53.47 
 
 		 344 aa  285  4e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1036  peptide chain release factor 2  53.47 
 
 		 357 aa  285  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2533  peptide chain release factor 2  53.44 
 
 		 375 aa  285  7e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2851  peptide chain release factor 2  54.29 
 
 		 322 aa  284  8e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0961  peptide chain release factor 2  53.47 
 
 		 342 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  hitchhiker  0.00626958 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  53.06 
 
 		 357 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2040  peptide chain release factor 2  52.65 
 
 		 322 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1562  peptide chain release factor 2  52.24 
 
 		 280 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271557  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2445  peptide chain release factor 2  55.1 
 
 		 322 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.689282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  52.03 
 
 		 317 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2731  hypothetical protein  55.1 
 
 		 376 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1030  peptide chain release factor 2 protein  53.06 
 
 		 300 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.235991  normal  0.771675 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1471  peptide chain release factor 2  53.06 
 
 		 349 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  51.84 
 
 		 367 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3006  peptide chain release factor 2  54.69 
 
 		 322 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.743846  normal  0.215717 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  51.84 
 
 		 459 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4083  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  51.02 
 
 		 365 aa  281  5.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.963626  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  52.44 
 
 		 372 aa  281  6.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  52.4 
 
 		 361 aa  281  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  51.43 
 
 		 359 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0486  peptide chain release factor 2  52.65 
 
 		 349 aa  281  6.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.289866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1823  peptide chain release factor 2  54.29 
 
 		 374 aa  281  7.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366518  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0328  peptide chain release factor 2  51.82 
 
 		 362 aa  280  1e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2982  peptide chain release factor 2  53.66 
 
 		 321 aa  280  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.186364  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  51.84 
 
 		 417 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3208  peptide chain release factor 2  53.66 
 
 		 321 aa  280  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.760596 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3166  peptide chain release factor 2  53.25 
 
 		 321 aa  280  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  51.43 
 
 		 367 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  52.85 
 
 		 326 aa  280  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2380  peptide chain release factor 2  55.51 
 
 		 249 aa  280  2e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  50.81 
 
 		 371 aa  280  2e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1938  hypothetical protein  52.44 
 
 		 370 aa  280  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374727  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  51.43 
 
 		 367 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  51.43 
 
 		 367 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  51.02 
 
 		 365 aa  279  3e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  50.8 
 
 		 369 aa  279  3e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  51.02 
 
 		 391 aa  279  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0397  peptide chain release factor 2  53.88 
 
 		 302 aa  279  3e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1396  peptide chain release factor 2  52.65 
 
 		 376 aa  279  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145542  normal  0.663768 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  52.23 
 
 		 371 aa  279  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1153  peptide chain release factor 2  51.84 
 
 		 248 aa  279  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449488  normal  0.0907567 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  52.24 
 
 		 376 aa  279  4e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0456  peptide chain release factor 2  53.88 
 
 		 338 aa  278  4e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.454858  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  51.02 
 
 		 373 aa  278  4e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  51.02 
 
 		 391 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  51.02 
 
 		 391 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  51.02 
 
 		 391 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  51.84 
 
 		 367 aa  278  5e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01981  peptide chain release factor 2  50.81 
 
 		 356 aa  278  6e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.823612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  49.21 
 
 		 377 aa  278  7e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1548  peptide chain release factor 2  53.06 
 
 		 313 aa  278  7e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.475132  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2722  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  51.43 
 
 		 248 aa  278  7e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2206  peptide chain release factor 2, programmed  51.43 
 
 		 248 aa  278  7e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3112  peptide chain release factor 2  51.43 
 
 		 248 aa  278  7e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.826864  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1479  peptide chain release factor 2, programmed  51.43 
 
 		 248 aa  278  7e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0793  peptide chain release factor 2  50.61 
 
 		 331 aa  278  8e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1305  peptide chain release factor 2  52.65 
 
 		 376 aa  277  9e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0721349 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  51.43 
 
 		 375 aa  277  1e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02561  peptide chain release factor 2  53.06 
 
 		 313 aa  277  1e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.686331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1172  peptide chain release factor 2  52.65 
 
 		 375 aa  277  1e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1102  peptide chain release factor 2  53.88 
 
 		 337 aa  277  1e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.437069  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5845  peptide chain release factor 2  53.25 
 
 		 321 aa  276  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  51.43 
 
 		 364 aa  277  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  52.03 
 
 		 364 aa  276  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2265  peptide chain release factor 2  51.43 
 
 		 321 aa  276  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0404  peptide chain release factor 2  51.43 
 
 		 304 aa  276  2e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.660682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1069  peptide chain release factor 2  52.65 
 
 		 347 aa  276  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  50.61 
 
 		 406 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  52.17 
 
 		 329 aa  276  2e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>