More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2380 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2380  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 249 aa  517  1e-146  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2538  peptide chain release factor 2  97.19 
 
 		 363 aa  509  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2031  peptide chain release factor 2  95.98 
 
 		 363 aa  504  9.999999999999999e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0138456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2784  peptide chain release factor 2  93.57 
 
 		 363 aa  495  1e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.785261  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0023  peptide chain release factor 2  93.17 
 
 		 312 aa  493  9.999999999999999e-139  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000581574  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0238  peptide chain release factor 2  87.95 
 
 		 363 aa  471  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000385966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0209  peptide chain release factor 2  87.9 
 
 		 381 aa  467  1.0000000000000001e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5751  hypothetical protein  62.2 
 
 		 358 aa  335  3.9999999999999995e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3994  peptide chain release factor 2  60.98 
 
 		 357 aa  326  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0498322  normal  0.718153 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0282  hypothetical protein  59.92 
 
 		 357 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394775 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  60.82 
 
 		 326 aa  314  9e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  59.18 
 
 		 371 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  57.83 
 
 		 367 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  57.43 
 
 		 367 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  55.42 
 
 		 357 aa  305  3e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  58.23 
 
 		 369 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1305  LigA  58.73 
 
 		 371 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  56.73 
 
 		 367 aa  301  7.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  58.37 
 
 		 327 aa  301  7.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  58.37 
 
 		 380 aa  301  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  58.37 
 
 		 380 aa  300  1e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  59.43 
 
 		 375 aa  300  1e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  58.37 
 
 		 380 aa  300  1e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  56.63 
 
 		 330 aa  300  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  57.14 
 
 		 317 aa  300  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  57.96 
 
 		 380 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  58.37 
 
 		 326 aa  299  3e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  58.37 
 
 		 326 aa  299  3e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0397  peptide chain release factor 2  58.2 
 
 		 302 aa  298  5e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0456  peptide chain release factor 2  58.2 
 
 		 338 aa  298  6e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.454858  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  54.47 
 
 		 373 aa  297  1e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  57.96 
 
 		 326 aa  296  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  56.4 
 
 		 372 aa  296  2e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  55.92 
 
 		 369 aa  296  2e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  57.96 
 
 		 364 aa  296  3e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  57.55 
 
 		 326 aa  295  3e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  59.04 
 
 		 364 aa  295  3e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  57.72 
 
 		 361 aa  295  5e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1899  peptide chain release factor 2  55.1 
 
 		 367 aa  295  6e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0199155  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  55.92 
 
 		 372 aa  294  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  56.33 
 
 		 366 aa  293  1e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1048  hypothetical protein  54.22 
 
 		 332 aa  293  2e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0328  peptide chain release factor 2  55.92 
 
 		 362 aa  293  2e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  55.33 
 
 		 365 aa  293  2e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00072  peptide chain release factor 2  57.79 
 
 		 329 aa  293  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1823  peptide chain release factor 2  57.79 
 
 		 374 aa  293  3e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366518  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  56.33 
 
 		 343 aa  292  3e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2553  peptide chain release factor 2  55.51 
 
 		 254 aa  292  4e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.333677  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  57.32 
 
 		 383 aa  291  5e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  55.92 
 
 		 364 aa  291  5e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1102  peptide chain release factor 2  56.73 
 
 		 337 aa  291  7e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.437069  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  56.56 
 
 		 349 aa  290  1e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  59.43 
 
 		 371 aa  290  1e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4227  peptide chain release factor 2  55.28 
 
 		 304 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358427  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5492  peptide chain release factor 2  56.97 
 
 		 362 aa  289  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0496262 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  57.32 
 
 		 331 aa  289  3e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  57.32 
 
 		 369 aa  289  3e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  56.97 
 
 		 349 aa  288  4e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1216  peptide chain release factor 2  54.92 
 
 		 347 aa  288  4e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000777998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3371  peptide chain release factor 2  54.88 
 
 		 378 aa  289  4e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4122  peptide chain release factor 2  54.88 
 
 		 304 aa  288  7e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  55.33 
 
 		 364 aa  288  8e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  55.92 
 
 		 374 aa  287  9e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1100  peptide chain release factor 2  54.88 
 
 		 304 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  55.69 
 
 		 371 aa  287  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  54.47 
 
 		 359 aa  287  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09203  putative peptide chain release factor  55.1 
 
 		 316 aa  287  1e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.165955  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2271  peptide chain release factor 2  55.33 
 
 		 310 aa  287  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  56.68 
 
 		 362 aa  286  2e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  57.14 
 
 		 367 aa  286  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4083  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  54.51 
 
 		 365 aa  286  2.9999999999999996e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.963626  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  54.47 
 
 		 349 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  54.1 
 
 		 365 aa  285  4e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  54.1 
 
 		 365 aa  285  4e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1500  hypothetical protein  53.66 
 
 		 293 aa  285  5e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  55.42 
 
 		 367 aa  285  5e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  56.68 
 
 		 356 aa  285  5e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  56.56 
 
 		 364 aa  285  5.999999999999999e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0724  peptide chain release factor 2  52 
 
 		 312 aa  285  5.999999999999999e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0923  peptide chain release factor 2  54.1 
 
 		 310 aa  284  8e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  56.68 
 
 		 357 aa  284  8e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  54.77 
 
 		 334 aa  284  9e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1030  peptide chain release factor 2 protein  53.66 
 
 		 300 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.235991  normal  0.771675 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1310  peptide chain release factor 2  54.58 
 
 		 329 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.496606  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  54.69 
 
 		 330 aa  284  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  54.1 
 
 		 365 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1562  peptide chain release factor 2  53.25 
 
 		 280 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271557  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  54.1 
 
 		 365 aa  284  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  54.69 
 
 		 329 aa  284  1.0000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  53.69 
 
 		 365 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  53.69 
 
 		 365 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  56.1 
 
 		 371 aa  283  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  53.69 
 
 		 365 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  53.69 
 
 		 365 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  54.62 
 
 		 417 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  53.69 
 
 		 365 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  54.1 
 
 		 365 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  55.06 
 
 		 379 aa  283  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0479  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  53.28 
 
 		 365 aa  282  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  52.44 
 
 		 362 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>