More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3994 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3994  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 357 aa  734    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0498322  normal  0.718153 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5751  hypothetical protein  75.28 
 
 		 358 aa  545  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0282  hypothetical protein  60.39 
 
 		 357 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394775 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1899  peptide chain release factor 2  56.94 
 
 		 367 aa  422  1e-117  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0199155  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2832  peptide chain release factor 2  56.46 
 
 		 358 aa  419  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.909356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5492  peptide chain release factor 2  56.74 
 
 		 362 aa  409  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0496262 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1048  hypothetical protein  57.72 
 
 		 332 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09203  putative peptide chain release factor  60.66 
 
 		 316 aa  388  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.165955  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0238  peptide chain release factor 2  52.3 
 
 		 363 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000385966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2031  peptide chain release factor 2  53.47 
 
 		 363 aa  370  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0138456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2784  peptide chain release factor 2  51.16 
 
 		 363 aa  361  1e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.785261  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2538  peptide chain release factor 2  51.59 
 
 		 363 aa  360  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  48.3 
 
 		 365 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1305  LigA  48.9 
 
 		 371 aa  352  7e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0209  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 381 aa  350  3e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  49.44 
 
 		 367 aa  347  2e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0023  peptide chain release factor 2  53.57 
 
 		 312 aa  342  5.999999999999999e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000581574  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  47.16 
 
 		 364 aa  342  8e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2553  peptide chain release factor 2  63.82 
 
 		 254 aa  340  2.9999999999999998e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.333677  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  47.44 
 
 		 365 aa  339  4e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  47.44 
 
 		 365 aa  338  8e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4083  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  46.31 
 
 		 365 aa  338  9e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.963626  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  47.44 
 
 		 365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  47.44 
 
 		 365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  47.44 
 
 		 365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  47.44 
 
 		 365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  47.16 
 
 		 365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  48.3 
 
 		 365 aa  335  7e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  46.31 
 
 		 365 aa  335  7e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1216  peptide chain release factor 2  48.83 
 
 		 347 aa  335  7.999999999999999e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000777998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  47.16 
 
 		 365 aa  333  2e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  46.33 
 
 		 364 aa  332  5e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  46.61 
 
 		 367 aa  332  5e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  46.44 
 
 		 367 aa  332  6e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  46.44 
 
 		 367 aa  332  6e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  46.88 
 
 		 459 aa  331  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  46.15 
 
 		 367 aa  329  4e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  46.82 
 
 		 391 aa  329  6e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  46.61 
 
 		 372 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0960  hypothetical protein  46.05 
 
 		 367 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0655613 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0895  hypothetical protein  46.33 
 
 		 367 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0852209 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2844  peptide chain release factor 2  47.98 
 
 		 325 aa  326  3e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  48.08 
 
 		 369 aa  327  3e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  47.06 
 
 		 383 aa  326  5e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2248  hypothetical protein  46.44 
 
 		 367 aa  325  6e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2758  peptide chain release factor 2  46.44 
 
 		 367 aa  325  6e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  46.82 
 
 		 406 aa  325  6e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  49.11 
 
 		 365 aa  325  6e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  45.01 
 
 		 354 aa  325  7e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  45.35 
 
 		 366 aa  325  9e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  46.24 
 
 		 391 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1823  peptide chain release factor 2  45.89 
 
 		 374 aa  324  1e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366518  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  46.24 
 
 		 391 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  46.24 
 
 		 391 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2271  peptide chain release factor 2  52.94 
 
 		 310 aa  324  2e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  46.18 
 
 		 364 aa  323  3e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  48.87 
 
 		 371 aa  323  4e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  45.07 
 
 		 371 aa  322  5e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  49.23 
 
 		 326 aa  322  5e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  45.61 
 
 		 364 aa  322  7e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0486  peptide chain release factor 2  46.4 
 
 		 349 aa  322  8e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.289866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  46.65 
 
 		 359 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  43.5 
 
 		 372 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  47.25 
 
 		 349 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  47.01 
 
 		 375 aa  320  1.9999999999999998e-86  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  49.27 
 
 		 379 aa  320  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  45.48 
 
 		 380 aa  320  3e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1471  peptide chain release factor 2  46.11 
 
 		 349 aa  320  3e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  46.67 
 
 		 349 aa  320  3e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  49.53 
 
 		 331 aa  319  6e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  45.3 
 
 		 371 aa  318  7e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  45.2 
 
 		 380 aa  318  7e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  45.14 
 
 		 362 aa  317  2e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  45.33 
 
 		 366 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3791  hypothetical protein  44.17 
 
 		 367 aa  317  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.914403  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  45.2 
 
 		 380 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1069  peptide chain release factor 2  45.66 
 
 		 347 aa  317  2e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  44.92 
 
 		 380 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  45.66 
 
 		 357 aa  317  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  44.92 
 
 		 349 aa  317  3e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  46.61 
 
 		 367 aa  316  4e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1036  peptide chain release factor 2  45.09 
 
 		 357 aa  316  4e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1805  peptide chain release factor 2  46.84 
 
 		 354 aa  316  4e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2380  peptide chain release factor 2  60.98 
 
 		 249 aa  316  4e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  44.51 
 
 		 417 aa  315  6e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  47.49 
 
 		 371 aa  313  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0302  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  46.88 
 
 		 365 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2773  peptide chain release factor 2  44.31 
 
 		 355 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  45.83 
 
 		 356 aa  311  9e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0939  hypothetical protein  43.18 
 
 		 365 aa  311  9e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0179192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  45.07 
 
 		 364 aa  311  9e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1904  peptide chain release factor 2  46.67 
 
 		 337 aa  310  2e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.430397  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3265  peptide chain release factor 2  44.9 
 
 		 386 aa  310  2.9999999999999997e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.337928  hitchhiker  0.000000190914 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  43.27 
 
 		 373 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0923  peptide chain release factor 2  54.44 
 
 		 310 aa  309  5e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  52.36 
 
 		 317 aa  309  5e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  44.9 
 
 		 361 aa  309  5e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  44.74 
 
 		 357 aa  308  6.999999999999999e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1437  peptide chain release factor 2  44.86 
 
 		 382 aa  308  9e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  45.73 
 
 		 343 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>