More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2832 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2832  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 358 aa  729    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.909356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1048  hypothetical protein  63.55 
 
 		 332 aa  434  1e-121  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5751  hypothetical protein  59.27 
 
 		 358 aa  429  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3994  peptide chain release factor 2  56.46 
 
 		 357 aa  409  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0498322  normal  0.718153 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0282  hypothetical protein  54.78 
 
 		 357 aa  400  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394775 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1899  peptide chain release factor 2  52.96 
 
 		 367 aa  395  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0199155  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5492  peptide chain release factor 2  53.22 
 
 		 362 aa  372  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0496262 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09203  putative peptide chain release factor  53.11 
 
 		 316 aa  345  6e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.165955  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2784  peptide chain release factor 2  46.11 
 
 		 363 aa  324  1e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.785261  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0238  peptide chain release factor 2  47.94 
 
 		 363 aa  322  5e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000385966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1305  LigA  45.18 
 
 		 371 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2031  peptide chain release factor 2  45.28 
 
 		 363 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0138456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1823  peptide chain release factor 2  44.72 
 
 		 374 aa  312  4.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366518  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  45 
 
 		 366 aa  308  5.9999999999999995e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  45.32 
 
 		 367 aa  308  6.999999999999999e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0209  peptide chain release factor 2  46.78 
 
 		 381 aa  308  9e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2553  peptide chain release factor 2  58.3 
 
 		 254 aa  308  1.0000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.333677  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2538  peptide chain release factor 2  44.72 
 
 		 363 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4083  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  45.22 
 
 		 365 aa  307  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.963626  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  46.22 
 
 		 379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  44.66 
 
 		 365 aa  306  3e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  44.97 
 
 		 364 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  44.79 
 
 		 343 aa  305  6e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  45.89 
 
 		 378 aa  305  9.000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  43.3 
 
 		 367 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  44.13 
 
 		 365 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  46.88 
 
 		 329 aa  303  3.0000000000000004e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  44.13 
 
 		 365 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  44.13 
 
 		 365 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  44.13 
 
 		 365 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  43.98 
 
 		 365 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  43.91 
 
 		 364 aa  303  4.0000000000000003e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  48.29 
 
 		 375 aa  302  6.000000000000001e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  43.85 
 
 		 365 aa  301  9e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  44.76 
 
 		 366 aa  301  9e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  43.52 
 
 		 372 aa  301  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  43.91 
 
 		 362 aa  301  1e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  43.44 
 
 		 365 aa  298  1e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  43.7 
 
 		 365 aa  297  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  44.51 
 
 		 371 aa  296  3e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  42.86 
 
 		 371 aa  296  3e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  43.42 
 
 		 365 aa  296  4e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0456  peptide chain release factor 2  47.4 
 
 		 338 aa  294  1e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.454858  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  45.96 
 
 		 367 aa  294  1e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  43.73 
 
 		 365 aa  294  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  45.56 
 
 		 367 aa  295  1e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  44.23 
 
 		 364 aa  295  1e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  42.54 
 
 		 364 aa  293  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0939  hypothetical protein  43.54 
 
 		 365 aa  293  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0179192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3791  hypothetical protein  44.03 
 
 		 367 aa  293  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.914403  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0397  peptide chain release factor 2  54.94 
 
 		 302 aa  293  4e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  42.3 
 
 		 365 aa  293  4e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  45.96 
 
 		 332 aa  293  4e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0479  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  41.76 
 
 		 365 aa  293  4e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2248  hypothetical protein  44.03 
 
 		 367 aa  293  4e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2758  peptide chain release factor 2  44.03 
 
 		 367 aa  293  4e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  41.53 
 
 		 372 aa  292  6e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  41.43 
 
 		 361 aa  292  6e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  42.12 
 
 		 354 aa  291  1e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00072  peptide chain release factor 2  45.43 
 
 		 329 aa  290  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1437  peptide chain release factor 2  44.31 
 
 		 382 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  44.69 
 
 		 326 aa  290  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0023  peptide chain release factor 2  47.9 
 
 		 312 aa  290  3e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000581574  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16510  putative peptide chain release factor 2  45.48 
 
 		 332 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2274  peptide chain release factor 2  47.88 
 
 		 310 aa  289  4e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  45.11 
 
 		 366 aa  289  4e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  42.42 
 
 		 367 aa  289  6e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  44.1 
 
 		 383 aa  288  8e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  47.26 
 
 		 371 aa  288  1e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0793  peptide chain release factor 2  45.59 
 
 		 331 aa  288  1e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  46.11 
 
 		 361 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1216  peptide chain release factor 2  44.35 
 
 		 347 aa  288  1e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000777998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  44.21 
 
 		 369 aa  288  1e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  41.81 
 
 		 367 aa  288  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2271  peptide chain release factor 2  48.99 
 
 		 310 aa  288  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  42.49 
 
 		 362 aa  287  2e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  41.71 
 
 		 369 aa  287  2e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0811  peptide chain release factor 2  49.65 
 
 		 293 aa  287  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  45.11 
 
 		 332 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2773  peptide chain release factor 2  44.9 
 
 		 355 aa  286  4e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3371  peptide chain release factor 2  44.02 
 
 		 378 aa  285  7e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  40.23 
 
 		 380 aa  285  8e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  43.53 
 
 		 349 aa  285  9e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  41.64 
 
 		 371 aa  285  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  40.51 
 
 		 380 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09020  peptide chain release factor 2  41.26 
 
 		 369 aa  283  2.0000000000000002e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.140459  normal  0.0325774 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1805  peptide chain release factor 2  43.63 
 
 		 354 aa  284  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  40.23 
 
 		 380 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  40.23 
 
 		 380 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  40.96 
 
 		 367 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  40.96 
 
 		 367 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  40.96 
 
 		 367 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1305  peptide chain release factor 2  42.78 
 
 		 376 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0721349 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  53.44 
 
 		 323 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0960  hypothetical protein  43.14 
 
 		 367 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0655613 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0961  peptide chain release factor 2  44.98 
 
 		 342 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  hitchhiker  0.00626958 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0840  peptide chain release factor 2  43.44 
 
 		 352 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  43.99 
 
 		 349 aa  282  5.000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0486  peptide chain release factor 2  42.07 
 
 		 349 aa  283  5.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.289866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0895  hypothetical protein  42.86 
 
 		 367 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0852209 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>