More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0023 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0023  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 312 aa  645    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000581574  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2784  peptide chain release factor 2  88.1 
 
 		 363 aa  579  1e-164  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.785261  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2031  peptide chain release factor 2  86.17 
 
 		 363 aa  566  1e-160  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0138456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2538  peptide chain release factor 2  86.77 
 
 		 363 aa  565  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0238  peptide chain release factor 2  77.35 
 
 		 363 aa  509  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000385966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0209  peptide chain release factor 2  76.05 
 
 		 381 aa  495  1e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2380  peptide chain release factor 2  93.17 
 
 		 249 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5751  hypothetical protein  54.02 
 
 		 358 aa  345  5e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3994  peptide chain release factor 2  53.57 
 
 		 357 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0498322  normal  0.718153 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0282  hypothetical protein  53.53 
 
 		 357 aa  332  4e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394775 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1305  LigA  53.21 
 
 		 371 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  53.92 
 
 		 367 aa  323  2e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  52.84 
 
 		 326 aa  323  3e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  53.58 
 
 		 367 aa  323  3e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  52.65 
 
 		 330 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  51.14 
 
 		 372 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  50.16 
 
 		 317 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  56 
 
 		 369 aa  317  1e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1899  peptide chain release factor 2  48.88 
 
 		 367 aa  317  2e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0199155  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  48.7 
 
 		 357 aa  317  2e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4122  peptide chain release factor 2  50.83 
 
 		 304 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4227  peptide chain release factor 2  50.83 
 
 		 304 aa  316  4e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358427  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  52.38 
 
 		 371 aa  315  8e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  50.48 
 
 		 367 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  53.21 
 
 		 365 aa  314  9.999999999999999e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  54.12 
 
 		 371 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2271  peptide chain release factor 2  50.65 
 
 		 310 aa  312  3.9999999999999997e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1216  peptide chain release factor 2  53.24 
 
 		 347 aa  312  4.999999999999999e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000777998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  57.75 
 
 		 361 aa  311  6.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  54.95 
 
 		 364 aa  311  9e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  50.81 
 
 		 364 aa  311  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  49.67 
 
 		 365 aa  310  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  49.01 
 
 		 365 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  49.01 
 
 		 365 aa  309  4e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  49.01 
 
 		 365 aa  309  4e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  49.01 
 
 		 365 aa  309  4e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  49.01 
 
 		 365 aa  309  4e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0397  peptide chain release factor 2  53.96 
 
 		 302 aa  308  6.999999999999999e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0456  peptide chain release factor 2  53.96 
 
 		 338 aa  308  8e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.454858  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  55.35 
 
 		 380 aa  308  8e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  55.35 
 
 		 380 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  55.35 
 
 		 380 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  51.16 
 
 		 375 aa  308  1.0000000000000001e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  54.98 
 
 		 380 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  48.68 
 
 		 365 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  50.49 
 
 		 326 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  50.49 
 
 		 326 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  48.88 
 
 		 372 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16510  putative peptide chain release factor 2  49.35 
 
 		 332 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  54.61 
 
 		 327 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  50.49 
 
 		 326 aa  306  3e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  56.16 
 
 		 371 aa  306  3e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  51.32 
 
 		 340 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  49.34 
 
 		 365 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  56.4 
 
 		 369 aa  305  5.0000000000000004e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1100  peptide chain release factor 2  51.83 
 
 		 304 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  48.68 
 
 		 365 aa  305  5.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  54.98 
 
 		 326 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  46.1 
 
 		 373 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  51.77 
 
 		 364 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  50.16 
 
 		 364 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  50.68 
 
 		 367 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  50.68 
 
 		 366 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0194  peptide chain release factor 2  49.66 
 
 		 299 aa  302  4.0000000000000003e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.109294  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1048  hypothetical protein  46.23 
 
 		 332 aa  302  4.0000000000000003e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  48.18 
 
 		 334 aa  302  4.0000000000000003e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0923  peptide chain release factor 2  48.69 
 
 		 310 aa  302  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3371  peptide chain release factor 2  48.69 
 
 		 378 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  50.16 
 
 		 366 aa  302  6.000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0724  peptide chain release factor 2  47.84 
 
 		 312 aa  302  6.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  53.96 
 
 		 368 aa  301  7.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  49.35 
 
 		 361 aa  301  9e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  50.49 
 
 		 331 aa  300  1e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  50.65 
 
 		 372 aa  301  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  48.68 
 
 		 365 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1437  peptide chain release factor 2  48.37 
 
 		 382 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  49.35 
 
 		 383 aa  300  1e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5492  peptide chain release factor 2  48.86 
 
 		 362 aa  301  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0496262 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  50.49 
 
 		 369 aa  301  1e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4083  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  50.88 
 
 		 365 aa  300  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.963626  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  48.54 
 
 		 379 aa  300  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1823  peptide chain release factor 2  52.88 
 
 		 374 aa  299  4e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366518  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00072  peptide chain release factor 2  52.5 
 
 		 329 aa  299  4e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  51.8 
 
 		 349 aa  298  5e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  50.35 
 
 		 459 aa  298  6e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  52.69 
 
 		 343 aa  298  8e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3429  peptide chain release factor 2  49.01 
 
 		 329 aa  298  8e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883546 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  50.32 
 
 		 374 aa  298  1e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  50.32 
 
 		 377 aa  298  1e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  47.23 
 
 		 329 aa  296  2e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  48.04 
 
 		 367 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  52.16 
 
 		 349 aa  296  2e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2274  peptide chain release factor 2  48.38 
 
 		 310 aa  297  2e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  48.04 
 
 		 367 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  48.04 
 
 		 367 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  53.02 
 
 		 362 aa  296  3e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  50.36 
 
 		 325 aa  296  3e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09203  putative peptide chain release factor  48.56 
 
 		 316 aa  296  4e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.165955  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  48.37 
 
 		 359 aa  295  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  48.85 
 
 		 330 aa  295  6e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>