More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5751 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5751  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  737    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3994  peptide chain release factor 2  75.28 
 
 		 357 aa  544  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0498322  normal  0.718153 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0282  hypothetical protein  61.8 
 
 		 357 aa  456  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394775 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2832  peptide chain release factor 2  59.27 
 
 		 358 aa  441  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.909356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1899  peptide chain release factor 2  55.24 
 
 		 367 aa  416  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0199155  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1048  hypothetical protein  57.93 
 
 		 332 aa  414  1e-114  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5492  peptide chain release factor 2  54.21 
 
 		 362 aa  395  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0496262 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2031  peptide chain release factor 2  54.05 
 
 		 363 aa  383  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0138456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0238  peptide chain release factor 2  53.67 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000385966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2784  peptide chain release factor 2  52.77 
 
 		 363 aa  379  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.785261  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09203  putative peptide chain release factor  58.03 
 
 		 316 aa  372  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.165955  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0209  peptide chain release factor 2  52.75 
 
 		 381 aa  368  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2538  peptide chain release factor 2  52.48 
 
 		 363 aa  370  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1305  LigA  49.45 
 
 		 371 aa  365  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  50 
 
 		 365 aa  366  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  49.15 
 
 		 364 aa  363  2e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  49.72 
 
 		 367 aa  360  2e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  48.58 
 
 		 364 aa  359  4e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4083  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  48.86 
 
 		 365 aa  357  1.9999999999999998e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.963626  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  48.74 
 
 		 365 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  48.74 
 
 		 365 aa  355  1e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  48.74 
 
 		 365 aa  355  1e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  48.74 
 
 		 365 aa  355  1e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  49.3 
 
 		 365 aa  354  1e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  49.01 
 
 		 365 aa  353  4e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  47.86 
 
 		 367 aa  352  8e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  47.86 
 
 		 367 aa  352  8e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  47.34 
 
 		 459 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  48.46 
 
 		 365 aa  351  8.999999999999999e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  48.47 
 
 		 365 aa  350  2e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  48.16 
 
 		 365 aa  348  7e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  47.58 
 
 		 367 aa  348  7e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0023  peptide chain release factor 2  54.22 
 
 		 312 aa  348  8e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000581574  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1823  peptide chain release factor 2  49.15 
 
 		 374 aa  348  1e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366518  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  48.73 
 
 		 365 aa  347  2e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0479  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  46.99 
 
 		 365 aa  342  5e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  48.45 
 
 		 366 aa  341  9e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0895  hypothetical protein  47.03 
 
 		 367 aa  340  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0852209 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0960  hypothetical protein  46.74 
 
 		 367 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0655613 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1805  peptide chain release factor 2  49.28 
 
 		 354 aa  339  4e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  46.76 
 
 		 371 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  46.18 
 
 		 367 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  48.71 
 
 		 372 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  46.76 
 
 		 366 aa  336  2.9999999999999997e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  50.58 
 
 		 379 aa  337  2.9999999999999997e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  49.27 
 
 		 349 aa  335  5e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1216  peptide chain release factor 2  49.42 
 
 		 347 aa  335  5.999999999999999e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000777998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3791  hypothetical protein  47.29 
 
 		 367 aa  335  7e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.914403  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0486  peptide chain release factor 2  48.67 
 
 		 349 aa  335  7.999999999999999e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.289866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  47.49 
 
 		 359 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  47.2 
 
 		 391 aa  334  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1471  peptide chain release factor 2  48.38 
 
 		 349 aa  333  2e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2553  peptide chain release factor 2  61.38 
 
 		 254 aa  333  2e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.333677  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  48.16 
 
 		 372 aa  333  2e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  49.26 
 
 		 349 aa  333  3e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0939  hypothetical protein  46.31 
 
 		 365 aa  333  3e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0179192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  47.98 
 
 		 365 aa  332  5e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 		 364 aa  332  6e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  45.4 
 
 		 354 aa  332  6e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  47.73 
 
 		 366 aa  332  8e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2248  hypothetical protein  46.61 
 
 		 367 aa  331  9e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2758  peptide chain release factor 2  46.61 
 
 		 367 aa  331  9e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  47.49 
 
 		 349 aa  331  1e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  46.9 
 
 		 391 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  46.9 
 
 		 391 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  47.2 
 
 		 406 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  46.9 
 
 		 391 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  46.59 
 
 		 362 aa  330  2e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  48.83 
 
 		 361 aa  330  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  46.7 
 
 		 373 aa  330  3e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  47.29 
 
 		 375 aa  329  4e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3420  hypothetical protein  47.16 
 
 		 365 aa  328  7e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2878  peptide chain release factor 2  48.54 
 
 		 364 aa  328  8e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  45.85 
 
 		 369 aa  328  9e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  46.88 
 
 		 364 aa  328  1.0000000000000001e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  45.51 
 
 		 417 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  47.88 
 
 		 375 aa  327  2.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1036  peptide chain release factor 2  46.61 
 
 		 357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3265  peptide chain release factor 2  48.38 
 
 		 386 aa  327  3e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.337928  hitchhiker  0.000000190914 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  45.2 
 
 		 372 aa  326  3e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  46.31 
 
 		 357 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2380  peptide chain release factor 2  62.2 
 
 		 249 aa  325  5e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  45.33 
 
 		 380 aa  325  7e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  47.21 
 
 		 375 aa  325  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  45.04 
 
 		 380 aa  324  1e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0302  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  47.31 
 
 		 365 aa  324  2e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2844  peptide chain release factor 2  48.11 
 
 		 325 aa  323  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1069  peptide chain release factor 2  46.49 
 
 		 347 aa  324  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2271  peptide chain release factor 2  52.92 
 
 		 310 aa  323  3e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  44.76 
 
 		 380 aa  322  5e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  49.21 
 
 		 332 aa  322  5e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  44.23 
 
 		 367 aa  322  6e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  45.04 
 
 		 380 aa  322  6e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3615  peptide chain release factor 2  47.8 
 
 		 352 aa  322  8e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0840  peptide chain release factor 2  46.31 
 
 		 352 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  50.94 
 
 		 332 aa  321  9.999999999999999e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  46.74 
 
 		 378 aa  321  9.999999999999999e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  47.58 
 
 		 357 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  47.74 
 
 		 371 aa  320  1.9999999999999998e-86  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0554  peptide chain release factor 2  47.04 
 
 		 372 aa  320  1.9999999999999998e-86  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0168531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>