More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09203 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_09203  putative peptide chain release factor  100 
 
 		 316 aa  654    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.165955  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1899  peptide chain release factor 2  70.7 
 
 		 367 aa  479  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0199155  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2553  peptide chain release factor 2  79.13 
 
 		 254 aa  428  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.333677  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3994  peptide chain release factor 2  60.66 
 
 		 357 aa  378  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0498322  normal  0.718153 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0282  hypothetical protein  58.36 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394775 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5492  peptide chain release factor 2  58.63 
 
 		 362 aa  372  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0496262 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1048  hypothetical protein  55.08 
 
 		 332 aa  369  1e-101  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5751  hypothetical protein  58.03 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2832  peptide chain release factor 2  53.11 
 
 		 358 aa  345  5e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.909356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0238  peptide chain release factor 2  51.3 
 
 		 363 aa  308  8e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000385966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  49.35 
 
 		 365 aa  305  7e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2784  peptide chain release factor 2  50.32 
 
 		 363 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.785261  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2031  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 363 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0138456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  49.84 
 
 		 367 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  54.15 
 
 		 365 aa  301  7.000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1305  LigA  46.82 
 
 		 371 aa  301  1e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  49.84 
 
 		 323 aa  300  3e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  49.83 
 
 		 371 aa  299  4e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2538  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 363 aa  299  4e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1030  peptide chain release factor 2 protein  51.07 
 
 		 300 aa  298  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.235991  normal  0.771675 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  48.71 
 
 		 326 aa  298  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  50.71 
 
 		 391 aa  297  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  48.42 
 
 		 343 aa  298  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  52.8 
 
 		 369 aa  297  1e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  49.3 
 
 		 459 aa  297  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 367 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 367 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  50 
 
 		 367 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0023  peptide chain release factor 2  48.56 
 
 		 312 aa  296  4e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000581574  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2844  peptide chain release factor 2  48.63 
 
 		 325 aa  295  5e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0209  peptide chain release factor 2  50.65 
 
 		 381 aa  295  6e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  47.9 
 
 		 317 aa  295  6e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  49.17 
 
 		 369 aa  295  6e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  49.17 
 
 		 331 aa  295  9e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  49.51 
 
 		 380 aa  295  9e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  48.95 
 
 		 359 aa  294  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 391 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  46.5 
 
 		 329 aa  294  1e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 391 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 391 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  47.49 
 
 		 375 aa  293  2e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1562  peptide chain release factor 2  53.36 
 
 		 280 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271557  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  49.19 
 
 		 380 aa  293  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  54.15 
 
 		 349 aa  293  3e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  48.86 
 
 		 380 aa  292  4e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  48.86 
 
 		 380 aa  292  4e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1471  peptide chain release factor 2  53.54 
 
 		 349 aa  293  4e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0397  peptide chain release factor 2  54.9 
 
 		 302 aa  292  5e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  49.65 
 
 		 417 aa  292  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1036  peptide chain release factor 2  49.29 
 
 		 357 aa  292  6e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0456  peptide chain release factor 2  54.9 
 
 		 338 aa  292  6e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.454858  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  48.54 
 
 		 326 aa  291  7e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  48.54 
 
 		 326 aa  291  7e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  48.54 
 
 		 326 aa  291  8e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  49.31 
 
 		 364 aa  291  8e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  49.64 
 
 		 406 aa  291  9e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  47.85 
 
 		 371 aa  291  1e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  49.66 
 
 		 349 aa  291  1e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1823  peptide chain release factor 2  53.33 
 
 		 374 aa  291  1e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366518  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0328  peptide chain release factor 2  45.39 
 
 		 362 aa  290  2e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2271  peptide chain release factor 2  50.53 
 
 		 310 aa  290  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  53.36 
 
 		 364 aa  289  3e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0486  peptide chain release factor 2  52.29 
 
 		 349 aa  290  3e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.289866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  53.41 
 
 		 369 aa  290  3e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  48.22 
 
 		 327 aa  290  3e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  53.36 
 
 		 379 aa  290  3e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  49.13 
 
 		 372 aa  288  7e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  48.18 
 
 		 366 aa  287  1e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  48.93 
 
 		 357 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  46.6 
 
 		 367 aa  287  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  49.18 
 
 		 371 aa  287  2e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4200  peptide chain release factor 2  49.01 
 
 		 323 aa  287  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  53.75 
 
 		 364 aa  287  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4083  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  50 
 
 		 365 aa  286  2.9999999999999996e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.963626  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  52.9 
 
 		 332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00072  peptide chain release factor 2  52.47 
 
 		 329 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  48.21 
 
 		 326 aa  286  4e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  48.36 
 
 		 364 aa  286  4e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  46.98 
 
 		 367 aa  285  5e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  50.81 
 
 		 367 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  48.97 
 
 		 349 aa  285  5.999999999999999e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  45.42 
 
 		 373 aa  285  5.999999999999999e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2248  hypothetical protein  49.29 
 
 		 367 aa  285  8e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2758  peptide chain release factor 2  49.29 
 
 		 367 aa  285  8e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1069  peptide chain release factor 2  50.36 
 
 		 347 aa  285  9e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.624401 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  47.4 
 
 		 365 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  47.4 
 
 		 365 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  47.4 
 
 		 365 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  47.4 
 
 		 365 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  47.4 
 
 		 365 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  49.13 
 
 		 374 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  49.47 
 
 		 325 aa  283  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  46.31 
 
 		 367 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2533  peptide chain release factor 2  51.92 
 
 		 375 aa  284  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1847  peptide chain release factor 2  49.29 
 
 		 300 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2274  peptide chain release factor 2  47.55 
 
 		 310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1153  peptide chain release factor 2  53.47 
 
 		 248 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449488  normal  0.0907567 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0923  peptide chain release factor 2  48.17 
 
 		 310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  48.17 
 
 		 365 aa  283  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3265  peptide chain release factor 2  49.11 
 
 		 386 aa  283  4.0000000000000003e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.337928  hitchhiker  0.000000190914 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>