79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3290 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3290  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 579 aa  1197    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7609  resolvase domain-containing protein  48.43 
 
 		 690 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.918322 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2088  recombinase  39.51 
 
 		 829 aa  362  7.0000000000000005e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.929661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4901  resolvase domain-containing protein  36.26 
 
 		 694 aa  323  6e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.954414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6949  resolvase domain-containing protein  36.26 
 
 		 694 aa  323  6e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7439  resolvase domain-containing protein  36.26 
 
 		 694 aa  323  6e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7628  resolvase domain-containing protein  36.26 
 
 		 694 aa  323  6e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616048 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4855  resolvase domain-containing protein  36.26 
 
 		 694 aa  323  6e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0344697  normal  0.666269 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2790  recombinase  35.1 
 
 		 692 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.359008  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1378  transposon orf3  35.71 
 
 		 694 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.416601  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0458  resolvase domain-containing protein  35.83 
 
 		 722 aa  294  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4395  resolvase-like protein  32.77 
 
 		 617 aa  257  4e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0415  recombinase  28.31 
 
 		 689 aa  253  6e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.030164 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4704  recombinase  28.31 
 
 		 689 aa  253  6e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.172912 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4640  recombinase  28.31 
 
 		 689 aa  253  6e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0165  excisionase/Xis, DNA-binding  32.9 
 
 		 685 aa  252  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3420  resolvase domain-containing protein  30.3 
 
 		 689 aa  251  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.408833  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4918  resolvase domain-containing protein  30.3 
 
 		 689 aa  251  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.79279 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3901  recombinase  31 
 
 		 689 aa  236  7e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3392  resolvase domain-containing protein  29.43 
 
 		 689 aa  200  7e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6777  resolvase domain-containing protein  38.19 
 
 		 656 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0338  Resolvase domain protein  31.31 
 
 		 385 aa  92  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0236836  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4797  Resolvase domain protein  31.31 
 
 		 385 aa  92  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8022  hypothetical protein  25.31 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  27.65 
 
 		 562 aa  61.2  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  24.63 
 
 		 540 aa  61.2  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  26.77 
 
 		 549 aa  56.2  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2537  recombinase  25.65 
 
 		 556 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  28.82 
 
 		 475 aa  55.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  25 
 
 		 516 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  25.52 
 
 		 494 aa  53.5  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  24.54 
 
 		 516 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3177  recombinase  23.08 
 
 		 548 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.560591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3227  recombinase  23.08 
 
 		 548 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.371696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  25.58 
 
 		 534 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 584 aa  52.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3165  recombinase  23.08 
 
 		 548 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.944901  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  25.93 
 
 		 564 aa  53.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3843  Resolvase domain  24.91 
 
 		 707 aa  52  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2577  Resolvase domain protein  23.55 
 
 		 603 aa  51.2  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.551292 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2470  recombinase  41.1 
 
 		 100 aa  51.2  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  24.54 
 
 		 541 aa  50.8  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  23.86 
 
 		 565 aa  50.4  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  25.23 
 
 		 534 aa  50.4  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  22.87 
 
 		 429 aa  50.4  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0612  recombinase  29.53 
 
 		 656 aa  50.4  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  25.23 
 
 		 534 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  25.23 
 
 		 534 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2909  recombinase  25.56 
 
 		 465 aa  49.7  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  25.7 
 
 		 534 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  22.9 
 
 		 601 aa  50.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  34.02 
 
 		 586 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  23.27 
 
 		 552 aa  48.9  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  22.9 
 
 		 578 aa  49.3  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  22.43 
 
 		 597 aa  49.3  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  25.55 
 
 		 505 aa  48.9  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  25.23 
 
 		 534 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  25.12 
 
 		 535 aa  48.9  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  21.78 
 
 		 539 aa  49.7  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  25.23 
 
 		 537 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  24.88 
 
 		 479 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3036  recombinase  25.29 
 
 		 548 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  26.75 
 
 		 555 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  28.48 
 
 		 561 aa  47.4  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  24.31 
 
 		 551 aa  46.6  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  26.64 
 
 		 578 aa  47  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  24.16 
 
 		 522 aa  46.6  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  25.15 
 
 		 549 aa  46.2  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3094  recombinase  26.46 
 
 		 386 aa  45.4  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  29.09 
 
 		 540 aa  45.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  22.74 
 
 		 509 aa  45.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  24.26 
 
 		 504 aa  45.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  23.79 
 
 		 558 aa  45.1  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  26.94 
 
 		 537 aa  44.7  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0282  resolvase-like protein  51.28 
 
 		 184 aa  45.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  24.25 
 
 		 528 aa  44.3  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  25.47 
 
 		 546 aa  44.3  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  36.67 
 
 		 551 aa  43.9  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  24.25 
 
 		 528 aa  43.9  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>