149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1378 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1378  transposon orf3  100 
 
 		 694 aa  1414    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.416601  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2790  recombinase  55.44 
 
 		 692 aa  744    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.359008  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4855  resolvase domain-containing protein  74.06 
 
 		 694 aa  1085    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0344697  normal  0.666269 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4901  resolvase domain-containing protein  74.06 
 
 		 694 aa  1085    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.954414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6949  resolvase domain-containing protein  74.06 
 
 		 694 aa  1085    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7439  resolvase domain-containing protein  74.06 
 
 		 694 aa  1085    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7628  resolvase domain-containing protein  74.06 
 
 		 694 aa  1085    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616048 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7609  resolvase domain-containing protein  41.59 
 
 		 690 aa  484  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.918322 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2088  recombinase  41.71 
 
 		 829 aa  398  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.929661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3901  recombinase  36.07 
 
 		 689 aa  357  5e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0458  resolvase domain-containing protein  37.13 
 
 		 722 aa  354  4e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4918  resolvase domain-containing protein  35.91 
 
 		 689 aa  353  5e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.79279 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3420  resolvase domain-containing protein  35.91 
 
 		 689 aa  353  5e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.408833  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0165  excisionase/Xis, DNA-binding  35.6 
 
 		 685 aa  351  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4640  recombinase  36.16 
 
 		 689 aa  339  9.999999999999999e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4704  recombinase  36.16 
 
 		 689 aa  339  9.999999999999999e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.172912 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0415  recombinase  36.16 
 
 		 689 aa  339  9.999999999999999e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.030164 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6777  resolvase domain-containing protein  41.5 
 
 		 656 aa  305  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3290  resolvase domain-containing protein  35.71 
 
 		 579 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4395  resolvase-like protein  33.55 
 
 		 617 aa  283  8.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3392  resolvase domain-containing protein  34.58 
 
 		 689 aa  281  2e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0338  Resolvase domain protein  39.16 
 
 		 385 aa  204  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0236836  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4797  Resolvase domain protein  39.16 
 
 		 385 aa  204  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0282  resolvase-like protein  49.7 
 
 		 184 aa  152  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3478  hypothetical protein  38.67 
 
 		 153 aa  94.7  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.271395 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  25.49 
 
 		 553 aa  87.4  7e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  24.01 
 
 		 528 aa  85.5  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  23.61 
 
 		 528 aa  84  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  22.22 
 
 		 558 aa  80.1  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  21.28 
 
 		 527 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  23.02 
 
 		 606 aa  78.6  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  23.02 
 
 		 606 aa  78.6  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3073  hypothetical protein  41.59 
 
 		 125 aa  78.6  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.706022  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  24.1 
 
 		 525 aa  78.2  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  24.14 
 
 		 525 aa  76.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2176  site-specific recombinase, putative  22.2 
 
 		 612 aa  74.7  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  25.53 
 
 		 534 aa  73.9  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  25 
 
 		 534 aa  72  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  23.82 
 
 		 504 aa  70.9  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  24.69 
 
 		 534 aa  69.7  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  24.69 
 
 		 537 aa  70.1  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  22.22 
 
 		 522 aa  70.1  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  24.69 
 
 		 534 aa  70.1  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  24.69 
 
 		 534 aa  69.7  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8022  hypothetical protein  28.97 
 
 		 279 aa  68.9  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  24.69 
 
 		 537 aa  68.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  23.55 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  21.95 
 
 		 535 aa  68.2  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  23.33 
 
 		 445 aa  66.6  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  23.03 
 
 		 445 aa  66.6  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  22.95 
 
 		 526 aa  67  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  22.02 
 
 		 511 aa  66.6  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0480  recombinase  22.8 
 
 		 515 aa  67  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63808  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  24.38 
 
 		 534 aa  66.6  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  23.49 
 
 		 516 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  22.62 
 
 		 445 aa  65.1  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  20.91 
 
 		 521 aa  65.1  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  23.19 
 
 		 516 aa  65.1  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  20 
 
 		 519 aa  64.7  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  20.3 
 
 		 520 aa  64.3  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  18.9 
 
 		 521 aa  63.9  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  20.83 
 
 		 519 aa  62.8  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  19.26 
 
 		 498 aa  63.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1501  hypothetical protein  23.73 
 
 		 512 aa  62.4  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.420622  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1491  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  20.07 
 
 		 506 aa  62.4  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  23.61 
 
 		 540 aa  62  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  21.35 
 
 		 552 aa  61.2  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  20.97 
 
 		 526 aa  60.8  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  20.79 
 
 		 542 aa  60.8  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0420  resolvase domain-containing protein  23.72 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000164103  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  21.05 
 
 		 522 aa  60.1  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  20.79 
 
 		 542 aa  60.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  20.79 
 
 		 542 aa  60.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  25.14 
 
 		 562 aa  59.7  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  22.17 
 
 		 475 aa  59.3  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2470  recombinase  38.37 
 
 		 100 aa  58.5  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  25.16 
 
 		 485 aa  58.5  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  21.33 
 
 		 518 aa  56.6  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  21.79 
 
 		 524 aa  57  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  20.44 
 
 		 535 aa  57  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  20.76 
 
 		 429 aa  57  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  22.93 
 
 		 460 aa  56.6  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  22.32 
 
 		 500 aa  56.6  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  25.07 
 
 		 549 aa  55.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2498  cassette chromosome recombinase A  23.46 
 
 		 449 aa  55.5  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0049  resolvase domain-containing protein  23.46 
 
 		 449 aa  55.5  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0050  resolvase domain-containing protein  23.46 
 
 		 449 aa  55.5  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0320  resolvase domain-containing protein  25.27 
 
 		 531 aa  55.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.140685  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  24.59 
 
 		 515 aa  55.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  23.36 
 
 		 523 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  20.64 
 
 		 523 aa  54.7  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  25.51 
 
 		 738 aa  54.3  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  22.61 
 
 		 441 aa  54.3  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  21.9 
 
 		 431 aa  54.3  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  23.57 
 
 		 539 aa  54.3  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  22.67 
 
 		 586 aa  54.3  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  21.31 
 
 		 523 aa  53.9  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  21.94 
 
 		 441 aa  53.9  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  22.03 
 
 		 543 aa  53.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3842  Resolvase domain  25.85 
 
 		 626 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445575  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>