140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0458 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0458  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 722 aa  1448    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6777  resolvase domain-containing protein  60.53 
 
 		 656 aa  486  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2790  recombinase  40 
 
 		 692 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.359008  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7609  resolvase domain-containing protein  36.35 
 
 		 690 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.918322 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4855  resolvase domain-containing protein  39.6 
 
 		 694 aa  385  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0344697  normal  0.666269 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4901  resolvase domain-containing protein  39.6 
 
 		 694 aa  385  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.954414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6949  resolvase domain-containing protein  39.6 
 
 		 694 aa  385  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7439  resolvase domain-containing protein  39.6 
 
 		 694 aa  385  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7628  resolvase domain-containing protein  39.6 
 
 		 694 aa  385  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616048 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1378  transposon orf3  37.3 
 
 		 694 aa  374  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.416601  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3392  resolvase domain-containing protein  39.71 
 
 		 689 aa  343  5.999999999999999e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0165  excisionase/Xis, DNA-binding  35.83 
 
 		 685 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3901  recombinase  35.16 
 
 		 689 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4640  recombinase  39.53 
 
 		 689 aa  321  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4704  recombinase  39.53 
 
 		 689 aa  321  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.172912 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0415  recombinase  39.53 
 
 		 689 aa  321  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.030164 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4918  resolvase domain-containing protein  38.6 
 
 		 689 aa  317  4e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.79279 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3420  resolvase domain-containing protein  38.6 
 
 		 689 aa  317  4e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.408833  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3290  resolvase domain-containing protein  35.83 
 
 		 579 aa  312  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2088  recombinase  42.15 
 
 		 829 aa  311  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.929661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4395  resolvase-like protein  34.5 
 
 		 617 aa  292  2e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0338  Resolvase domain protein  43.32 
 
 		 385 aa  242  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0236836  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4797  Resolvase domain protein  43.32 
 
 		 385 aa  242  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0282  resolvase-like protein  56.44 
 
 		 184 aa  159  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3478  hypothetical protein  42.55 
 
 		 153 aa  104  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.271395 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  28.61 
 
 		 485 aa  95.5  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  24.55 
 
 		 505 aa  88.2  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  23 
 
 		 534 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3073  hypothetical protein  44.21 
 
 		 125 aa  77.8  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.706022  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  25.18 
 
 		 534 aa  73.9  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  24.94 
 
 		 537 aa  71.6  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  24.7 
 
 		 534 aa  71.2  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  22.39 
 
 		 528 aa  70.5  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  24.94 
 
 		 534 aa  70.1  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  24.7 
 
 		 534 aa  70.1  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  23.25 
 
 		 528 aa  69.3  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  26.13 
 
 		 534 aa  69.3  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  24.65 
 
 		 534 aa  68.6  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4207  Recombinase  24.28 
 
 		 506 aa  68.2  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0141412 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  25.37 
 
 		 546 aa  65.5  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0480  recombinase  24.59 
 
 		 515 aa  63.9  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63808  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  21.92 
 
 		 498 aa  62.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  21.19 
 
 		 527 aa  63.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  21.43 
 
 		 552 aa  62.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2176  site-specific recombinase, putative  21.09 
 
 		 612 aa  62.4  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  27.56 
 
 		 545 aa  62.4  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8022  hypothetical protein  36.36 
 
 		 279 aa  62.4  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  22.16 
 
 		 484 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  24.9 
 
 		 537 aa  62  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  19.59 
 
 		 542 aa  61.6  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  19.59 
 
 		 542 aa  61.6  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0394  Recombinase  20.71 
 
 		 541 aa  62  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.018734 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  19.59 
 
 		 542 aa  61.2  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  22.16 
 
 		 484 aa  61.2  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  25.62 
 
 		 500 aa  59.3  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  21.55 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3623  recombinase  22.56 
 
 		 515 aa  58.9  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  23.21 
 
 		 558 aa  58.5  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4702  hypothetical protein  37.97 
 
 		 113 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.452078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  24.94 
 
 		 550 aa  58.2  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  20.73 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  19.64 
 
 		 521 aa  57.8  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  22.26 
 
 		 535 aa  57.4  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4166  recombinase  28.31 
 
 		 460 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167071  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0494  resolvase, N-terminal domain protein  28.51 
 
 		 321 aa  56.2  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.177718 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  21.74 
 
 		 447 aa  55.1  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  22.8 
 
 		 537 aa  54.7  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1608  putative resolvase  22.08 
 
 		 502 aa  54.7  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4417  recombinase  21.7 
 
 		 517 aa  54.3  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1345  recombinase  23.92 
 
 		 515 aa  54.3  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.667193 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  24.07 
 
 		 586 aa  53.9  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  21.53 
 
 		 540 aa  53.9  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  22.29 
 
 		 504 aa  52.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  22.73 
 
 		 462 aa  53.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  24.39 
 
 		 443 aa  52.8  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  26.91 
 
 		 445 aa  53.1  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  23.89 
 
 		 525 aa  53.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  21.6 
 
 		 516 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3310  recombinase family  20.82 
 
 		 501 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.19852  hitchhiker  0.000000416205 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  20.92 
 
 		 445 aa  52.4  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  27.04 
 
 		 578 aa  52.4  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  21.62 
 
 		 544 aa  52  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  21.73 
 
 		 546 aa  52  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  22.55 
 
 		 516 aa  52  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3568  Resolvase domain protein  25.35 
 
 		 484 aa  51.6  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  23.34 
 
 		 500 aa  51.6  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  23.5 
 
 		 525 aa  51.6  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  25.52 
 
 		 441 aa  51.2  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  22.33 
 
 		 462 aa  51.2  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2577  Resolvase domain protein  19.46 
 
 		 603 aa  51.2  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.551292 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  24.14 
 
 		 441 aa  51.2  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  20.15 
 
 		 522 aa  50.8  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1501  hypothetical protein  23.65 
 
 		 512 aa  50.1  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.420622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4587  DNA recombinase, putative  28.77 
 
 		 486 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4608  DNA recombinase, putative  25.27 
 
 		 511 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  24.95 
 
 		 509 aa  50.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4607  resolvase-like protein  29.26 
 
 		 476 aa  50.4  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2236  Recombinase  22.64 
 
 		 430 aa  50.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3843  Resolvase domain  25.5 
 
 		 707 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  25.5 
 
 		 613 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>