117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3392 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009468  Acry_3392  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 689 aa  1386    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3901  recombinase  41.77 
 
 		 689 aa  499  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0165  excisionase/Xis, DNA-binding  42.08 
 
 		 685 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0338  Resolvase domain protein  76.47 
 
 		 385 aa  490  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0236836  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4797  Resolvase domain protein  76.47 
 
 		 385 aa  490  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4918  resolvase domain-containing protein  40.63 
 
 		 689 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.79279 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3420  resolvase domain-containing protein  40.63 
 
 		 689 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.408833  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4395  resolvase-like protein  42.42 
 
 		 617 aa  436  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4640  recombinase  39.27 
 
 		 689 aa  413  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4704  recombinase  39.27 
 
 		 689 aa  413  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.172912 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0415  recombinase  39.27 
 
 		 689 aa  413  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.030164 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0458  resolvase domain-containing protein  39.89 
 
 		 722 aa  334  3e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2790  recombinase  35.01 
 
 		 692 aa  318  1e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.359008  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7609  resolvase domain-containing protein  33.04 
 
 		 690 aa  307  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.918322 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4855  resolvase domain-containing protein  32.41 
 
 		 694 aa  297  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0344697  normal  0.666269 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4901  resolvase domain-containing protein  32.41 
 
 		 694 aa  297  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.954414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6949  resolvase domain-containing protein  32.41 
 
 		 694 aa  297  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7439  resolvase domain-containing protein  32.41 
 
 		 694 aa  297  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7628  resolvase domain-containing protein  32.41 
 
 		 694 aa  297  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616048 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1378  transposon orf3  34.58 
 
 		 694 aa  295  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.416601  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6777  resolvase domain-containing protein  39.28 
 
 		 656 aa  276  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2088  recombinase  36.25 
 
 		 829 aa  264  4e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.929661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3511  hypothetical protein  57.3 
 
 		 234 aa  239  8e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161904  normal  0.581305 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3290  resolvase domain-containing protein  30 
 
 		 579 aa  209  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3478  hypothetical protein  72.14 
 
 		 153 aa  193  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.271395 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0282  resolvase-like protein  52.44 
 
 		 184 aa  163  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8022  hypothetical protein  34.29 
 
 		 279 aa  110  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  21.83 
 
 		 558 aa  84  0.000000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3073  hypothetical protein  44.68 
 
 		 125 aa  83.6  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.706022  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  26.67 
 
 		 586 aa  78.2  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8272  insertion sequence ATP-binding protein  34.06 
 
 		 169 aa  74.7  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.675942  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  22.54 
 
 		 528 aa  72.8  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  22.2 
 
 		 528 aa  71.6  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  21.29 
 
 		 527 aa  69.7  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  25.44 
 
 		 534 aa  69.7  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  24.66 
 
 		 534 aa  68.2  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  24.94 
 
 		 485 aa  67.8  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  24.4 
 
 		 534 aa  67  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  24.4 
 
 		 534 aa  67  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  24.13 
 
 		 534 aa  66.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  24.4 
 
 		 537 aa  66.6  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  23.5 
 
 		 537 aa  65.1  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  25.52 
 
 		 641 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  23.86 
 
 		 534 aa  63.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  23.61 
 
 		 534 aa  63.2  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  24.08 
 
 		 535 aa  62.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  21.6 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  24.45 
 
 		 525 aa  60.1  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4166  recombinase  29.93 
 
 		 460 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  25.27 
 
 		 516 aa  60.1  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  25.27 
 
 		 516 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  21.92 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  19.83 
 
 		 447 aa  58.2  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  23.77 
 
 		 539 aa  57.8  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  21.81 
 
 		 500 aa  57.8  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  20.16 
 
 		 542 aa  57.4  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  20.16 
 
 		 542 aa  57.4  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  20.16 
 
 		 542 aa  57  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  25.19 
 
 		 525 aa  57  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  22.82 
 
 		 521 aa  56.6  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  23.03 
 
 		 500 aa  56.2  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  24.83 
 
 		 524 aa  56.6  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  22.58 
 
 		 415 aa  55.8  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  23.56 
 
 		 522 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0320  resolvase domain-containing protein  22.99 
 
 		 531 aa  55.1  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.140685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  22.38 
 
 		 545 aa  54.3  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  19.6 
 
 		 511 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  24.93 
 
 		 546 aa  52.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  18.3 
 
 		 484 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  21.26 
 
 		 498 aa  53.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  26.36 
 
 		 510 aa  52  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  20.06 
 
 		 489 aa  52.4  0.00003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  19.33 
 
 		 484 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2470  recombinase  34 
 
 		 100 aa  52  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  23.76 
 
 		 540 aa  51.6  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0394  Recombinase  21.78 
 
 		 541 aa  51.6  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.018734 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3805  resolvase-like protein  23.03 
 
 		 526 aa  51.2  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296715  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0913  resolvase domain-containing protein  25.71 
 
 		 554 aa  51.2  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.955385  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  20.9 
 
 		 474 aa  50.8  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  20.61 
 
 		 494 aa  50.8  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  22.29 
 
 		 500 aa  50.1  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1250  resolvase  22.46 
 
 		 524 aa  50.1  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  20.63 
 
 		 445 aa  50.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  21.62 
 
 		 500 aa  50.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2176  site-specific recombinase, putative  21.54 
 
 		 612 aa  49.3  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  21.14 
 
 		 462 aa  49.3  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  24.19 
 
 		 412 aa  50.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  21.88 
 
 		 475 aa  49.7  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  22.16 
 
 		 540 aa  49.7  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  21.43 
 
 		 505 aa  49.3  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0480  recombinase  25.27 
 
 		 515 aa  48.9  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63808  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  25.57 
 
 		 522 aa  48.5  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2519  Resolvase domain protein  23.69 
 
 		 494 aa  47.8  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.90325  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  22.51 
 
 		 506 aa  47.8  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4417  recombinase  20.63 
 
 		 517 aa  47.4  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  24.22 
 
 		 564 aa  47  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  23.87 
 
 		 522 aa  47.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  20.94 
 
 		 552 aa  47.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  24.12 
 
 		 504 aa  47  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  21.92 
 
 		 525 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>