25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3478 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3478  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  311  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.271395 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3392  resolvase domain-containing protein  72.14 
 
 		 689 aa  193  7e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4797  Resolvase domain protein  64.71 
 
 		 385 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0338  Resolvase domain protein  64.71 
 
 		 385 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0236836  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3901  recombinase  42.28 
 
 		 689 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0415  recombinase  44.78 
 
 		 689 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.030164 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4640  recombinase  44.78 
 
 		 689 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4704  recombinase  44.78 
 
 		 689 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.172912 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0165  excisionase/Xis, DNA-binding  42.65 
 
 		 685 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4918  resolvase domain-containing protein  43.38 
 
 		 689 aa  105  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.79279 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3420  resolvase domain-containing protein  43.38 
 
 		 689 aa  105  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.408833  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0458  resolvase domain-containing protein  42.55 
 
 		 722 aa  104  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6777  resolvase domain-containing protein  43.8 
 
 		 656 aa  104  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0282  resolvase-like protein  43.28 
 
 		 184 aa  99.4  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2790  recombinase  40.43 
 
 		 692 aa  99.4  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.359008  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4855  resolvase domain-containing protein  39.29 
 
 		 694 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0344697  normal  0.666269 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4901  resolvase domain-containing protein  39.29 
 
 		 694 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.954414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6949  resolvase domain-containing protein  39.29 
 
 		 694 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7439  resolvase domain-containing protein  39.29 
 
 		 694 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7628  resolvase domain-containing protein  39.29 
 
 		 694 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616048 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1378  transposon orf3  38.67 
 
 		 694 aa  94.7  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.416601  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7609  resolvase domain-containing protein  36.11 
 
 		 690 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.918322 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2088  recombinase  39.86 
 
 		 829 aa  87  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.929661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4395  resolvase-like protein  43.94 
 
 		 617 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3073  hypothetical protein  34.74 
 
 		 125 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.706022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>