73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4395 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3901  recombinase  59.84 
 
 		 689 aa  724    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0165  excisionase/Xis, DNA-binding  57.44 
 
 		 685 aa  694    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4395  resolvase-like protein  100 
 
 		 617 aa  1252    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3420  resolvase domain-containing protein  42.45 
 
 		 689 aa  448  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.408833  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4918  resolvase domain-containing protein  42.45 
 
 		 689 aa  448  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.79279 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0415  recombinase  43.22 
 
 		 689 aa  448  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.030164 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4704  recombinase  43.22 
 
 		 689 aa  448  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.172912 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4640  recombinase  43.22 
 
 		 689 aa  448  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3392  resolvase domain-containing protein  42.16 
 
 		 689 aa  422  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2790  recombinase  33.67 
 
 		 692 aa  296  6e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.359008  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6949  resolvase domain-containing protein  35.21 
 
 		 694 aa  296  8e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4901  resolvase domain-containing protein  35.21 
 
 		 694 aa  296  8e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.954414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7439  resolvase domain-containing protein  35.21 
 
 		 694 aa  296  8e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7628  resolvase domain-containing protein  35.21 
 
 		 694 aa  296  8e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616048 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4855  resolvase domain-containing protein  35.21 
 
 		 694 aa  296  8e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0344697  normal  0.666269 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1378  transposon orf3  33.55 
 
 		 694 aa  291  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.416601  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7609  resolvase domain-containing protein  33.28 
 
 		 690 aa  281  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.918322 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0458  resolvase domain-containing protein  34.29 
 
 		 722 aa  272  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3290  resolvase domain-containing protein  32.95 
 
 		 579 aa  264  4e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2088  recombinase  33 
 
 		 829 aa  228  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.929661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6777  resolvase domain-containing protein  38.96 
 
 		 656 aa  228  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4797  Resolvase domain protein  42.86 
 
 		 385 aa  200  7.999999999999999e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0338  Resolvase domain protein  42.86 
 
 		 385 aa  200  7.999999999999999e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0236836  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8022  hypothetical protein  39.3 
 
 		 279 aa  139  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0282  resolvase-like protein  61.62 
 
 		 184 aa  124  7e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8272  insertion sequence ATP-binding protein  39.16 
 
 		 169 aa  99  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.675942  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3511  hypothetical protein  29.7 
 
 		 234 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161904  normal  0.581305 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  22.8 
 
 		 528 aa  71.6  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  24.44 
 
 		 528 aa  70.9  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3478  hypothetical protein  43.94 
 
 		 153 aa  66.6  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.271395 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  25.28 
 
 		 485 aa  65.9  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  23.43 
 
 		 498 aa  64.3  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  24.5 
 
 		 540 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  24.67 
 
 		 586 aa  57  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  20.87 
 
 		 534 aa  56.2  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  26.77 
 
 		 535 aa  54.7  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2176  site-specific recombinase, putative  21.95 
 
 		 612 aa  53.1  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  22.87 
 
 		 522 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  23.96 
 
 		 524 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  21.74 
 
 		 521 aa  52  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  25.27 
 
 		 641 aa  52  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  22.64 
 
 		 475 aa  51.2  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2051  resolvase domain-containing protein  25.6 
 
 		 494 aa  50.8  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3310  recombinase family  19.38 
 
 		 501 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.19852  hitchhiker  0.000000416205 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37130  Recombinase  24.9 
 
 		 520 aa  49.3  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  21.4 
 
 		 665 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  23.02 
 
 		 606 aa  48.5  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  23.02 
 
 		 606 aa  48.5  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  21.45 
 
 		 500 aa  47.8  0.0005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  23.46 
 
 		 479 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  22.71 
 
 		 447 aa  48.1  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  22.07 
 
 		 484 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  23.62 
 
 		 509 aa  47  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  22.3 
 
 		 537 aa  47  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  19.93 
 
 		 522 aa  47  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  22.3 
 
 		 484 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  20.19 
 
 		 489 aa  45.8  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  19.6 
 
 		 527 aa  46.2  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3888  Recombinase  23.76 
 
 		 488 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489882  normal  0.0312397 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  21.4 
 
 		 537 aa  45.8  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  22.22 
 
 		 539 aa  45.1  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  30 
 
 		 504 aa  45.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  20.52 
 
 		 421 aa  45.1  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  20.85 
 
 		 534 aa  44.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  20.85 
 
 		 534 aa  44.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  21.84 
 
 		 445 aa  44.3  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  20.65 
 
 		 462 aa  44.3  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  21.2 
 
 		 534 aa  44.7  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  20.85 
 
 		 534 aa  44.3  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  19.67 
 
 		 542 aa  44.3  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  21.33 
 
 		 534 aa  44.3  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  19.67 
 
 		 542 aa  44.3  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  22.56 
 
 		 521 aa  44.3  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>