136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6777 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6777  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 656 aa  1308    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0458  resolvase domain-containing protein  59.65 
 
 		 722 aa  479  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2790  recombinase  43.72 
 
 		 692 aa  354  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.359008  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7609  resolvase domain-containing protein  40.22 
 
 		 690 aa  326  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.918322 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4855  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 694 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0344697  normal  0.666269 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4901  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 694 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.954414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6949  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 694 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7439  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 694 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7628  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 694 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616048 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1378  transposon orf3  41.5 
 
 		 694 aa  310  4e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.416601  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3901  recombinase  40.54 
 
 		 689 aa  289  9e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0165  excisionase/Xis, DNA-binding  41.39 
 
 		 685 aa  283  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4918  resolvase domain-containing protein  39.4 
 
 		 689 aa  275  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.79279 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3420  resolvase domain-containing protein  39.4 
 
 		 689 aa  275  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.408833  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3392  resolvase domain-containing protein  39.28 
 
 		 689 aa  274  5.000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4640  recombinase  40.09 
 
 		 689 aa  264  4e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4704  recombinase  40.09 
 
 		 689 aa  264  4e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.172912 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0415  recombinase  40.09 
 
 		 689 aa  264  4e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.030164 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2088  recombinase  39.86 
 
 		 829 aa  261  4e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.929661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0338  Resolvase domain protein  44.28 
 
 		 385 aa  237  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0236836  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4797  Resolvase domain protein  44.28 
 
 		 385 aa  237  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4395  resolvase-like protein  39.24 
 
 		 617 aa  232  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3290  resolvase domain-containing protein  38.19 
 
 		 579 aa  212  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0282  resolvase-like protein  55.49 
 
 		 184 aa  162  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3478  hypothetical protein  43.8 
 
 		 153 aa  104  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.271395 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  28.28 
 
 		 485 aa  82  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  25.07 
 
 		 550 aa  80.9  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  23.04 
 
 		 528 aa  75.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  24.68 
 
 		 549 aa  75.5  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  24.09 
 
 		 534 aa  75.1  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  24.33 
 
 		 534 aa  74.7  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  22.97 
 
 		 528 aa  74.7  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3073  hypothetical protein  43.16 
 
 		 125 aa  74.3  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.706022  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  23.84 
 
 		 537 aa  73.9  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  24.01 
 
 		 534 aa  73.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  23.84 
 
 		 534 aa  72  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  24.07 
 
 		 534 aa  69.7  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  26 
 
 		 532 aa  69.7  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  23.6 
 
 		 534 aa  69.3  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  25.52 
 
 		 558 aa  68.2  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  27.12 
 
 		 513 aa  67.4  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  24.49 
 
 		 447 aa  67  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  21.82 
 
 		 527 aa  66.2  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  24.8 
 
 		 537 aa  65.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  28.07 
 
 		 546 aa  65.1  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  22.07 
 
 		 534 aa  64.7  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  25.51 
 
 		 545 aa  64.7  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2176  site-specific recombinase, putative  24.66 
 
 		 612 aa  64.3  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  24.18 
 
 		 505 aa  63.9  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  22.67 
 
 		 535 aa  63.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4607  resolvase-like protein  27.84 
 
 		 476 aa  63.5  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  22.92 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  22.55 
 
 		 498 aa  61.6  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  23.45 
 
 		 516 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  20.61 
 
 		 552 aa  60.8  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  23.16 
 
 		 516 aa  60.5  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  22.68 
 
 		 586 aa  60.1  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  27.56 
 
 		 555 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  26.02 
 
 		 445 aa  59.7  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  22.92 
 
 		 445 aa  59.3  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  24.39 
 
 		 475 aa  58.5  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  22.64 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  25.06 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  25.14 
 
 		 465 aa  58.2  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  25.24 
 
 		 522 aa  57.8  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  28.02 
 
 		 641 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  24.07 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3232  Resolvase domain protein  24.57 
 
 		 474 aa  57  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  24.89 
 
 		 431 aa  57  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  24.55 
 
 		 462 aa  55.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  25.21 
 
 		 509 aa  55.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  25.56 
 
 		 540 aa  56.2  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  27.87 
 
 		 562 aa  55.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4417  recombinase  21.05 
 
 		 517 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  25.81 
 
 		 532 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1608  putative resolvase  23.23 
 
 		 502 aa  55.8  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  22.77 
 
 		 445 aa  55.8  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1501  hypothetical protein  24.02 
 
 		 512 aa  55.1  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.420622  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  24.29 
 
 		 665 aa  54.7  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4608  DNA recombinase, putative  24.6 
 
 		 511 aa  53.9  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4587  DNA recombinase, putative  25.94 
 
 		 486 aa  53.9  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  23.67 
 
 		 443 aa  53.5  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  26.36 
 
 		 549 aa  52.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  21.93 
 
 		 511 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  21.86 
 
 		 504 aa  52.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  29.08 
 
 		 295 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0876  TnpX site-specific recombinase family protein  21.15 
 
 		 550 aa  52.4  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  22.17 
 
 		 474 aa  51.6  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  25.73 
 
 		 597 aa  51.2  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2519  Resolvase domain protein  24.05 
 
 		 494 aa  50.8  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.90325  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  25.08 
 
 		 462 aa  51.2  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  28.53 
 
 		 546 aa  50.4  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  28.44 
 
 		 515 aa  50.4  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  22.33 
 
 		 552 aa  50.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  28.21 
 
 		 576 aa  50.4  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  23.44 
 
 		 485 aa  50.1  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  25.35 
 
 		 540 aa  50.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2051  resolvase domain-containing protein  23.28 
 
 		 494 aa  50.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  27.36 
 
 		 565 aa  50.4  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  24.2 
 
 		 564 aa  49.3  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>