162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0282 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0282  resolvase-like protein  100 
 
 		 184 aa  371  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4640  recombinase  81.56 
 
 		 689 aa  301  4.0000000000000003e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4704  recombinase  81.56 
 
 		 689 aa  301  4.0000000000000003e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.172912 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0415  recombinase  81.56 
 
 		 689 aa  301  4.0000000000000003e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.030164 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4918  resolvase domain-containing protein  78.89 
 
 		 689 aa  291  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.79279 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3420  resolvase domain-containing protein  78.89 
 
 		 689 aa  291  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.408833  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3901  recombinase  60.98 
 
 		 689 aa  197  6e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0165  excisionase/Xis, DNA-binding  60.48 
 
 		 685 aa  192  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3392  resolvase domain-containing protein  52.44 
 
 		 689 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6777  resolvase domain-containing protein  55.49 
 
 		 656 aa  162  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0458  resolvase domain-containing protein  56.44 
 
 		 722 aa  160  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0338  Resolvase domain protein  50.62 
 
 		 385 aa  157  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0236836  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4797  Resolvase domain protein  50.62 
 
 		 385 aa  157  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7439  resolvase domain-containing protein  47.46 
 
 		 694 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4855  resolvase domain-containing protein  47.46 
 
 		 694 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0344697  normal  0.666269 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4901  resolvase domain-containing protein  47.46 
 
 		 694 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.954414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7628  resolvase domain-containing protein  47.46 
 
 		 694 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616048 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1378  transposon orf3  49.7 
 
 		 694 aa  152  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.416601  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6949  resolvase domain-containing protein  47.46 
 
 		 694 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2088  recombinase  48.63 
 
 		 829 aa  151  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.929661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2790  recombinase  49.1 
 
 		 692 aa  143  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.359008  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7609  resolvase domain-containing protein  46.06 
 
 		 690 aa  136  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.918322 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4395  resolvase-like protein  61.62 
 
 		 617 aa  124  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3478  hypothetical protein  43.28 
 
 		 153 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.271395 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3073  hypothetical protein  48.86 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.706022  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  34.32 
 
 		 485 aa  68.2  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  26.82 
 
 		 528 aa  65.1  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4166  recombinase  29.38 
 
 		 460 aa  64.7  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167071  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  26.82 
 
 		 528 aa  64.7  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  33.71 
 
 		 546 aa  64.3  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  25.81 
 
 		 527 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  27.71 
 
 		 445 aa  59.3  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  29.34 
 
 		 505 aa  58.2  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  29.09 
 
 		 441 aa  57.8  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  27.75 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  26.82 
 
 		 462 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  33.79 
 
 		 465 aa  56.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  27.22 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  31.58 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  26.06 
 
 		 568 aa  55.5  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3312  resolvase-like protein  26.76 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  28.48 
 
 		 545 aa  55.5  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  26.82 
 
 		 462 aa  54.7  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  28.57 
 
 		 460 aa  53.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  26.67 
 
 		 506 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1608  putative resolvase  22.88 
 
 		 502 aa  53.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  35.81 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  37.04 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  29.38 
 
 		 540 aa  52.8  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  27.91 
 
 		 525 aa  52.4  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  26.19 
 
 		 549 aa  52  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  25.15 
 
 		 447 aa  52  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0049  resolvase domain-containing protein  23.49 
 
 		 449 aa  51.6  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0050  resolvase domain-containing protein  23.49 
 
 		 449 aa  51.6  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  27.54 
 
 		 550 aa  51.2  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  27.33 
 
 		 525 aa  51.2  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  25.9 
 
 		 534 aa  51.2  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  26.58 
 
 		 542 aa  50.4  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  25.9 
 
 		 534 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  26.58 
 
 		 542 aa  50.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  26.58 
 
 		 542 aa  50.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  35.45 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  25.45 
 
 		 449 aa  50.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  25.9 
 
 		 537 aa  50.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  25.9 
 
 		 534 aa  50.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  25.9 
 
 		 534 aa  50.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2498  cassette chromosome recombinase A  22.89 
 
 		 449 aa  49.7  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  25.3 
 
 		 537 aa  49.3  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25710  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  30.77 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  22.81 
 
 		 475 aa  49.3  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  23.64 
 
 		 511 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  37.96 
 
 		 309 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  30.34 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  34.62 
 
 		 191 aa  48.9  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  26.47 
 
 		 525 aa  48.9  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  34.62 
 
 		 191 aa  48.9  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  27.65 
 
 		 546 aa  48.9  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  31.29 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  31.29 
 
 		 196 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  31.29 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  31.29 
 
 		 196 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1250  resolvase  28.18 
 
 		 524 aa  48.1  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  25.3 
 
 		 534 aa  48.5  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  31.29 
 
 		 196 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  25.64 
 
 		 441 aa  48.5  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  31.29 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  31.29 
 
 		 196 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2179  resolvase domain-containing protein  33.65 
 
 		 188 aa  48.1  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190993  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2946  resolvase domain-containing protein  33.65 
 
 		 188 aa  48.1  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0986415  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  31.29 
 
 		 196 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  25 
 
 		 441 aa  48.1  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  25.3 
 
 		 534 aa  47.8  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  35.19 
 
 		 307 aa  47.8  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  35.19 
 
 		 307 aa  47.8  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2519  Resolvase domain protein  29.94 
 
 		 494 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.90325  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  34.21 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  24.86 
 
 		 459 aa  47  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4608  DNA recombinase, putative  24.4 
 
 		 511 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  36.7 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  36.7 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>