92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3312 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A3312  resolvase-like protein  100 
 
 
239 aa  481  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5600  DNA recombinase, putative, truncation  26.67 
 
 
282 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1452  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2201  resolvase family site-specific recombinase  27.54 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2045  resolvase family site-specific recombinase  27.54 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2222  putative site-specific recombinase, resolvase family  27.97 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.61199e-51 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3978  resolvase domain-containing protein  25.32 
 
 
258 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  28.45 
 
 
548 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3067  resolvase  26.69 
 
 
260 aa  63.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00040652  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1941  putative site-specific recombinase, resolvase family  27.12 
 
 
261 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.292978  normal  0.0530197 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0097  resolvase domain-containing protein  35.07 
 
 
211 aa  61.6  0.000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.371309  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2033  resolvase domain-containing protein  27.12 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  25.66 
 
 
272 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  35.33 
 
 
563 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  35.77 
 
 
547 aa  59.3  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  33.33 
 
 
189 aa  58.5  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  27.8 
 
 
295 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 
517 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  29.03 
 
 
212 aa  57.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  26.43 
 
 
506 aa  57.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1994  resolvase  26.69 
 
 
261 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.854383  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0738  resolvase domain-containing protein  26.61 
 
 
261 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0136169  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1421  Resolvase domain protein  31.96 
 
 
231 aa  55.5  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  26.99 
 
 
521 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0282  resolvase-like protein  26.76 
 
 
184 aa  55.5  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  27.08 
 
 
542 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  27.08 
 
 
554 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2727  Recombinase  27.59 
 
 
590 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  25.16 
 
 
558 aa  52.4  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  25.42 
 
 
555 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3285  Recombinase  29.38 
 
 
554 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  32.03 
 
 
561 aa  50.8  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  25.32 
 
 
510 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0415  recombinase  27.46 
 
 
689 aa  51.2  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.030164 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4704  recombinase  27.46 
 
 
689 aa  51.2  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.172912 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4640  recombinase  27.46 
 
 
689 aa  51.2  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3109  resolvase  29.93 
 
 
377 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1967  resolvase domain-containing protein  26.11 
 
 
252 aa  50.1  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3908  resolvase domain-containing protein  30.48 
 
 
229 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  26.52 
 
 
550 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  26.52 
 
 
555 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0910  recombinase  29.87 
 
 
743 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  26.36 
 
 
485 aa  50.1  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1857  Site-specific recombinase DNA invertase Pin  25.89 
 
 
488 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.830217  decreased coverage  0.0036727 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0107  recombinase  27.2 
 
 
544 aa  49.7  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  27.8 
 
 
546 aa  49.7  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  28.15 
 
 
579 aa  49.7  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08120  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  30.36 
 
 
274 aa  49.7  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  normal  0.202082 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  28.95 
 
 
380 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  25.9 
 
 
558 aa  48.5  0.00009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3518  recombinase  24.55 
 
 
460 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0489876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3591  recombinase  24.55 
 
 
460 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  27.01 
 
 
540 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0887  resolvase domain-containing protein  24.6 
 
 
211 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0277  resolvase domain-containing protein  24.6 
 
 
211 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0073  resolvase domain-containing protein  24.6 
 
 
211 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0254  resolvase domain-containing protein  24.6 
 
 
211 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  27.16 
 
 
665 aa  47  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  30.53 
 
 
540 aa  46.2  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5704  resolvase domain-containing protein  23.27 
 
 
283 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1021  resolvase domain-containing protein  26.67 
 
 
230 aa  46.2  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0963583 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  23.08 
 
 
542 aa  46.2  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  24.68 
 
 
281 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  27.42 
 
 
235 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  23.08 
 
 
542 aa  45.8  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  23.08 
 
 
542 aa  45.8  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0248  resolvase domain-containing protein  34.41 
 
 
524 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000541084  hitchhiker  0.00459613 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2120  Resolvase domain protein  28.31 
 
 
217 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  27.34 
 
 
195 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  28.48 
 
 
189 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0034  recombinase, putative  29.86 
 
 
518 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0192  recombinase, putative  29.86 
 
 
518 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2281  resolvase-like protein  26.25 
 
 
216 aa  43.9  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00855121  normal  0.056664 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1238  Resolvase domain protein  26.22 
 
 
217 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000100955  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  33.33 
 
 
186 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3812  recombinase  34.29 
 
 
523 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1963  resolvase domain-containing protein  25 
 
 
251 aa  43.5  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0600134  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  25.95 
 
 
505 aa  43.9  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3501  recombinase  34.29 
 
 
523 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49756  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  31.43 
 
 
201 aa  42.4  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  31.43 
 
 
201 aa  42.4  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  33.57 
 
 
185 aa  42.4  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  30.71 
 
 
186 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  30.71 
 
 
186 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1905  recombinase  23.03 
 
 
585 aa  42.4  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0302964  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  32.14 
 
 
205 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  22.22 
 
 
500 aa  42  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  22.37 
 
 
515 aa  42  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  25.24 
 
 
547 aa  42  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1181  resolvase domain-containing protein  31.58 
 
 
208 aa  42  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0644392 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  30.3 
 
 
192 aa  41.6  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5133  Resolvase domain  26.8 
 
 
539 aa  41.6  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.880179 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  22.9 
 
 
546 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>