More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0254 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0254  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
211 aa  436  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0277  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
211 aa  436  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0887  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
211 aa  436  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0073  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
211 aa  436  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0076  resolvase domain-containing protein  50.93 
 
 
205 aa  208  5e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1138  resolvase-like protein  38.83 
 
 
207 aa  112  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00747364  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2896  resolvase-like protein  33.69 
 
 
206 aa  99.4  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.232346  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  35.59 
 
 
213 aa  94  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  34.64 
 
 
189 aa  91.3  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4253  resolvase-like protein  32.64 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35703  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4263  resolvase-like protein  32.64 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  37.18 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  32.69 
 
 
190 aa  82  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1293  DNA invertase/resolvase  30.52 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00017233  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  29.86 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  31.85 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  32.4 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  34.62 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1298  resolvase domain-containing protein  30.52 
 
 
205 aa  79  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0238352  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  35.26 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  37.5 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  36.71 
 
 
546 aa  78.2  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  35.33 
 
 
192 aa  77.8  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  37.18 
 
 
212 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  30.63 
 
 
665 aa  76.3  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  32.43 
 
 
191 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1467  resolvase-like protein  34.97 
 
 
196 aa  75.1  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  35.53 
 
 
201 aa  74.7  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  34.01 
 
 
546 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  33.73 
 
 
194 aa  74.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1283  DNA invertase/resolvase  28.22 
 
 
200 aa  74.3  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000215115  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  31.03 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  31.33 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  31.33 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  33.73 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  35.9 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  27.88 
 
 
515 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  33.13 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  30.26 
 
 
515 aa  72.4  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  31.13 
 
 
510 aa  72.4  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  36.6 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  36.6 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  36.6 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  32.32 
 
 
176 aa  72  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  34.65 
 
 
485 aa  72  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  34.81 
 
 
214 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  36.73 
 
 
199 aa  71.2  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  31.39 
 
 
613 aa  71.2  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  31.08 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0274  resolvase domain-containing protein  29.32 
 
 
580 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  32.61 
 
 
193 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25950  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  32.89 
 
 
195 aa  70.5  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  34.42 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  30.67 
 
 
517 aa  70.1  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  32.43 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  35.03 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  31.1 
 
 
198 aa  69.7  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  34.23 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  35.37 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  34 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  35.53 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  30.54 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  33.52 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  27.98 
 
 
462 aa  68.9  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  33.52 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  32.93 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  32.03 
 
 
542 aa  68.2  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  32.03 
 
 
554 aa  68.6  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  32.35 
 
 
189 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  34.64 
 
 
307 aa  68.2  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4272  resolvase-like protein  35.71 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  34.64 
 
 
307 aa  68.2  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  31.47 
 
 
563 aa  67.4  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  35.1 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  35.1 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  34.69 
 
 
197 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  34.23 
 
 
193 aa  67.4  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  27.49 
 
 
522 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  30.46 
 
 
196 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  32.89 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  34.81 
 
 
217 aa  67  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  33.73 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  34.38 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  34.21 
 
 
201 aa  67  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  33.73 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  29.22 
 
 
521 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  30.77 
 
 
188 aa  66.6  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  35.81 
 
 
219 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  30.46 
 
 
196 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  32.16 
 
 
188 aa  67  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  30.46 
 
 
196 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  30.46 
 
 
196 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  32.4 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  32.89 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  30.46 
 
 
196 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  38.1 
 
 
196 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  30.52 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  38.1 
 
 
196 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  30.46 
 
 
196 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  30.52 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>