20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2470 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2470  recombinase  100 
 
 		 100 aa  203  6e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2790  recombinase  49.4 
 
 		 692 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.359008  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7628  resolvase domain-containing protein  41.38 
 
 		 694 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616048 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7439  resolvase domain-containing protein  41.38 
 
 		 694 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6949  resolvase domain-containing protein  41.38 
 
 		 694 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4901  resolvase domain-containing protein  41.38 
 
 		 694 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.954414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4855  resolvase domain-containing protein  41.38 
 
 		 694 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0344697  normal  0.666269 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1378  transposon orf3  38.37 
 
 		 694 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.416601  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3290  resolvase domain-containing protein  41.1 
 
 		 579 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3392  resolvase domain-containing protein  38.81 
 
 		 689 aa  47.8  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7609  resolvase domain-containing protein  38.55 
 
 		 690 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.918322 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6777  resolvase domain-containing protein  36.59 
 
 		 656 aa  47  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0415  recombinase  33.77 
 
 		 689 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.030164 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4704  recombinase  33.77 
 
 		 689 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.172912 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4640  recombinase  33.77 
 
 		 689 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3420  resolvase domain-containing protein  33.72 
 
 		 689 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.408833  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4918  resolvase domain-containing protein  33.72 
 
 		 689 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.79279 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2088  recombinase  35.8 
 
 		 829 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.929661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0458  resolvase domain-containing protein  36.78 
 
 		 722 aa  43.9  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3511  hypothetical protein  35.59 
 
 		 234 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161904  normal  0.581305 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>