23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8022 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011982  Avi_8022  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  571  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4640  recombinase  65.83 
 
 		 689 aa  354  1e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4704  recombinase  65.83 
 
 		 689 aa  354  1e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.172912 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0415  recombinase  65.83 
 
 		 689 aa  354  1e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.030164 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8272  insertion sequence ATP-binding protein  97.63 
 
 		 169 aa  337  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.675942  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3420  resolvase domain-containing protein  58.93 
 
 		 689 aa  317  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.408833  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4918  resolvase domain-containing protein  58.93 
 
 		 689 aa  317  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.79279 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4395  resolvase-like protein  38.43 
 
 		 617 aa  148  9e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3392  resolvase domain-containing protein  34.29 
 
 		 689 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0165  excisionase/Xis, DNA-binding  33.59 
 
 		 685 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3901  recombinase  33.21 
 
 		 689 aa  119  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7609  resolvase domain-containing protein  29.49 
 
 		 690 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.918322 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3511  hypothetical protein  36.15 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161904  normal  0.581305 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3290  resolvase domain-containing protein  25.31 
 
 		 579 aa  79  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1378  transposon orf3  29.44 
 
 		 694 aa  76.6  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.416601  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2790  recombinase  27.62 
 
 		 692 aa  73.6  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.359008  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4855  resolvase domain-containing protein  27.23 
 
 		 694 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0344697  normal  0.666269 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4901  resolvase domain-containing protein  27.23 
 
 		 694 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.954414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6949  resolvase domain-containing protein  27.23 
 
 		 694 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7439  resolvase domain-containing protein  27.23 
 
 		 694 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7628  resolvase domain-containing protein  27.23 
 
 		 694 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616048 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0458  resolvase domain-containing protein  35.29 
 
 		 722 aa  63.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2088  recombinase  28.19 
 
 		 829 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.929661  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>