More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0261 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  41.06 
 
 		 1139 aa  811    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0130  DNA polymerase III, alpha subunit  42.42 
 
 		 1173 aa  813    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103911 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  43.41 
 
 		 1139 aa  844    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  38.93 
 
 		 1170 aa  715    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  42.71 
 
 		 1155 aa  846    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3172  DNA polymerase III subunit alpha  36.22 
 
 		 1175 aa  669    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.450877  hitchhiker  0.0000979148 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0485  DNA polymerase III subunit alpha  35.47 
 
 		 1203 aa  640    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  37.44 
 
 		 1149 aa  684    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1286  DNA polymerase III, alpha subunit  36.7 
 
 		 1165 aa  655    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.148493  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  40.19 
 
 		 1122 aa  771    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1233  DNA polymerase III, alpha subunit  40.88 
 
 		 1160 aa  754    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1570  DNA polymerase III subunit alpha  34.54 
 
 		 1186 aa  643    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.749203  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10990  DNA polymerase III subunit alpha  33.6 
 
 		 1191 aa  639    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.997232  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1499  DNA polymerase III subunit alpha  35.72 
 
 		 1185 aa  647    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  44.79 
 
 		 1075 aa  887    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0650  hypothetical protein  36.97 
 
 		 1148 aa  671    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.394104 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09131  DNA polymerase III subunit alpha  35.69 
 
 		 1165 aa  660    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1612  DNA polymerase III, alpha subunit  35.86 
 
 		 1201 aa  646    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00506055  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1459  DNA polymerase III DnaE  38.85 
 
 		 1159 aa  796    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150549  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  41.86 
 
 		 1145 aa  854    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1024  DNA polymerase III, alpha chain  36.47 
 
 		 1148 aa  640    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0991  DNA polymerase III, alpha chain  36.87 
 
 		 1148 aa  649    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1177  DNA polymerase III, alpha subunit  37.99 
 
 		 1167 aa  654    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.906306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0212  DNA polymerase III, alpha subunit  36.71 
 
 		 1167 aa  721    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000022067  normal  0.693797 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  43.78 
 
 		 1157 aa  865    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0265  DNA polymerase III subunit alpha  36.78 
 
 		 1172 aa  661    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309989  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1836  DNA polymerase III subunit alpha  35.14 
 
 		 1164 aa  636    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0858  DNA polymerase III, alpha subunit  37.2 
 
 		 1141 aa  648    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  unclonable  0.0000342881  normal  0.701952 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01387  DNA polymerase III subunit alpha  35.74 
 
 		 1154 aa  640    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0846  DNA polymerase III, alpha subunit  36.58 
 
 		 1158 aa  664    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0842  DNA polymerase III, alpha subunit  36.97 
 
 		 1262 aa  685    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.888931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  38.63 
 
 		 1181 aa  779    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  41.88 
 
 		 1156 aa  870    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3552  DNA polymerase III, alpha subunit  38.64 
 
 		 1217 aa  716    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.658792  hitchhiker  0.00874617 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1301  DNA polymerase III subunit alpha  36.82 
 
 		 1172 aa  667    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.357557  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1158  DNA polymerase III subunit alpha  37.25 
 
 		 1172 aa  674    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.304661  normal  0.960715 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  42.62 
 
 		 1155 aa  867    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  41.6 
 
 		 1165 aa  793    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4334  DNA polymerase III subunit alpha  37.52 
 
 		 1162 aa  687    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2620  DNA polymerase III subunit alpha  35.75 
 
 		 1157 aa  640    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1396  DNA polymerase III, alpha subunit  42.44 
 
 		 1159 aa  821    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253021  normal  0.727837 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0854  DNA polymerase III subunit alpha  35.79 
 
 		 1165 aa  667    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2731  DNA polymerase III, alpha subunit  35.67 
 
 		 1174 aa  641    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1582  DNA polymerase III subunit alpha  36.91 
 
 		 1170 aa  647    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  43.68 
 
 		 1156 aa  870    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  38.36 
 
 		 1165 aa  744    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3445  DNA polymerase III, alpha subunit  39.13 
 
 		 1210 aa  733    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1885  DNA polymerase III, alpha subunit  52.72 
 
 		 1182 aa  1164    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2399  DNA polymerase III subunit alpha  35.81 
 
 		 1190 aa  649    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.351088  normal  0.331114 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1784  DNA polymerase III subunit alpha  36.07 
 
 		 1177 aa  648    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195815 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10281  DNA polymerase III subunit alpha  35.84 
 
 		 1165 aa  665    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1106  DNA polymerase III subunit alpha  36.19 
 
 		 1173 aa  671    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3038  DNA polymerase III subunit alpha  35.62 
 
 		 1176 aa  638    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.117325 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1247  DNA polymerase III, alpha subunit  36.17 
 
 		 1149 aa  639    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0592  DNA polymerase III subunit alpha  36.78 
 
 		 1161 aa  685    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  42.29 
 
 		 1127 aa  859    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1176  DNA polymerase III, alpha subunit  38.06 
 
 		 1162 aa  669    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239797  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0578  DNA polymerase III subunit alpha  36.52 
 
 		 1168 aa  655    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06991  DNA polymerase III subunit alpha  36.78 
 
 		 1171 aa  668    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.232183 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1798  DNA polymerase III subunit alpha  36.41 
 
 		 1177 aa  651    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1638  DNA polymerase III, alpha subunit  36.95 
 
 		 1189 aa  654    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2747  DNA polymerase III, alpha subunit  39.38 
 
 		 1159 aa  797    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.782351 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3187  DNA polymerase III subunit alpha  35.62 
 
 		 1180 aa  657    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.527295 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  42.24 
 
 		 1156 aa  856    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0145  DNA polymerase III subunit alpha  34.68 
 
 		 1185 aa  643    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.789646  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  36.06 
 
 		 1165 aa  711    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1086  DNA polymerase III subunit alpha  34.56 
 
 		 1181 aa  646    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.594461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15831  DNA polymerase III subunit alpha  38.06 
 
 		 1171 aa  691    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0094  DNA polymerase III, alpha subunit  34.17 
 
 		 1194 aa  636    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.866734  decreased coverage  0.0038584 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0198  DNA polymerase III subunit alpha  35.88 
 
 		 1158 aa  655    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3593  DNA polymerase III, alpha subunit  39.16 
 
 		 1210 aa  738    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1489  DNA polymerase III, alpha subunit  36.14 
 
 		 1143 aa  641    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  38.3 
 
 		 1182 aa  685    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2410  DNA polymerase III, alpha subunit  40.29 
 
 		 1190 aa  759    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00080646  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  41.15 
 
 		 1130 aa  797    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  40.11 
 
 		 1145 aa  813    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5743  DNA polymerase III subunit alpha  35.59 
 
 		 1176 aa  646    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.12723  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17260  DNA polymerase III subunit alpha  35.81 
 
 		 1173 aa  652    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  42.83 
 
 		 1155 aa  868    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3525  DNA polymerase III, alpha subunit  39.16 
 
 		 1210 aa  739    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  44.88 
 
 		 1164 aa  911    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3229  DNA polymerase III, alpha subunit  38.71 
 
 		 1195 aa  717    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909958  normal  0.738512 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0261  DNA polymerase III, alpha subunit  100 
 
 		 1217 aa  2518    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1054  DNA polymerase III subunit alpha  37.21 
 
 		 1190 aa  655    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.785794  normal  0.120623 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  42.36 
 
 		 1179 aa  837    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  43.33 
 
 		 1184 aa  865    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09341  DNA polymerase III subunit alpha  36.97 
 
 		 1172 aa  662    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.146562 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  41.53 
 
 		 1151 aa  806    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1461  DNA polymerase III, alpha subunit  37.99 
 
 		 1166 aa  654    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1426  DNA polymerase III alpha subunit  36.14 
 
 		 1143 aa  641    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16450  DNA polymerase III subunit alpha  35.98 
 
 		 1183 aa  669    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0617237 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0335  DNA polymerase III DnaE  38.7 
 
 		 1186 aa  746    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0916  DNA polymerase III subunit alpha  35.83 
 
 		 1162 aa  660    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  43.26 
 
 		 1175 aa  834    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0091  DNA polymerase III, alpha subunit  36.98 
 
 		 1279 aa  639    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00483462  normal  0.136645 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  42.49 
 
 		 1225 aa  845    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  37.87 
 
 		 1170 aa  704    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  40.98 
 
 		 1134 aa  857    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  36.31 
 
 		 1148 aa  697    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1453  DNA polymerase III, alpha subunit  37.19 
 
 		 1183 aa  662    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>