More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1318 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1318  DNA-binding response regulator, LuxR family  100 
 
 		 222 aa  456  1e-127  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1561  LuxR family DNA-binding response regulator  50.45 
 
 		 226 aa  237  8e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0012725  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0974  two component LuxR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 247 aa  152  4e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000126323  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1373  DNA-binding response regulator, LuxR family  36.19 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0295  two component LuxR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_91  DNA-binding response regulator, LuxR family  32.73 
 
 		 243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1144  DNA-binding response regulator  31.42 
 
 		 247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.27 
 
 		 217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0092  LuxR family DNA-binding response regulator  33.97 
 
 		 236 aa  122  5e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 216 aa  121  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.94 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4183  two component LuxR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 220 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2233  LuxR response regulator receiver  33.33 
 
 		 228 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.73 
 
 		 210 aa  113  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.45 
 
 		 216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.22 
 
 		 217 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4664  two component LuxR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2449  two component LuxR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.73 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1845  LuxR response regulator receiver  34.91 
 
 		 215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00433344  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 207 aa  109  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 222 aa  108  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4942  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.11 
 
 		 222 aa  108  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 213 aa  108  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6032  response regulator receiver protein  31.05 
 
 		 218 aa  108  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  29.13 
 
 		 218 aa  107  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2130  DNA-binding response regulator, LuxR family  30.88 
 
 		 222 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0759  two component LuxR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 217 aa  105  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000356105  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 220 aa  105  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.23 
 
 		 229 aa  105  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4749  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.7 
 
 		 223 aa  105  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 223 aa  105  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.19 
 
 		 213 aa  105  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 223 aa  104  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0209  two component LuxR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 223 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3097  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.64 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472018  normal  0.507317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4778  two component LuxR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000269792  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  29.33 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2055  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.59 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3945  putative DNA-binding response regulator EsrB  29.17 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0480381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.17 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7658  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.23 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4628  two component LuxR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.01 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1940  LuxR response regulator receiver  29.95 
 
 		 222 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.95717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.4 
 
 		 235 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1951  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.75 
 
 		 226 aa  102  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0404  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.52 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3314  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.05 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00833126  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  30.19 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3919  two component LuxR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4126  two component LuxR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4201  two component LuxR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4357  two component LuxR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3505  LuxR family two component transcriptional regulator  29.9 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.345096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3833  putative DNA-binding response regulator EsrB  28.7 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0236  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.18 
 
 		 224 aa  102  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22850  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  27.31 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.711047 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3846  two component LuxR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 249 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.525033  normal  0.770826 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1927  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.71 
 
 		 221 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1954  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.71 
 
 		 221 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.682063 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0454  two component LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 208 aa  102  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.698939  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3601  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.63 
 
 		 222 aa  102  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.324048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.61 
 
 		 211 aa  101  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2312  two-component response regulator transcription regulator protein  28.84 
 
 		 238 aa  101  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.500036 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  31.63 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2514  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.44 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.135771  normal  0.887193 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3676  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.33 
 
 		 214 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0625047  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5014  two component LuxR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 209 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103708  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.78 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0214  two component LuxR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  31.9 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36930  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  32.71 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.811978 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.45 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_934  DNA-binding response regulator, LuxR family  34.27 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.717523  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2015  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.13 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.706703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  31.73 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  27.75 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2253  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.2 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2950  LuxR response regulator receiver  28.17 
 
 		 221 aa  99.8  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6211  response regulator receiver protein  28.64 
 
 		 239 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1134  two component LuxR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 213 aa  99.8  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2401  response regulator receiver  25.94 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0808908 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.33 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  0.606697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7211  response regulator receiver protein  30.92 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0769384 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 212 aa  99.8  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 213 aa  99.8  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0083  two component LuxR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 210 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1233  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.24 
 
 		 220 aa  99.8  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.792953 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>