106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0740 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0740  Fe-S oxidoreductase-like  100 
 
 		 379 aa  783    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0904  hypothetical protein  31.43 
 
 		 380 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3662  radical SAM domain-containing protein  35.61 
 
 		 314 aa  143  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00724126 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4772  radical SAM domain-containing protein  31.65 
 
 		 353 aa  139  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.792188  hitchhiker  0.0000514716 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1585  radical SAM domain-containing protein  23.4 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1643  radical SAM domain-containing protein  20.99 
 
 		 283 aa  57  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2660  Fe-S oxidoreductase, putative coenzyme synthesis protein  26.72 
 
 		 344 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  23.02 
 
 		 323 aa  54.3  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  22.26 
 
 		 323 aa  53.1  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  26.75 
 
 		 468 aa  53.1  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3384  Radical SAM domain protein  25.4 
 
 		 313 aa  53.1  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  25.29 
 
 		 399 aa  52.8  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  35.71 
 
 		 387 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4536  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.37 
 
 		 337 aa  52.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.792195 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  35.71 
 
 		 387 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  25.3 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  28.57 
 
 		 422 aa  52.8  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  27.22 
 
 		 404 aa  51.2  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0890  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 537 aa  50.8  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  29.53 
 
 		 418 aa  51.2  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  37.36 
 
 		 225 aa  51.2  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.22 
 
 		 399 aa  50.8  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0050  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  26.4 
 
 		 231 aa  50.8  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0621  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.33 
 
 		 327 aa  50.1  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.239747  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  26.74 
 
 		 414 aa  49.7  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  23.08 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  27.33 
 
 		 402 aa  48.9  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 393 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1685  hypothetical protein  33.33 
 
 		 314 aa  48.5  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0732068  normal  0.0666172 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  26.11 
 
 		 407 aa  48.5  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  24.59 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  34.31 
 
 		 380 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  23.91 
 
 		 565 aa  47.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  31.11 
 
 		 406 aa  47.4  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0794  radical SAM domain-containing protein  21.35 
 
 		 446 aa  47.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6512  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.4 
 
 		 405 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.397453  normal  0.0847554 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  22.85 
 
 		 459 aa  47.4  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  31.11 
 
 		 406 aa  47.4  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  25.83 
 
 		 397 aa  47.4  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  28.21 
 
 		 399 aa  47.4  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  32.86 
 
 		 387 aa  47.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0860  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  29.35 
 
 		 250 aa  47  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5046  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.48 
 
 		 337 aa  47  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.41268  normal  0.0131922 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  30.3 
 
 		 394 aa  47  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4200  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.94 
 
 		 330 aa  46.6  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341727  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  26.79 
 
 		 377 aa  46.6  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  25.31 
 
 		 316 aa  46.6  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4105  hypothetical protein  29.75 
 
 		 310 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.922484  normal  0.477989 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  31.4 
 
 		 379 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1335  hypothetical protein  24.38 
 
 		 363 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.861062 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  26.19 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4636  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.38 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.886465  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  35.63 
 
 		 391 aa  46.2  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0292  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.43 
 
 		 386 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.876947 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  31.19 
 
 		 1000 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1559  Radical SAM domain protein  20.25 
 
 		 327 aa  46.2  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5563  radical SAM domain protein, putative  26.09 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.03073e-42 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3059  Radical SAM domain protein  34.15 
 
 		 418 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  24.2 
 
 		 561 aa  45.8  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  33.33 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  29.89 
 
 		 355 aa  45.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1991  radical SAM domain-containing protein  24.83 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0387606  normal  0.206645 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  22.9 
 
 		 391 aa  45.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  21.61 
 
 		 371 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0357225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  30.61 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1555  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.07 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0700995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1332  radical SAM domain-containing protein  31 
 
 		 270 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.842138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.27 
 
 		 296 aa  44.3  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  23.72 
 
 		 501 aa  44.3  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  23.21 
 
 		 415 aa  44.3  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1710  Radical SAM domain protein  36.62 
 
 		 324 aa  44.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00399372  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  28.28 
 
 		 391 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1069  radical SAM domain-containing protein  27.14 
 
 		 321 aa  44.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.872388  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2195  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.28 
 
 		 333 aa  44.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.823795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.55 
 
 		 394 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0401  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  22.02 
 
 		 376 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  26.28 
 
 		 359 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  24.83 
 
 		 496 aa  43.5  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 380 aa  43.9  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  26.63 
 
 		 390 aa  43.9  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1705  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.81 
 
 		 353 aa  43.9  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  26.53 
 
 		 412 aa  43.9  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  23.18 
 
 		 358 aa  43.9  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2955  Radical SAM domain protein  25.17 
 
 		 475 aa  43.9  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.807752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0376  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  22.02 
 
 		 376 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0157  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.37 
 
 		 320 aa  43.5  0.006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  29.41 
 
 		 387 aa  43.5  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  30.34 
 
 		 338 aa  43.5  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0024  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  22.37 
 
 		 309 aa  43.5  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0176  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.37 
 
 		 320 aa  43.1  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2761  radical SAM domain-containing protein  23.08 
 
 		 348 aa  43.1  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0874334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3277  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.1 
 
 		 338 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.589823  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0574  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.61 
 
 		 329 aa  43.1  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  29.59 
 
 		 393 aa  43.1  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0197  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.37 
 
 		 320 aa  43.1  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3378  hypothetical protein  25.27 
 
 		 595 aa  43.1  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3594  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.1 
 
 		 338 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3577  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.1 
 
 		 338 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3237  radical SAM domain protein  26.75 
 
 		 298 aa  43.1  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00533932  normal  0.1595 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>