106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2666 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2666  Collagen triple helix repeat protein  100 
 
 
289 aa  548  1e-155  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.371908 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  49.46 
 
 
2914 aa  77  0.0000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  43.88 
 
 
2851 aa  74.3  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  38.16 
 
 
307 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1245  Collagen triple helix repeat protein  34.5 
 
 
309 aa  67  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.160346  normal  0.403174 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1848  Collagen triple helix repeat protein  44.94 
 
 
250 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.152171  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  46.51 
 
 
587 aa  61.2  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  38.24 
 
 
1426 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  55.56 
 
 
643 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  50.98 
 
 
585 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1748  hypothetical protein  37.36 
 
 
1408 aa  60.1  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0879  Collagen triple helix repeat protein  36 
 
 
328 aa  59.3  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  31.33 
 
 
258 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2459  Collagen triple helix repeat protein  31.9 
 
 
342 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00356575 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  43.18 
 
 
462 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4263  triple helix repeat-containing collagen  38.05 
 
 
390 aa  57  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  55.84 
 
 
813 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  41.35 
 
 
473 aa  57.4  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5064  Collagen triple helix repeat protein  50.65 
 
 
839 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  52.87 
 
 
712 aa  56.6  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  40.31 
 
 
466 aa  56.2  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  50.94 
 
 
512 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  47.06 
 
 
380 aa  56.6  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  45.98 
 
 
582 aa  55.8  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  51.85 
 
 
606 aa  55.8  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4499  Collagen triple helix repeat protein  38.73 
 
 
326 aa  55.8  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0524945  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  36.89 
 
 
523 aa  55.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  47.31 
 
 
481 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  47.31 
 
 
478 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  47.78 
 
 
474 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  37.9 
 
 
344 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  47.06 
 
 
319 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  37.5 
 
 
459 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2198  hypothetical protein  31.17 
 
 
240 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  43.75 
 
 
468 aa  53.9  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2409  hypothetical protein  40 
 
 
248 aa  54.3  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242823  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  47.13 
 
 
582 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  39.84 
 
 
322 aa  53.5  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  36.42 
 
 
222 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  47.06 
 
 
492 aa  52.8  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  41.38 
 
 
689 aa  52.4  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  40.59 
 
 
469 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  47.13 
 
 
842 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  40.71 
 
 
426 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  40.7 
 
 
252 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0939  Collagen triple helix repeat protein  64.71 
 
 
194 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0376709  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  44.71 
 
 
274 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  39.29 
 
 
524 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  43.24 
 
 
1451 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  47.12 
 
 
1580 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  41.76 
 
 
647 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  35.12 
 
 
1055 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  46.67 
 
 
748 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  43.82 
 
 
382 aa  50.4  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  44.19 
 
 
493 aa  50.4  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  44.3 
 
 
542 aa  50.4  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  38.75 
 
 
299 aa  50.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0804  Collagen triple helix repeat  39.29 
 
 
288 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  45.19 
 
 
706 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  41.75 
 
 
1219 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  42.86 
 
 
436 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  45.35 
 
 
403 aa  50.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  41.49 
 
 
815 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  37.36 
 
 
400 aa  50.1  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  36.76 
 
 
767 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  39.02 
 
 
936 aa  49.3  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  51.56 
 
 
366 aa  49.3  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4914  Collagen triple helix repeat protein  41.58 
 
 
283 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209024  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  37.88 
 
 
434 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  31.07 
 
 
300 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  50 
 
 
644 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0878  triple helix repeat-containing collagen  35.81 
 
 
303 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0304216 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4355  triple helix repeat-containing collagen  47.14 
 
 
369 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.105642  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  47.44 
 
 
212 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  40.59 
 
 
298 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  41.84 
 
 
639 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3339  triple helix repeat-containing collagen  53.45 
 
 
158 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.487784  normal  0.022781 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  41.55 
 
 
437 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  44.66 
 
 
1147 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  46.94 
 
 
1168 aa  46.6  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0838  Collagen triple helix repeat protein  36.55 
 
 
297 aa  47  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.932228  normal  0.0295691 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  44.57 
 
 
348 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  45.1 
 
 
934 aa  46.6  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2992  hypothetical protein  41.67 
 
 
781 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.507941  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  41.53 
 
 
439 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3097  hypothetical protein  41.67 
 
 
781 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  43.27 
 
 
838 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2241  BclA protein  44.58 
 
 
285 aa  45.8  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  45.16 
 
 
442 aa  45.8  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  28.57 
 
 
2397 aa  45.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  46.51 
 
 
835 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  39 
 
 
300 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  43.59 
 
 
835 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4285  Collagen triple helix repeat protein  45.92 
 
 
648 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275713  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  42.72 
 
 
951 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0623  triple helix repeat-containing collagen  53.85 
 
 
221 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4247  triple helix repeat-containing collagen  62.5 
 
 
268 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  47.22 
 
 
867 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2244  exosporium protein H  50.85 
 
 
435 aa  43.5  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.800271  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2011  triple helix repeat-containing collagen  42.68 
 
 
308 aa  43.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.160641 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>