More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2572 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2572  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  335  9.999999999999999e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000165851  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0060  hypothetical protein  55.83 
 
 		 167 aa  196  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000251524  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0504  hypothetical protein  49.4 
 
 		 166 aa  162  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000296754  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2930  hypothetical protein  41.03 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2613  hypothetical protein  41.03 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  33.33 
 
 		 384 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  39.76 
 
 		 888 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  30.72 
 
 		 866 aa  62.4  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  35.96 
 
 		 897 aa  59.7  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  35.29 
 
 		 267 aa  58.2  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  35.29 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  31.63 
 
 		 845 aa  57.8  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1445  SEC-C motif domain protein  66.67 
 
 		 419 aa  57.8  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0804433  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  30.72 
 
 		 259 aa  57.8  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  95.45 
 
 		 922 aa  56.6  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  35.63 
 
 		 904 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  88 
 
 		 838 aa  57  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  83.33 
 
 		 800 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  35.63 
 
 		 904 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  91.3 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  35.63 
 
 		 904 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  29.01 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  45.76 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  58.33 
 
 		 896 aa  55.8  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  42.03 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  74.07 
 
 		 1136 aa  55.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  95.45 
 
 		 535 aa  55.5  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  91.3 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 864 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  80.77 
 
 		 848 aa  55.1  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0657  preprotein translocase subunit SecA  36.25 
 
 		 897 aa  55.1  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0071  SEC-C motif domain protein  91.3 
 
 		 593 aa  54.7  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  33.01 
 
 		 910 aa  54.7  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  57.89 
 
 		 837 aa  54.7  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0722  SecC motif-containing protein  80 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  87.5 
 
 		 894 aa  54.7  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1865  SecC motif-containing protein  90.91 
 
 		 257 aa  55.1  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356111  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0858  preprotein translocase, SecA subunit  70.37 
 
 		 980 aa  54.7  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00606549  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  95.45 
 
 		 910 aa  54.7  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1370  SecC motif-containing protein  95.24 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3769  SecC motif-containing protein  90.91 
 
 		 378 aa  54.7  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00054409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  83.33 
 
 		 1200 aa  54.7  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  90.91 
 
 		 836 aa  54.7  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  95.24 
 
 		 844 aa  54.3  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1048  SecC motif-containing protein  88 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 1113 aa  53.9  0.0000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0619  preprotein translocase subunit SecA  34.18 
 
 		 897 aa  53.9  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00370749  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  90.91 
 
 		 909 aa  54.3  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  35.96 
 
 		 872 aa  54.3  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  52.08 
 
 		 896 aa  53.9  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3702  SecA-related metal-binding protein  41.18 
 
 		 254 aa  53.9  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.569831 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  66.67 
 
 		 830 aa  53.9  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0420  preprotein translocase subunit SecA  74.07 
 
 		 844 aa  53.9  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.737547  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  86.36 
 
 		 881 aa  53.5  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 858 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3583  preprotein translocase subunit SecA  34.15 
 
 		 900 aa  53.9  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00157477  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  66.67 
 
 		 283 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3771  preprotein translocase subunit SecA  32.93 
 
 		 916 aa  53.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0995653  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  35.58 
 
 		 908 aa  53.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  95.45 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  90.48 
 
 		 834 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  70 
 
 		 276 aa  53.9  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  65.62 
 
 		 921 aa  53.9  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0667  SEC-C motif domain protein  69.23 
 
 		 421 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105843  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  90.91 
 
 		 912 aa  53.9  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  70 
 
 		 276 aa  53.9  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1113  SecC motif-containing protein  86.36 
 
 		 618 aa  53.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  85.71 
 
 		 585 aa  53.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  95.24 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  75.86 
 
 		 291 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0131  protein translocase subunit secA  77.78 
 
 		 923 aa  53.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.449185 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1146  SecC motif-containing protein  90.48 
 
 		 1277 aa  53.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3417  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  90.91 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0460  SEC-C motif domain protein  91.3 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439567  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  95.24 
 
 		 166 aa  53.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  81.82 
 
 		 235 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004483  protein export cytoplasm protein SecA ATPase RNA helicase  86.36 
 
 		 909 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341931  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  100 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 291 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0617  yecA family protein  86.36 
 
 		 264 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.038655  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  86.36 
 
 		 859 aa  52.4  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0152  preprotein translocase subunit SecA  32.14 
 
 		 901 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 957 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0811  preprotein translocase, SecA subunit  55.81 
 
 		 899 aa  52  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 958 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  81.82 
 
 		 225 aa  52.4  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2556  SEC-C motif domain protein  82.61 
 
 		 239 aa  52.4  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  90.91 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.122843 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1913  SEC-C motif domain protein  100 
 
 		 291 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0739  SecC motif-containing protein  91.3 
 
 		 96 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2490  hypothetical protein  31.16 
 
 		 222 aa  51.6  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1324  SecC motif-containing protein  35.51 
 
 		 111 aa  52  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0189954 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  73.33 
 
 		 907 aa  51.6  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3461  preprotein translocase subunit SecA  90.91 
 
 		 936 aa  51.6  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.126577  decreased coverage  0.000173777 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  76 
 
 		 221 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  76 
 
 		 221 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1388  preprotein translocase, SecA subunit  85 
 
 		 859 aa  51.6  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0495  preprotein translocase subunit SecA  90.91 
 
 		 936 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132079  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  76 
 
 		 221 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2664  preprotein translocase subunit SecA  90.91 
 
 		 936 aa  51.6  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>