More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2613 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2930  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  343  7e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2613  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  343  7e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0504  hypothetical protein  47.9 
 
 		 166 aa  163  8e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000296754  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0060  hypothetical protein  45.45 
 
 		 167 aa  153  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000251524  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2572  hypothetical protein  41.03 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000165851  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  51.43 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  45.95 
 
 		 888 aa  64.3  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  45.33 
 
 		 866 aa  60.8  0.000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  42.47 
 
 		 384 aa  59.3  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  79.31 
 
 		 838 aa  58.5  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1370  SecC motif-containing protein  37.5 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  73.33 
 
 		 836 aa  58.5  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  70 
 
 		 1200 aa  58.2  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  77.42 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.122843 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0460  SEC-C motif domain protein  74.19 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439567  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  82.14 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  76.67 
 
 		 912 aa  57.8  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  55.56 
 
 		 894 aa  57.4  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  79.31 
 
 		 910 aa  57.4  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  38.38 
 
 		 535 aa  56.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1895  YgfB and YecA  65.62 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  26.51 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  70 
 
 		 834 aa  56.6  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2027  preprotein translocase, SecA subunit  72.73 
 
 		 933 aa  56.2  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.942365  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  95.24 
 
 		 848 aa  55.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  95.24 
 
 		 897 aa  55.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  70.97 
 
 		 896 aa  55.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  38.75 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  95.45 
 
 		 909 aa  55.8  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  65.62 
 
 		 859 aa  55.1  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  69.7 
 
 		 249 aa  55.1  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  86.36 
 
 		 800 aa  54.7  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  80.77 
 
 		 844 aa  54.7  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1865  SecC motif-containing protein  86.96 
 
 		 257 aa  54.7  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356111  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  78.12 
 
 		 906 aa  54.7  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  44.26 
 
 		 228 aa  54.3  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  79.31 
 
 		 896 aa  54.3  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  66.67 
 
 		 1067 aa  54.3  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004483  protein export cytoplasm protein SecA ATPase RNA helicase  82.14 
 
 		 909 aa  54.3  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341931  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0071  SEC-C motif domain protein  46.88 
 
 		 593 aa  54.3  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  90.91 
 
 		 922 aa  54.3  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  80.77 
 
 		 864 aa  54.3  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0943  yecA family protein  66.67 
 
 		 254 aa  54.3  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3165  hypothetical protein  80.77 
 
 		 214 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550145  normal  0.0595917 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  56.82 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0657  preprotein translocase subunit SecA  27.81 
 
 		 897 aa  53.9  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1677  preprotein translocase, SecA subunit  72.41 
 
 		 1004 aa  53.9  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243336  normal  0.336231 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1043  preprotein translocase subunit SecA  60.53 
 
 		 857 aa  53.5  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  67.57 
 
 		 872 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  87.5 
 
 		 253 aa  53.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1388  preprotein translocase, SecA subunit  90 
 
 		 859 aa  52.8  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1419  preprotein translocase subunit SecA  35.23 
 
 		 896 aa  53.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1565  preprotein translocase subunit SecA  64.52 
 
 		 896 aa  53.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4035  preprotein translocase, SecA subunit  71.88 
 
 		 954 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  86.36 
 
 		 221 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  73.33 
 
 		 837 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1859  preprotein translocase subunit SecA  68.75 
 
 		 869 aa  52.8  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0385967  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  86.36 
 
 		 221 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  50 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  86.36 
 
 		 221 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  86.36 
 
 		 221 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  85.71 
 
 		 228 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  80.77 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  61.11 
 
 		 855 aa  52.8  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  86.36 
 
 		 221 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2556  SEC-C motif domain protein  55.81 
 
 		 239 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  74.07 
 
 		 236 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00909  preprotein translocase subunit SecA  88 
 
 		 909 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1385  preprotein translocase subunit SecA  95.24 
 
 		 910 aa  52.4  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0858  preprotein translocase, SecA subunit  45.65 
 
 		 980 aa  52  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00606549  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  68.97 
 
 		 291 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  36.96 
 
 		 908 aa  52.4  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57220  preprotein translocase subunit SecA  78.57 
 
 		 916 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  30.23 
 
 		 221 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1913  SEC-C motif domain protein  68.97 
 
 		 291 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4974  preprotein translocase subunit SecA  78.57 
 
 		 916 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  59.46 
 
 		 1136 aa  52.4  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3702  SecA-related metal-binding protein  36.99 
 
 		 254 aa  52.4  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.569831 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  30.23 
 
 		 221 aa  52  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  67.86 
 
 		 1113 aa  52  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  30.23 
 
 		 221 aa  52  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  81.82 
 
 		 881 aa  52  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  30.23 
 
 		 221 aa  52  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  90.48 
 
 		 921 aa  52  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  81.82 
 
 		 845 aa  52  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0619  preprotein translocase subunit SecA  27.33 
 
 		 897 aa  52  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00370749  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  30.23 
 
 		 221 aa  52  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  68.97 
 
 		 291 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  81.82 
 
 		 830 aa  51.6  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  30.23 
 
 		 221 aa  52  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0938  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 884 aa  51.6  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  30.23 
 
 		 221 aa  51.6  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  30.23 
 
 		 221 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1445  SEC-C motif domain protein  90.91 
 
 		 419 aa  51.6  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0804433  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  62.07 
 
 		 267 aa  51.6  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  30.23 
 
 		 221 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  73.33 
 
 		 907 aa  51.6  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3769  SecC motif-containing protein  95 
 
 		 378 aa  51.6  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00054409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0617  yecA family protein  75 
 
 		 264 aa  51.6  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.038655  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  62.07 
 
 		 237 aa  51.2  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>