More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE01830 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006687  CNE01830  4-aminobutyrate aminotransferase, putative  100 
 
 
501 aa  1033    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02040  4-aminobutyrate transaminase, putative  53 
 
 
488 aa  540  9.999999999999999e-153  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0278782  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02248  4-aminobutyrate aminotransferase (EC 2.6.1.19)(Gamma-amino-N-butyrate transaminase)(GABA transaminase)(GABA aminotransferase)(GABA-AT) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P14010]  55.08 
 
 
498 aa  526  1e-148  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0439311  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54153  4-aminobutyrate aminotransferase (GABA transaminase)  50.4 
 
 
491 aa  483  1e-135  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46781  4-aminobutyrate aminotransferase (GABA transaminase)  46.72 
 
 
470 aa  422  1e-117  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38108  predicted protein  42.77 
 
 
500 aa  365  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0293051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1211  L-lysine aminotransferase  32.66 
 
 
443 aa  210  5e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.992167 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1717  L-lysine 6-transaminase  32.05 
 
 
449 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0464  L-lysine 6-transaminase  30.25 
 
 
439 aa  191  2.9999999999999997e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00767316  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2373  L-lysine aminotransferase  30.63 
 
 
479 aa  182  9.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2194  L-lysine 6-transaminase  31.41 
 
 
467 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2873  L-lysine aminotransferase  28.86 
 
 
500 aa  179  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0317719  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4796  L-lysine aminotransferase  31.57 
 
 
450 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.267595  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2442  L-lysine aminotransferase  30.66 
 
 
453 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2682  L-lysine 6-transaminase  31.86 
 
 
424 aa  172  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1141  L-lysine 6-transaminase  30.75 
 
 
452 aa  172  1e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0300447  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7678  L-lysine aminotransferase  30.79 
 
 
433 aa  170  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1272  L-lysine aminotransferase  31.25 
 
 
440 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1289  L-lysine aminotransferase  31.25 
 
 
440 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273744  normal  0.422554 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1301  L-lysine aminotransferase  31.25 
 
 
442 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13319  L-lysine aminotransferase  30.27 
 
 
449 aa  162  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1652  L-lysine aminotransferase  31.25 
 
 
451 aa  160  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545024  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0810  aminotransferase class-III  28.34 
 
 
441 aa  143  8e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1690  aminotransferase class-III  27.44 
 
 
451 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2207  aminotransferase class-III  25.22 
 
 
444 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.85237  normal  0.53065 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1072  aminotransferase class-III  24.49 
 
 
439 aa  128  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2199  aminotransferase class-III  25.68 
 
 
446 aa  120  7.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  25.65 
 
 
468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  25.78 
 
 
454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  25.78 
 
 
454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  26.53 
 
 
478 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  25.78 
 
 
454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0220  aminotransferase  27.82 
 
 
436 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  25.78 
 
 
454 aa  114  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0686  aminotransferase  27.34 
 
 
429 aa  114  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  25.41 
 
 
454 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  25.18 
 
 
454 aa  114  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  27.4 
 
 
452 aa  113  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  26.67 
 
 
428 aa  113  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1743  4-aminobutyrate aminotransferase  27.74 
 
 
447 aa  111  3e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  25.83 
 
 
444 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  26.85 
 
 
459 aa  110  6e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1260  acetylornithine aminotransferase  26.96 
 
 
399 aa  110  9.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.161601 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  29.64 
 
 
419 aa  109  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  26.16 
 
 
434 aa  109  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2930  aminotransferase class-III  26.51 
 
 
460 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10990  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  25.29 
 
 
418 aa  108  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.128508  normal  0.0199739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3311  acetylornithine aminotransferase  27.31 
 
 
390 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0246414  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5282  aminotransferase class-III  25.67 
 
 
433 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0510  4-aminobutyrate aminotransferase  26.9 
 
 
441 aa  108  3e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  26.27 
 
 
479 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1896  aminotransferase class-III  28.67 
 
 
432 aa  108  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0311328 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  26.55 
 
 
437 aa  107  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  25.26 
 
 
431 aa  107  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0813  acetylornithine aminotransferase  26.96 
 
 
431 aa  107  7e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.470435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  27.33 
 
 
441 aa  107  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0827  aminotransferase class-III  26.76 
 
 
422 aa  107  7e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  24.85 
 
 
441 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2878  aminotransferase class-III  26.79 
 
 
434 aa  106  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19268  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1561  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  25.87 
 
 
433 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0665  aminotransferase  25.23 
 
 
433 aa  106  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.459907 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21710  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  28.78 
 
 
419 aa  106  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1191  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  26.64 
 
 
440 aa  106  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.152547  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  25.49 
 
 
454 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0283  aminotransferase  28.67 
 
 
392 aa  104  3e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2839  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  28.02 
 
 
493 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000267861  normal  0.189909 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0759  4-aminobutyrate aminotransferase  26.82 
 
 
446 aa  105  3e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.174279  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3362  aminotransferase class-III  25 
 
 
433 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5005  aminotransferase class-III  25 
 
 
433 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0775  aminotransferase class-III  26.21 
 
 
376 aa  104  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  23.73 
 
 
399 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2210  acetylornithine transaminase  25.51 
 
 
419 aa  104  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  27.53 
 
 
430 aa  103  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2935  aminotransferase class-III  23.67 
 
 
454 aa  103  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0412  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  26.73 
 
 
465 aa  103  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.481167  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0662  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  27.77 
 
 
462 aa  103  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00898604  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1464  aminotransferase class-III  26.92 
 
 
448 aa  103  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000155661  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  24.22 
 
 
448 aa  103  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2675  aminotransferase  25.18 
 
 
433 aa  103  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4936  aminotransferase class-III  24.55 
 
 
433 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  28.24 
 
 
427 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4054  aminotransferase  25.89 
 
 
540 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2154  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  26.01 
 
 
401 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000952275  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  24.83 
 
 
396 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4418  aminotransferase class-III  24.55 
 
 
433 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0107565 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  27.17 
 
 
425 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4998  4-aminobutyrate aminotransferase  27.93 
 
 
425 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  27.93 
 
 
425 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  27.93 
 
 
425 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1289  4-aminobutyrate aminotransferase  25.62 
 
 
426 aa  102  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2691  hypothetical protein  25.52 
 
 
457 aa  102  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  28.65 
 
 
418 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  24.47 
 
 
454 aa  102  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22300  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  25.56 
 
 
425 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.271521  normal  0.79569 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3784  aminotransferase class-III  25.73 
 
 
460 aa  102  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1054  aminotransferase class-III  24.37 
 
 
453 aa  101  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1404  aminotransferase class-III  28.67 
 
 
383 aa  101  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.443564  normal  0.505281 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1532  4-aminobutyrate aminotransferase  27.73 
 
 
419 aa  101  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2046  aminotransferase class-III  25.37 
 
 
433 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000254153 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  25.89 
 
 
420 aa  100  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>