More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1690 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1690  aminotransferase class-III  100 
 
 		 451 aa  911    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2199  aminotransferase class-III  65.63 
 
 		 446 aa  575  1.0000000000000001e-163  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1072  aminotransferase class-III  59.86 
 
 		 439 aa  529  1e-149  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0810  aminotransferase class-III  60.13 
 
 		 441 aa  528  1e-149  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2207  aminotransferase class-III  60.49 
 
 		 444 aa  518  1e-146  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.85237  normal  0.53065 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1054  aminotransferase class-III  57.14 
 
 		 453 aa  501  1e-141  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2935  aminotransferase class-III  56.25 
 
 		 454 aa  496  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3776  aminotransferase class-III  53.86 
 
 		 453 aa  479  1e-134  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  38.13 
 
 		 441 aa  263  6.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  39.76 
 
 		 432 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  36.94 
 
 		 444 aa  232  9e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  34.93 
 
 		 441 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  36.63 
 
 		 461 aa  222  8e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  34.3 
 
 		 452 aa  218  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0510  4-aminobutyrate aminotransferase  36.03 
 
 		 441 aa  217  4e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  35.39 
 
 		 465 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  33.33 
 
 		 431 aa  211  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1743  4-aminobutyrate aminotransferase  31.78 
 
 		 447 aa  204  2e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0759  4-aminobutyrate aminotransferase  32.08 
 
 		 446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.174279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  34.34 
 
 		 458 aa  199  6e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  32.56 
 
 		 459 aa  198  1.0000000000000001e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0176  4-aminobutyrate aminotransferase  33.41 
 
 		 448 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0769086 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0562  4-aminobutyrate aminotransferase  33.02 
 
 		 447 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.921583 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1464  aminotransferase class-III  34.01 
 
 		 448 aa  190  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000155661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  33.4 
 
 		 465 aa  190  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  34.32 
 
 		 440 aa  189  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  33.26 
 
 		 428 aa  189  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2210  acetylornithine transaminase  32.93 
 
 		 419 aa  184  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0491  aminotransferase  32.93 
 
 		 427 aa  183  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809579 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  32.01 
 
 		 385 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0949  aminotransferase class-III  31.29 
 
 		 418 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  35.99 
 
 		 439 aa  181  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0429  4-aminobutyrate aminotransferase  35.54 
 
 		 433 aa  180  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.286831  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  32.65 
 
 		 420 aa  179  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  30.25 
 
 		 445 aa  177  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  32.13 
 
 		 386 aa  176  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4167  4-aminobutyrate aminotransferase  33.41 
 
 		 434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130001  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  30.99 
 
 		 394 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  31.05 
 
 		 448 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1048  aminotransferase class-III  31.51 
 
 		 462 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  28.86 
 
 		 441 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  32.07 
 
 		 427 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0029  4-aminobutyrate aminotransferase protein  33.74 
 
 		 426 aa  172  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  31.7 
 
 		 386 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00880  ornithine-oxo-acid aminotransferase, putative  30.28 
 
 		 476 aa  171  2e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  32.01 
 
 		 454 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3070  4-aminobutyrate aminotransferase  33.67 
 
 		 433 aa  171  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  33.18 
 
 		 430 aa  170  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  32.87 
 
 		 419 aa  170  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0827  aminotransferase class-III  32.05 
 
 		 422 aa  169  6e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  33.42 
 
 		 395 aa  170  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  32.45 
 
 		 418 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  32.45 
 
 		 418 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.152714 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01279  GABA aminotransferase, PLP-dependent  30.29 
 
 		 421 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2344  4-aminobutyrate aminotransferase  30.29 
 
 		 421 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00720647  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4211  4-aminobutyrate aminotransferase  32.13 
 
 		 425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.225868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3721  4-aminobutyrate aminotransferase  33.01 
 
 		 426 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  32.16 
 
 		 442 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2323  4-aminobutyrate transaminase  30.29 
 
 		 421 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1512  4-aminobutyrate transaminase  30.29 
 
 		 421 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01290  hypothetical protein  30.29 
 
 		 421 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3864  4-aminobutyrate aminotransferase  32.03 
 
 		 421 aa  167  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0197143 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.33 
 
 		 388 aa  167  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  33.33 
 
 		 388 aa  167  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3329  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  34.52 
 
 		 456 aa  167  4e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.225117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0213  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  32.87 
 
 		 457 aa  167  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  32.52 
 
 		 426 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1757  aminotransferase  31.91 
 
 		 425 aa  166  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.744583  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1211  L-lysine aminotransferase  29.06 
 
 		 443 aa  166  8e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.992167 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3398  4-aminobutyrate aminotransferase  32.77 
 
 		 426 aa  166  9e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  30.9 
 
 		 454 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3950  aminotransferase class-III  30.77 
 
 		 452 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2194  L-lysine 6-transaminase  31.76 
 
 		 467 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  30.05 
 
 		 423 aa  165  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_002978  WD1283  acetylornithine transaminase protein  29.47 
 
 		 391 aa  165  2.0000000000000002e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  30.9 
 
 		 468 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7694  4-aminobutyrate aminotransferase  30.66 
 
 		 426 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.788415  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1820  4-aminobutyrate transaminase  30.07 
 
 		 421 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.144249 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  33.09 
 
 		 391 aa  165  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0275  4-aminobutyrate aminotransferase  29.88 
 
 		 417 aa  164  3e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0862859 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4306  4-aminobutyrate aminotransferase  30.49 
 
 		 421 aa  164  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  30.91 
 
 		 454 aa  164  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1538  4-aminobutyrate transaminase  30.45 
 
 		 421 aa  164  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.535334  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  30.91 
 
 		 478 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1417  4-aminobutyrate transaminase  29.75 
 
 		 421 aa  164  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  30.91 
 
 		 454 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  31.85 
 
 		 454 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  30.91 
 
 		 454 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  30 
 
 		 438 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3262  4-aminobutyrate aminotransferase  32.04 
 
 		 425 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.129895 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.42 
 
 		 398 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6536  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.49 
 
 		 397 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1944  4-aminobutyrate transaminase  29.98 
 
 		 421 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.991898 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  31.57 
 
 		 442 aa  163  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2386  aminotransferase  29.44 
 
 		 471 aa  163  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.419585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  31.57 
 
 		 434 aa  163  7e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2767  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  31.63 
 
 		 403 aa  163  7e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0146  4-aminobutyrate aminotransferase  32.11 
 
 		 434 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1951  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  28.19 
 
 		 398 aa  162  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.620278  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0834  4-aminobutyrate aminotransferase  32.06 
 
 		 429 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379614 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>