More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2194 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2194  L-lysine 6-transaminase  100 
 
 
467 aa  961    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1211  L-lysine aminotransferase  57.8 
 
 
443 aa  537  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.992167 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0464  L-lysine 6-transaminase  56.72 
 
 
439 aa  521  1e-146  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00767316  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2442  L-lysine aminotransferase  58.85 
 
 
453 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1652  L-lysine aminotransferase  57.08 
 
 
451 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545024  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1272  L-lysine aminotransferase  57.47 
 
 
440 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4796  L-lysine aminotransferase  58.12 
 
 
450 aa  488  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.267595  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1289  L-lysine aminotransferase  57.47 
 
 
440 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273744  normal  0.422554 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1301  L-lysine aminotransferase  57.08 
 
 
442 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1717  L-lysine 6-transaminase  55.17 
 
 
449 aa  484  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13319  L-lysine aminotransferase  57.44 
 
 
449 aa  481  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1141  L-lysine 6-transaminase  53.69 
 
 
452 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0300447  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2373  L-lysine aminotransferase  52.97 
 
 
479 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2682  L-lysine 6-transaminase  54.94 
 
 
424 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2873  L-lysine aminotransferase  50.69 
 
 
500 aa  436  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0317719  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7678  L-lysine aminotransferase  55.48 
 
 
433 aa  436  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38108  predicted protein  34.46 
 
 
500 aa  217  4e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0293051 
 
 
-
 
NC_006686  CND02040  4-aminobutyrate transaminase, putative  32.65 
 
 
488 aa  199  9e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0278782  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02248  4-aminobutyrate aminotransferase (EC 2.6.1.19)(Gamma-amino-N-butyrate transaminase)(GABA transaminase)(GABA aminotransferase)(GABA-AT) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P14010]  32.8 
 
 
498 aa  197  4.0000000000000005e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0439311  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01830  4-aminobutyrate aminotransferase, putative  31.41 
 
 
501 aa  181  2e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  30.59 
 
 
444 aa  179  1e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0886  acetylornithine transaminase protein  31.12 
 
 
392 aa  176  9e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0996794  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.45 
 
 
395 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2386  aminotransferase  30.82 
 
 
471 aa  169  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.419585  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  31.34 
 
 
452 aa  168  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  30.28 
 
 
465 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54153  4-aminobutyrate aminotransferase (GABA transaminase)  30.16 
 
 
491 aa  167  2.9999999999999998e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  30.32 
 
 
400 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0225  acetylornithine aminotransferase  29.4 
 
 
393 aa  166  8e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1690  aminotransferase class-III  31.76 
 
 
451 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  32.46 
 
 
398 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0278  acetylornithine aminotransferase  28.81 
 
 
393 aa  162  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368086  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1072  aminotransferase class-III  29.59 
 
 
439 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4554  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  30.64 
 
 
404 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1283  acetylornithine transaminase protein  31.35 
 
 
391 aa  161  2e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  32.05 
 
 
432 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1224  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  30.62 
 
 
399 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.803293  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2124  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  32.71 
 
 
410 aa  160  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.975893  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0252  acetylornithine aminotransferase  28.57 
 
 
393 aa  160  6e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46781  4-aminobutyrate aminotransferase (GABA transaminase)  29.18 
 
 
470 aa  159  8e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3864  4-aminobutyrate aminotransferase  29.98 
 
 
421 aa  159  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0197143 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1157  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  32.71 
 
 
410 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.861166  normal  0.0351204 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0626  acetylornithine aminotransferase  30.99 
 
 
426 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.882273  normal  0.369402 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  33.89 
 
 
440 aa  158  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  30.17 
 
 
399 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1558  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  31.06 
 
 
411 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.751074  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0185  acetylornithine transaminase protein  32.22 
 
 
399 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.372078 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2429  acetylornithine aminotransferase  31.72 
 
 
398 aa  157  6e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1180  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  32.71 
 
 
410 aa  156  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3002  acetylornithine aminotransferase  31.72 
 
 
398 aa  156  7e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.555766  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  30.36 
 
 
399 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.716815  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1061  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  32 
 
 
410 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.964628  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3721  4-aminobutyrate aminotransferase  31.09 
 
 
426 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0591  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  31.08 
 
 
410 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0214  acetylornithine transaminase protein  29.12 
 
 
391 aa  155  2e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000000369674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2847  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  31.08 
 
 
410 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4291  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  32.47 
 
 
410 aa  155  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3398  4-aminobutyrate aminotransferase  30.63 
 
 
426 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2866  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  31.08 
 
 
410 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  30.77 
 
 
401 aa  155  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1736  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  31.08 
 
 
410 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143405  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2785  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  31.08 
 
 
410 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2425  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  31.08 
 
 
410 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.725646  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2371  4-aminobutyrate aminotransferase  31.24 
 
 
440 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0827884  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1775  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  31.12 
 
 
411 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.664584  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  28.67 
 
 
465 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  30.52 
 
 
461 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0701  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  32.47 
 
 
410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520056  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3005  4-aminobutyrate aminotransferase  32 
 
 
429 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742708  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5361  4-aminobutyrate aminotransferase  32 
 
 
429 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984164  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  30.52 
 
 
426 aa  153  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3836  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  29.15 
 
 
405 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1532  4-aminobutyrate aminotransferase  30.14 
 
 
419 aa  154  5e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0491  aminotransferase  30 
 
 
427 aa  153  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.809579 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  30.24 
 
 
445 aa  154  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  30.52 
 
 
426 aa  153  5e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4909  4-aminobutyrate aminotransferase  32 
 
 
427 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0029  4-aminobutyrate aminotransferase protein  30.86 
 
 
426 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2923  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  30.97 
 
 
411 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.689777  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2545  4-aminobutyrate aminotransferase  30.59 
 
 
421 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  31.76 
 
 
427 aa  153  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  30.93 
 
 
420 aa  153  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  29.95 
 
 
426 aa  153  8e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  29.91 
 
 
426 aa  153  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  27.93 
 
 
400 aa  153  8e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1061  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  31.53 
 
 
410 aa  153  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.637479  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2727  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  30.84 
 
 
410 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  29.89 
 
 
439 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  30 
 
 
440 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3773  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  29.15 
 
 
405 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.504324 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  30.52 
 
 
426 aa  152  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.480055 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  30.52 
 
 
426 aa  152  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.888156 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  30.44 
 
 
427 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  29.72 
 
 
426 aa  151  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  31.76 
 
 
429 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3665  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  29.15 
 
 
405 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.451233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  29.72 
 
 
426 aa  151  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2210  acetylornithine transaminase  28.37 
 
 
419 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2179  acetylornithine aminotransferase  28.78 
 
 
398 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.569965  normal  0.442274 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1901  acetylornithine aminotransferase  29.04 
 
 
400 aa  152  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133726  normal  0.687258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>