More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2199 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2207  aminotransferase class-III  70.95 
 
 		 444 aa  650    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.85237  normal  0.53065 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2199  aminotransferase class-III  100 
 
 		 446 aa  908    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2935  aminotransferase class-III  63.43 
 
 		 454 aa  586  1e-166  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1054  aminotransferase class-III  63.43 
 
 		 453 aa  584  1.0000000000000001e-165  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1690  aminotransferase class-III  65.63 
 
 		 451 aa  575  1.0000000000000001e-163  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3776  aminotransferase class-III  61.85 
 
 		 453 aa  577  1.0000000000000001e-163  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0810  aminotransferase class-III  65.77 
 
 		 441 aa  574  1.0000000000000001e-162  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1072  aminotransferase class-III  60.58 
 
 		 439 aa  545  1e-154  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  37.33 
 
 		 432 aa  246  4e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  34.22 
 
 		 441 aa  233  6e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  34.65 
 
 		 441 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0510  4-aminobutyrate aminotransferase  35.41 
 
 		 441 aa  223  4e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  35.25 
 
 		 444 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  35.08 
 
 		 461 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  35.06 
 
 		 431 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1743  4-aminobutyrate aminotransferase  33.12 
 
 		 447 aa  216  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  34.48 
 
 		 458 aa  210  4e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0759  4-aminobutyrate aminotransferase  33.26 
 
 		 446 aa  209  8e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.174279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0176  4-aminobutyrate aminotransferase  34.27 
 
 		 448 aa  207  2e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0769086 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  34.19 
 
 		 452 aa  208  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  33.83 
 
 		 465 aa  203  6e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  32.78 
 
 		 459 aa  195  1e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  32.95 
 
 		 442 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  32.99 
 
 		 465 aa  190  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  32.59 
 
 		 427 aa  189  7e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  31.49 
 
 		 428 aa  186  8e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1916  Acetylornithine transaminase  34.52 
 
 		 417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3950  aminotransferase class-III  31.86 
 
 		 452 aa  185  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0949  aminotransferase class-III  31.12 
 
 		 418 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  28.89 
 
 		 441 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1757  aminotransferase  33.17 
 
 		 425 aa  184  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.744583  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  33.55 
 
 		 439 aa  182  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1283  acetylornithine transaminase protein  29 
 
 		 391 aa  181  2e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  32.39 
 
 		 419 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1464  aminotransferase class-III  32.2 
 
 		 448 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000155661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  32.05 
 
 		 442 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2386  aminotransferase  30.79 
 
 		 471 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.419585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  30.38 
 
 		 445 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1344  aminotransferase class-III  31.21 
 
 		 445 aa  179  9e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.252611  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  32.84 
 
 		 401 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  31.16 
 
 		 385 aa  177  5e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0562  4-aminobutyrate aminotransferase  30.47 
 
 		 447 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.921583 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  29.12 
 
 		 448 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.42 
 
 		 393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  32.95 
 
 		 440 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1034  4-aminobutyrate aminotransferase  31.95 
 
 		 453 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0355081 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  32.48 
 
 		 430 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0491  aminotransferase  32.38 
 
 		 427 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809579 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2210  acetylornithine transaminase  31.99 
 
 		 419 aa  173  5.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2000  4-aminobutyrate aminotransferase  31.18 
 
 		 432 aa  173  6.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2930  aminotransferase class-III  30.75 
 
 		 460 aa  173  6.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  31.44 
 
 		 394 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1048  aminotransferase class-III  31.54 
 
 		 462 aa  172  9e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1534  4-aminobutyrate aminotransferase  29.57 
 
 		 453 aa  172  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46092  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  31.83 
 
 		 427 aa  172  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3864  4-aminobutyrate aminotransferase  33.49 
 
 		 421 aa  171  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0197143 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1416  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  30.98 
 
 		 477 aa  171  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2274  4-aminobutyrate aminotransferase  30.4 
 
 		 446 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2313  4-aminobutyrate aminotransferase  30.4 
 
 		 446 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233271  normal  0.897192 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2321  4-aminobutyrate aminotransferase  30.4 
 
 		 446 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42867  normal  0.490264 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  33.18 
 
 		 427 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0275  4-aminobutyrate aminotransferase  30.14 
 
 		 417 aa  170  5e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0862859 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10360  4-aminobutyrate aminotransferase  29.57 
 
 		 440 aa  169  8e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.70128  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  30.53 
 
 		 454 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  30.53 
 
 		 454 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3094  4-aminobutyrate aminotransferase  30.72 
 
 		 468 aa  169  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0817591  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0834  4-aminobutyrate aminotransferase  34.13 
 
 		 429 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  30.73 
 
 		 390 aa  168  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  33.17 
 
 		 429 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  30.67 
 
 		 468 aa  167  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  30.97 
 
 		 454 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2798  4-aminobutyrate aminotransferase  30.67 
 
 		 456 aa  167  5e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539792 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  30.79 
 
 		 386 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3262  4-aminobutyrate aminotransferase  30.48 
 
 		 425 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.129895 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0690  4-aminobutyrate aminotransferase  29.87 
 
 		 448 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  30.72 
 
 		 454 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1218  4-aminobutyrate aminotransferase  32.23 
 
 		 429 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0429  4-aminobutyrate aminotransferase  34.73 
 
 		 433 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.286831  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3106  4-aminobutyrate aminotransferase  31.99 
 
 		 429 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  32.76 
 
 		 386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  30.46 
 
 		 454 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  30.46 
 
 		 478 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4306  4-aminobutyrate aminotransferase  32.23 
 
 		 421 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3005  4-aminobutyrate aminotransferase  33.33 
 
 		 429 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742708  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5361  4-aminobutyrate aminotransferase  33.33 
 
 		 429 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  33.25 
 
 		 427 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7694  4-aminobutyrate aminotransferase  29.78 
 
 		 426 aa  165  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.788415  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0539  aminotransferase class-III  29.01 
 
 		 440 aa  164  3e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1819  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  30.49 
 
 		 477 aa  164  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  30.46 
 
 		 454 aa  164  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  31.45 
 
 		 454 aa  164  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1532  4-aminobutyrate aminotransferase  30.66 
 
 		 419 aa  164  3e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4909  4-aminobutyrate aminotransferase  32.76 
 
 		 427 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3721  4-aminobutyrate aminotransferase  32.61 
 
 		 426 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  30.84 
 
 		 418 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1359  acetylornithine transaminase protein  31.48 
 
 		 395 aa  163  6e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.592193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1335  4-aminobutyrate aminotransferase  31.99 
 
 		 429 aa  163  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  30.67 
 
 		 479 aa  163  7e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0280  4-aminobutyrate aminotransferase  33.09 
 
 		 429 aa  162  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.969383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2581  4-aminobutyrate aminotransferase  31.22 
 
 		 446 aa  162  9e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120886  normal  0.564644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>