More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1211 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1211  L-lysine aminotransferase  100 
 
 		 443 aa  927    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.992167 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2194  L-lysine 6-transaminase  57.8 
 
 		 467 aa  537  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0464  L-lysine 6-transaminase  49.43 
 
 		 439 aa  465  9.999999999999999e-131  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00767316  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1717  L-lysine 6-transaminase  51.71 
 
 		 449 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2442  L-lysine aminotransferase  47.6 
 
 		 453 aa  448  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4796  L-lysine aminotransferase  49.65 
 
 		 450 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.267595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1652  L-lysine aminotransferase  48.05 
 
 		 451 aa  428  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1301  L-lysine aminotransferase  46.91 
 
 		 442 aa  425  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1272  L-lysine aminotransferase  46.92 
 
 		 440 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1289  L-lysine aminotransferase  46.92 
 
 		 440 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273744  normal  0.422554 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2873  L-lysine aminotransferase  46.22 
 
 		 500 aa  424  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0317719  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2373  L-lysine aminotransferase  46.1 
 
 		 479 aa  424  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13319  L-lysine aminotransferase  46 
 
 		 449 aa  414  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1141  L-lysine 6-transaminase  47.11 
 
 		 452 aa  414  1e-114  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0300447  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2682  L-lysine 6-transaminase  47.7 
 
 		 424 aa  404  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7678  L-lysine aminotransferase  46.24 
 
 		 433 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38108  predicted protein  33.19 
 
 		 500 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0293051 
 
 
-
 
NC_006686  CND02040  4-aminobutyrate transaminase, putative  30.73 
 
 		 488 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0278782  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01830  4-aminobutyrate aminotransferase, putative  32.66 
 
 		 501 aa  210  5e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02248  4-aminobutyrate aminotransferase (EC 2.6.1.19)(Gamma-amino-N-butyrate transaminase)(GABA transaminase)(GABA aminotransferase)(GABA-AT) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P14010]  30.97 
 
 		 498 aa  205  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0439311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54153  4-aminobutyrate aminotransferase (GABA transaminase)  33.18 
 
 		 491 aa  203  5e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46781  4-aminobutyrate aminotransferase (GABA transaminase)  32.95 
 
 		 470 aa  200  5e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1690  aminotransferase class-III  29.06 
 
 		 451 aa  166  8e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  29.17 
 
 		 452 aa  164  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1072  aminotransferase class-III  26.09 
 
 		 439 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52948  acetylornithine aminotransferase  29.05 
 
 		 452 aa  160  5e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.346975 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0225  acetylornithine aminotransferase  29.55 
 
 		 393 aa  157  4e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2199  aminotransferase class-III  29.77 
 
 		 446 aa  157  4e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3776  aminotransferase class-III  27.83 
 
 		 453 aa  156  9e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0810  aminotransferase class-III  27.85 
 
 		 441 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0278  acetylornithine aminotransferase  28.37 
 
 		 393 aa  154  4e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368086  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0252  acetylornithine aminotransferase  27.96 
 
 		 393 aa  152  8e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2207  aminotransferase class-III  28.43 
 
 		 444 aa  152  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.85237  normal  0.53065 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  30.05 
 
 		 427 aa  150  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  27.95 
 
 		 396 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  27.72 
 
 		 465 aa  149  7e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77538  ornithine aminotransferase  29.83 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  27.87 
 
 		 398 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  27.87 
 
 		 398 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  26.85 
 
 		 465 aa  146  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2935  aminotransferase class-III  27.4 
 
 		 454 aa  145  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0886  acetylornithine transaminase protein  27.45 
 
 		 392 aa  144  2e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0996794  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  27.76 
 
 		 429 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  27.46 
 
 		 419 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1054  aminotransferase class-III  28.64 
 
 		 453 aa  145  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1951  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  27.12 
 
 		 398 aa  144  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.620278  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  28.85 
 
 		 399 aa  144  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  26.4 
 
 		 448 aa  144  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2233  4-aminobutyrate aminotransferase  25.89 
 
 		 421 aa  143  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4744  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3005  4-aminobutyrate aminotransferase  28.47 
 
 		 429 aa  143  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742708  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5361  4-aminobutyrate aminotransferase  28.47 
 
 		 429 aa  143  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  26.96 
 
 		 385 aa  143  7e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  28.9 
 
 		 427 aa  143  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4909  4-aminobutyrate aminotransferase  28.24 
 
 		 427 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  27.8 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  27.46 
 
 		 399 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.716815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  27.14 
 
 		 398 aa  142  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3928  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase  28.47 
 
 		 427 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  29.13 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  28.61 
 
 		 431 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3786  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  28.19 
 
 		 411 aa  141  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.742991  hitchhiker  0.00618312 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  27.52 
 
 		 432 aa  142  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2545  4-aminobutyrate aminotransferase  26.74 
 
 		 421 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0029  ornithine aminotransferase  29.09 
 
 		 402 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.628841  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0429  4-aminobutyrate aminotransferase  27.45 
 
 		 433 aa  140  4.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.286831  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2210  acetylornithine transaminase  26.19 
 
 		 419 aa  140  7e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0245  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  26.08 
 
 		 405 aa  139  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.110716  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4167  4-aminobutyrate aminotransferase  27 
 
 		 434 aa  139  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130001  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3704  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  26.08 
 
 		 405 aa  139  7.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  28.03 
 
 		 399 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4582  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  27.6 
 
 		 405 aa  139  8.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4419  aminotransferase class-III  30.75 
 
 		 378 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2179  acetylornithine aminotransferase  25.23 
 
 		 398 aa  139  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.569965  normal  0.442274 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0047  4-aminobutyrate aminotransferase  29.14 
 
 		 425 aa  139  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  26.67 
 
 		 427 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  26.32 
 
 		 461 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3721  4-aminobutyrate aminotransferase  28.18 
 
 		 426 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  27.49 
 
 		 399 aa  138  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7694  4-aminobutyrate aminotransferase  28.47 
 
 		 426 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.788415  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2429  acetylornithine aminotransferase  25.23 
 
 		 398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3947  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  25.84 
 
 		 405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3002  acetylornithine aminotransferase  25.46 
 
 		 398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.555766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1916  Acetylornithine transaminase  27.27 
 
 		 417 aa  137  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4657  ornithine aminotransferase  29.15 
 
 		 417 aa  137  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1901  acetylornithine aminotransferase  26.11 
 
 		 400 aa  137  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133726  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  26.96 
 
 		 385 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  27.67 
 
 		 441 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  26.26 
 
 		 444 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  26.28 
 
 		 397 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1218  4-aminobutyrate aminotransferase  26.54 
 
 		 429 aa  136  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4711  4-aminobutyrate aminotransferase  26.9 
 
 		 446 aa  136  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3398  4-aminobutyrate aminotransferase  26.18 
 
 		 426 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0280  4-aminobutyrate aminotransferase  27.76 
 
 		 429 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.969383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  25.52 
 
 		 432 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  26.54 
 
 		 398 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  25.48 
 
 		 426 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.480055 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  26.7 
 
 		 427 aa  134  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3864  4-aminobutyrate aminotransferase  26.34 
 
 		 421 aa  135  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0197143 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  27.49 
 
 		 394 aa  135  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1464  aminotransferase class-III  28.77 
 
 		 448 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000155661  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>